71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3657 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  100 
 
 
287 aa  578  1e-164  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  65.17 
 
 
284 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  61.51 
 
 
291 aa  359  3e-98  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  57.04 
 
 
303 aa  308  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  53.85 
 
 
281 aa  308  8e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  58.17 
 
 
281 aa  303  2.0000000000000002e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  53.95 
 
 
282 aa  303  3.0000000000000004e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.9 
 
 
281 aa  301  8.000000000000001e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  51.72 
 
 
302 aa  292  4e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  52.26 
 
 
310 aa  292  5e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  58.47 
 
 
313 aa  290  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  47.06 
 
 
328 aa  289  3e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  59.23 
 
 
305 aa  289  4e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  58.87 
 
 
289 aa  288  7e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  51.03 
 
 
300 aa  282  5.000000000000001e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  51.04 
 
 
309 aa  279  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  53.65 
 
 
315 aa  278  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  55.95 
 
 
293 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  57.85 
 
 
283 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  51.28 
 
 
281 aa  276  2e-73  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  52.4 
 
 
305 aa  276  3e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  53.78 
 
 
293 aa  276  4e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  50.86 
 
 
302 aa  275  5e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  48.36 
 
 
309 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  49.83 
 
 
300 aa  272  5.000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  50 
 
 
280 aa  270  1e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  48.6 
 
 
281 aa  267  1e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  50.17 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  48.95 
 
 
281 aa  265  8.999999999999999e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  52.21 
 
 
281 aa  263  3e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  51.75 
 
 
281 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  52.21 
 
 
281 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.36 
 
 
281 aa  262  6e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  51.36 
 
 
281 aa  262  6e-69  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.78 
 
 
281 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.78 
 
 
281 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  51.78 
 
 
281 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  52.21 
 
 
281 aa  261  8.999999999999999e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  54.94 
 
 
286 aa  259  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  52.4 
 
 
280 aa  258  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  53.81 
 
 
310 aa  253  2.0000000000000002e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  57.92 
 
 
295 aa  253  3e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  44.83 
 
 
288 aa  249  5e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  48.8 
 
 
306 aa  243  3e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  41 
 
 
352 aa  243  3e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  50.79 
 
 
319 aa  237  1e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  43.4 
 
 
285 aa  218  1e-55  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  41.81 
 
 
285 aa  214  9.999999999999999e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.83 
 
 
281 aa  207  2e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  38.31 
 
 
322 aa  202  7e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  41 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  40.07 
 
 
322 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  39.84 
 
 
284 aa  165  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  58.39 
 
 
132 aa  164  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  27.04 
 
 
333 aa  57.4  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  25.64 
 
 
279 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  33.66 
 
 
361 aa  50.8  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  32.04 
 
 
356 aa  49.7  0.00006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  30.56 
 
 
363 aa  48.9  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  23.5 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  26.98 
 
 
307 aa  47.4  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  30.69 
 
 
361 aa  46.6  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22550  band 7 protein  24.02 
 
 
330 aa  46.2  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  23.66 
 
 
384 aa  46.2  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  26.71 
 
 
386 aa  44.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.25 
 
 
270 aa  44.3  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2641  band 7 protein  22.93 
 
 
409 aa  43.5  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  25.51 
 
 
274 aa  43.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  26.92 
 
 
261 aa  42.7  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  25.43 
 
 
380 aa  42.7  0.007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  28.33 
 
 
265 aa  42.4  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>