158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3863 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  100 
 
 		 306 aa  607  9.999999999999999e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  61.78 
 
 		 310 aa  347  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  59.32 
 
 		 319 aa  332  7.000000000000001e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  59.83 
 
 		 309 aa  283  4.0000000000000003e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  56.05 
 
 		 283 aa  282  5.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  52.71 
 
 		 315 aa  280  2e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  59.13 
 
 		 302 aa  279  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  48.47 
 
 		 281 aa  278  1e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  52.63 
 
 		 305 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  52.23 
 
 		 286 aa  277  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  56.65 
 
 		 313 aa  276  3e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  49.29 
 
 		 281 aa  272  6e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  56.33 
 
 		 309 aa  271  1e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  46.42 
 
 		 280 aa  271  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.82 
 
 		 281 aa  270  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  58.26 
 
 		 305 aa  268  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  50.4 
 
 		 281 aa  266  2e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  47.69 
 
 		 282 aa  267  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.4 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.4 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.4 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  50.4 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  50.4 
 
 		 281 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  50 
 
 		 281 aa  266  4e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  50.4 
 
 		 281 aa  266  4e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  47.5 
 
 		 281 aa  265  5.999999999999999e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  50 
 
 		 281 aa  264  1e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  46.84 
 
 		 294 aa  264  2e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.25 
 
 		 281 aa  263  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  50.2 
 
 		 280 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  51.45 
 
 		 281 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  53.88 
 
 		 293 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  45.42 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  48.21 
 
 		 291 aa  256  5e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  54.55 
 
 		 295 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  53.22 
 
 		 284 aa  253  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  46.33 
 
 		 302 aa  251  9.000000000000001e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  51 
 
 		 293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  48.59 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  41.72 
 
 		 352 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  41.3 
 
 		 288 aa  238  1e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  48.94 
 
 		 287 aa  236  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  50.4 
 
 		 289 aa  232  5e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  45.76 
 
 		 310 aa  232  5e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  45.82 
 
 		 300 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  41.61 
 
 		 328 aa  224  1e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.11 
 
 		 281 aa  203  3e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  39.42 
 
 		 285 aa  196  3e-49  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  39 
 
 		 285 aa  194  1e-48  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  40.66 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  37.29 
 
 		 322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  38.6 
 
 		 322 aa  186  3e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  39.51 
 
 		 284 aa  165  6.9999999999999995e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  58.65 
 
 		 132 aa  152  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  31.61 
 
 		 279 aa  71.2  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  30 
 
 		 318 aa  57  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  26.67 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  29.92 
 
 		 318 aa  54.7  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6548  band 7 protein  32.84 
 
 		 326 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  24.51 
 
 		 361 aa  53.5  0.000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25 
 
 		 312 aa  53.1  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  28.1 
 
 		 304 aa  52.8  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0544  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.14 
 
 		 290 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1884  band 7 protein  31.01 
 
 		 305 aa  52.4  0.000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0366362 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  24.77 
 
 		 381 aa  52.4  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.27 
 
 		 286 aa  51.2  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  27.59 
 
 		 303 aa  50.8  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  25.45 
 
 		 307 aa  51.2  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4181  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.73 
 
 		 269 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.967013 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  25.64 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  31.71 
 
 		 304 aa  50.8  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  25.64 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  25.64 
 
 		 304 aa  50.4  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  27.27 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  25 
 
 		 356 aa  50.4  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5310  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.17 
 
 		 311 aa  50.4  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0621487  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.34 
 
 		 334 aa  50.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2033  band 7 protein  24.17 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.295777  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  25.76 
 
 		 301 aa  50.1  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1902  band 7 protein  24.17 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.67 
 
 		 345 aa  49.3  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1276  band 7 protein  24.17 
 
 		 317 aa  49.7  0.00007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.887258 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1034  band 7 protein  31.25 
 
 		 307 aa  49.3  0.00008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.679836  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1713  band 7 protein  29.03 
 
 		 290 aa  49.3  0.00009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  24.87 
 
 		 336 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2375  band 7 protein  27.05 
 
 		 334 aa  48.9  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  normal  0.805333 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.17 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.32562  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3024  band 7 protein  30.91 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2559  membrane protein GNA1220  24.17 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.17 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1659  hypothetical protein  23.83 
 
 		 262 aa  48.1  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_37859  predicted protein  23.5 
 
 		 348 aa  47.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.370877  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.89 
 
 		 304 aa  47.8  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0608  band 7 protein  25.9 
 
 		 286 aa  48.1  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2033  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.17 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.30035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3279  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.17 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.571401  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.17 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.764976  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2468  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.17 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1304  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.17 
 
 		 315 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.26064  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5594  band 7 protein  27.54 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>