58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_3312 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  100 
 
 
322 aa  638    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  92.55 
 
 
322 aa  598  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  94.41 
 
 
322 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  42.86 
 
 
309 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  40.13 
 
 
303 aa  214  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  41 
 
 
281 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  37.66 
 
 
291 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  46.85 
 
 
313 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  39.17 
 
 
284 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  35.82 
 
 
328 aa  207  3e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  39.87 
 
 
294 aa  206  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  46.43 
 
 
310 aa  204  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  39.74 
 
 
302 aa  204  2e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  42.61 
 
 
305 aa  204  2e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  37.79 
 
 
280 aa  204  2e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  41.22 
 
 
315 aa  202  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  43.55 
 
 
305 aa  202  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  41.85 
 
 
281 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  41.25 
 
 
280 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  45 
 
 
319 aa  200  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  43.02 
 
 
302 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  35.28 
 
 
352 aa  199  7e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  37.46 
 
 
281 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  40.27 
 
 
282 aa  196  5.000000000000001e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  39.93 
 
 
281 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  39.1 
 
 
309 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  43.19 
 
 
289 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  43.41 
 
 
293 aa  194  2e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  40.62 
 
 
281 aa  193  3e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  40.07 
 
 
281 aa  193  4e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.62 
 
 
281 aa  192  5e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.62 
 
 
281 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.62 
 
 
281 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  40.62 
 
 
281 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  40.62 
 
 
281 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  40.49 
 
 
293 aa  192  5e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  39.7 
 
 
300 aa  192  6e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  40.23 
 
 
281 aa  192  8e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  41.27 
 
 
287 aa  191  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.08 
 
 
281 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  38.41 
 
 
310 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  41.39 
 
 
306 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  40.23 
 
 
281 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.39 
 
 
281 aa  188  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  41.31 
 
 
283 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  37.25 
 
 
300 aa  185  9e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  35.05 
 
 
288 aa  180  2.9999999999999997e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  32.57 
 
 
285 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  34.16 
 
 
285 aa  173  3.9999999999999995e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  39.84 
 
 
286 aa  172  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.11 
 
 
281 aa  171  2e-41  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  42.05 
 
 
295 aa  169  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  33.33 
 
 
284 aa  138  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  38.31 
 
 
132 aa  92  1e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  26.49 
 
 
382 aa  45.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  26.49 
 
 
384 aa  45.8  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  29.06 
 
 
361 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  23.61 
 
 
279 aa  43.9  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>