91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2874 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  100 
 
 
281 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  70.32 
 
 
282 aa  413  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  67.97 
 
 
281 aa  373  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  62.3 
 
 
293 aa  322  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  53.85 
 
 
303 aa  301  6.000000000000001e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  53.02 
 
 
281 aa  301  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  51.43 
 
 
280 aa  297  1e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  62.28 
 
 
305 aa  296  3e-79  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  54.77 
 
 
284 aa  294  9e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  52.05 
 
 
294 aa  294  1e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  58.8 
 
 
289 aa  293  2e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  58.44 
 
 
283 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  53.42 
 
 
302 aa  291  6e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  59.48 
 
 
313 aa  289  3e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  58.62 
 
 
281 aa  289  4e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  58.2 
 
 
315 aa  288  6e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  60.17 
 
 
287 aa  288  7e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  51.59 
 
 
291 aa  288  1e-76  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  55.87 
 
 
293 aa  283  3.0000000000000004e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  49.12 
 
 
309 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  52.99 
 
 
310 aa  279  5e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  54.42 
 
 
295 aa  278  9e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  55.33 
 
 
280 aa  277  2e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  57.63 
 
 
302 aa  276  2e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  50.17 
 
 
286 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  49.11 
 
 
281 aa  276  3e-73  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  48.63 
 
 
300 aa  276  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  60.17 
 
 
305 aa  275  5e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  47.93 
 
 
300 aa  275  5e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  50.18 
 
 
281 aa  275  7e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  50.18 
 
 
281 aa  274  1.0000000000000001e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  54.07 
 
 
281 aa  273  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  57.58 
 
 
310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  48.4 
 
 
281 aa  273  3e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.07 
 
 
281 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.07 
 
 
281 aa  273  3e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  54.07 
 
 
281 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  54.07 
 
 
281 aa  273  3e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.07 
 
 
281 aa  273  3e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  54.07 
 
 
281 aa  272  4.0000000000000004e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  56.68 
 
 
309 aa  270  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  45.09 
 
 
328 aa  265  5e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  44.83 
 
 
288 aa  265  5e-70  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  52.76 
 
 
306 aa  265  5.999999999999999e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  55.87 
 
 
319 aa  254  9e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  42.11 
 
 
352 aa  248  9e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  42.96 
 
 
285 aa  230  2e-59  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  42.86 
 
 
285 aa  224  2e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.67 
 
 
281 aa  207  1e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  43.08 
 
 
322 aa  191  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  42.06 
 
 
322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  42.06 
 
 
322 aa  189  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  66.67 
 
 
132 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  36.73 
 
 
284 aa  148  1.0000000000000001e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  26.16 
 
 
333 aa  58.2  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1870  band 7 protein  26.94 
 
 
310 aa  54.3  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0180116 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  25.82 
 
 
380 aa  52.4  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  24.77 
 
 
361 aa  50.4  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  26.37 
 
 
359 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0496  band 7 protein  24.61 
 
 
282 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0512  band 7 protein  24.61 
 
 
282 aa  49.3  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000338316 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  24.38 
 
 
279 aa  48.9  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.32 
 
 
345 aa  48.9  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  28.32 
 
 
393 aa  48.9  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1659  hypothetical protein  29.38 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  24.59 
 
 
298 aa  48.5  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  26.85 
 
 
363 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.19 
 
 
270 aa  48.1  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  24.41 
 
 
307 aa  47.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  25.26 
 
 
347 aa  47.4  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  22.83 
 
 
384 aa  47.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2388  band 7 protein  26.23 
 
 
323 aa  46.6  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.791124  normal  0.159576 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  25.13 
 
 
399 aa  46.2  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2641  band 7 protein  26.24 
 
 
409 aa  46.2  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  24.78 
 
 
381 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  23.2 
 
 
306 aa  45.4  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  26.7 
 
 
435 aa  45.4  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  27.22 
 
 
456 aa  44.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  29.49 
 
 
370 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02100  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  26.98 
 
 
330 aa  44.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  22.58 
 
 
258 aa  44.3  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  23.04 
 
 
376 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1089  HflK protein  24.88 
 
 
386 aa  43.5  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  24.48 
 
 
445 aa  43.1  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  22.76 
 
 
344 aa  42.7  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  24.3 
 
 
386 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  27.56 
 
 
474 aa  42.7  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  25.73 
 
 
389 aa  42.7  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3397  band 7 protein  22.92 
 
 
279 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.149189 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  26.04 
 
 
429 aa  42.4  0.01  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  22.17 
 
 
261 aa  42  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>