197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3488 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  100 
 
 
295 aa  589  1e-167  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  74.15 
 
 
283 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  61.02 
 
 
286 aa  336  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  67.23 
 
 
313 aa  316  2e-85  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.42 
 
 
281 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  65.45 
 
 
305 aa  300  2e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  54.36 
 
 
294 aa  296  3e-79  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  59.38 
 
 
309 aa  294  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  50.68 
 
 
282 aa  294  1e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.15 
 
 
281 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  56.64 
 
 
293 aa  289  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  50 
 
 
281 aa  288  6e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  60 
 
 
315 aa  288  7e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  57.03 
 
 
281 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  55.76 
 
 
302 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  60.34 
 
 
310 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  57.42 
 
 
305 aa  278  5e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  53.85 
 
 
309 aa  278  5e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  53.44 
 
 
280 aa  278  8e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  49.32 
 
 
280 aa  277  1e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  58.9 
 
 
287 aa  274  2.0000000000000002e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  53.6 
 
 
281 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  54.55 
 
 
306 aa  271  9e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  53.82 
 
 
281 aa  268  8e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.82 
 
 
281 aa  268  8e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.82 
 
 
281 aa  268  8e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  53.82 
 
 
281 aa  268  8e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.82 
 
 
281 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  53.82 
 
 
281 aa  268  8.999999999999999e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  53.41 
 
 
281 aa  268  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  53.41 
 
 
281 aa  266  2e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  54.3 
 
 
291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  53.41 
 
 
281 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  50 
 
 
303 aa  266  5e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  58.12 
 
 
284 aa  265  7e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  54.17 
 
 
281 aa  265  7e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  48.82 
 
 
300 aa  262  6e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  57.94 
 
 
319 aa  261  6.999999999999999e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  53.6 
 
 
293 aa  260  2e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  46.08 
 
 
288 aa  259  3e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  48.24 
 
 
302 aa  250  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  53.82 
 
 
289 aa  246  4e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  46.26 
 
 
300 aa  244  9.999999999999999e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  47.2 
 
 
310 aa  238  6.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  44.37 
 
 
328 aa  238  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  41.52 
 
 
285 aa  229  3e-59  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  41.03 
 
 
285 aa  227  2e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  39.29 
 
 
352 aa  227  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.67 
 
 
281 aa  209  5e-53  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  41.45 
 
 
322 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  42.05 
 
 
322 aa  189  5e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  38.26 
 
 
322 aa  189  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  41.04 
 
 
284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  62.88 
 
 
132 aa  164  1.0000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  32.48 
 
 
361 aa  62.4  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  30.19 
 
 
251 aa  62.4  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.33 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  35.35 
 
 
356 aa  62.4  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  27.65 
 
 
252 aa  61.6  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  31.25 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  32.11 
 
 
363 aa  60.8  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.83 
 
 
270 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.78 
 
 
345 aa  59.3  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  26.74 
 
 
275 aa  58.9  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  27.05 
 
 
361 aa  57.8  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  28.28 
 
 
304 aa  57.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  29.53 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.18 
 
 
249 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  28.48 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  28.99 
 
 
298 aa  56.6  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  27.62 
 
 
295 aa  55.8  0.0000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2685  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.8 
 
 
261 aa  55.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238135  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  25.53 
 
 
256 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  26.55 
 
 
380 aa  55.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  27.19 
 
 
333 aa  54.7  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37859  predicted protein  29.81 
 
 
348 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370877  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  23.83 
 
 
307 aa  54.7  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1806  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.14 
 
 
256 aa  54.3  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  26.58 
 
 
267 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  25.77 
 
 
279 aa  53.9  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2191  band 7 protein  28.48 
 
 
266 aa  52.8  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  29.14 
 
 
257 aa  52.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  28.65 
 
 
306 aa  52.8  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.22 
 
 
257 aa  52.4  0.000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.14 
 
 
257 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.9 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.29 
 
 
265 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  26.9 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4389  band 7 protein  28.24 
 
 
253 aa  52  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  26.9 
 
 
257 aa  51.6  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  27.75 
 
 
376 aa  52.4  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1870  band 7 protein  26.26 
 
 
310 aa  51.6  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0180116 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  27.49 
 
 
257 aa  51.2  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  27.94 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  24.12 
 
 
384 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  27.56 
 
 
435 aa  50.8  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  23.65 
 
 
268 aa  50.8  0.00003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  26.99 
 
 
247 aa  50.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0841  band 7 protein  25.14 
 
 
399 aa  50.4  0.00004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  24.19 
 
 
322 aa  50.1  0.00005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>