111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1211 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  100 
 
 		 305 aa  608  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  72.59 
 
 		 313 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  64.15 
 
 		 315 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  62.42 
 
 		 302 aa  359  4e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  70.87 
 
 		 309 aa  356  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  70.04 
 
 		 309 aa  340  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  58.94 
 
 		 293 aa  321  9.000000000000001e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  66.81 
 
 		 283 aa  318  6e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  58.98 
 
 		 281 aa  317  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  62.56 
 
 		 305 aa  307  2.0000000000000002e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  57.8 
 
 		 294 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  64.76 
 
 		 286 aa  302  6.000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  57.72 
 
 		 282 aa  300  2e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  65.45 
 
 		 295 aa  298  9e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  50.88 
 
 		 291 aa  294  1e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  51.56 
 
 		 281 aa  293  2e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  60.17 
 
 		 281 aa  293  3e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  61.64 
 
 		 310 aa  292  5e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  52.55 
 
 		 281 aa  291  7e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  54.61 
 
 		 303 aa  291  1e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  48.96 
 
 		 280 aa  288  6e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  54.51 
 
 		 280 aa  286  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  59.76 
 
 		 319 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  52.71 
 
 		 281 aa  284  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  50.86 
 
 		 284 aa  283  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  51.26 
 
 		 281 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  55.56 
 
 		 281 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  55.56 
 
 		 281 aa  280  2e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  55.56 
 
 		 281 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  55.82 
 
 		 281 aa  280  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  55.42 
 
 		 281 aa  280  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  55.82 
 
 		 281 aa  280  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  55.82 
 
 		 281 aa  279  4e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  54.37 
 
 		 306 aa  278  6e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  55.42 
 
 		 281 aa  278  8e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  51.45 
 
 		 310 aa  278  8e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  56.4 
 
 		 289 aa  278  9e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  55.42 
 
 		 281 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  57.63 
 
 		 287 aa  275  5e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  48.23 
 
 		 328 aa  273  3e-72  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  50.73 
 
 		 302 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  53.66 
 
 		 293 aa  266  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  52.85 
 
 		 300 aa  266  2.9999999999999995e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  46.04 
 
 		 288 aa  258  1e-67  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  50.92 
 
 		 300 aa  256  3e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  37.46 
 
 		 352 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  40.89 
 
 		 285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  40.51 
 
 		 285 aa  212  5.999999999999999e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  42.71 
 
 		 322 aa  208  8e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.1 
 
 		 281 aa  208  1e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  43.7 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  44.28 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  65.15 
 
 		 132 aa  177  3e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  38.66 
 
 		 284 aa  175  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  26.4 
 
 		 278 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  26.9 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  26.9 
 
 		 259 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  27.18 
 
 		 279 aa  53.1  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.65 
 
 		 312 aa  52.8  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  28.26 
 
 		 332 aa  52.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.41 
 
 		 259 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  26.37 
 
 		 361 aa  52  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  26.53 
 
 		 361 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  28.09 
 
 		 306 aa  49.7  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  28.33 
 
 		 336 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.32 
 
 		 311 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  27.17 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1784  band 7 protein  28.79 
 
 		 276 aa  47  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1815  band 7 protein  27.43 
 
 		 254 aa  47  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.142899 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  27.56 
 
 		 304 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  22.27 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  30 
 
 		 471 aa  46.2  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  31.5 
 
 		 393 aa  46.2  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  23.81 
 
 		 356 aa  46.6  0.0006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7190  membrane protease  28.51 
 
 		 367 aa  45.8  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.996167  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  26.6 
 
 		 369 aa  45.8  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  26.54 
 
 		 381 aa  45.8  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  28.8 
 
 		 386 aa  45.8  0.0009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.3 
 
 		 270 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  28.99 
 
 		 435 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  27.93 
 
 		 326 aa  45.4  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  28.04 
 
 		 248 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4389  band 7 protein  25.26 
 
 		 253 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  29.93 
 
 		 368 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  25.57 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1659  hypothetical protein  29.79 
 
 		 262 aa  45.1  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  27.21 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  30.71 
 
 		 414 aa  44.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  27.56 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.55 
 
 		 309 aa  43.9  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.98 
 
 		 334 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  25.88 
 
 		 331 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  26.47 
 
 		 249 aa  43.5  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.38 
 
 		 314 aa  43.5  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  30.15 
 
 		 333 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  31.17 
 
 		 474 aa  43.1  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  25.43 
 
 		 268 aa  43.1  0.005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  25.9 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  24.88 
 
 		 251 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  26.52 
 
 		 307 aa  43.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.944398 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>