81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0217 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  100 
 
 
300 aa  610  9.999999999999999e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  69.28 
 
 
302 aa  412  1e-114  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  66.33 
 
 
300 aa  397  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  61.79 
 
 
293 aa  313  1.9999999999999998e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  53.72 
 
 
303 aa  308  8e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.63 
 
 
281 aa  276  3e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  54.89 
 
 
310 aa  275  7e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  50 
 
 
281 aa  275  8e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  47.59 
 
 
282 aa  273  2.0000000000000002e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  47.93 
 
 
281 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  57.94 
 
 
313 aa  271  9e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  58.47 
 
 
287 aa  271  1e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  56.58 
 
 
305 aa  271  1e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.85 
 
 
281 aa  269  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  49.13 
 
 
309 aa  265  5e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  51.02 
 
 
280 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  57.51 
 
 
315 aa  262  4e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  47.28 
 
 
294 aa  261  1e-68  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  45.85 
 
 
328 aa  260  2e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  46.93 
 
 
280 aa  260  2e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  47.96 
 
 
293 aa  260  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  56.65 
 
 
284 aa  259  3e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  54.39 
 
 
283 aa  259  4e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  56.3 
 
 
309 aa  259  4e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  55.93 
 
 
289 aa  258  8e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  44.64 
 
 
281 aa  257  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  45.79 
 
 
281 aa  256  5e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  47.22 
 
 
291 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  52.85 
 
 
305 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  48.39 
 
 
281 aa  250  2e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  52.97 
 
 
302 aa  249  3e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  48.39 
 
 
281 aa  249  5e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  47.98 
 
 
281 aa  249  5e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  47.98 
 
 
281 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  47.98 
 
 
281 aa  248  7e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.98 
 
 
281 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.98 
 
 
281 aa  248  7e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.98 
 
 
281 aa  248  7e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  47.98 
 
 
281 aa  248  9e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  52.19 
 
 
286 aa  241  9e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  54.73 
 
 
295 aa  241  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  48.59 
 
 
306 aa  240  2e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  42.96 
 
 
288 aa  239  2.9999999999999997e-62  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  48.45 
 
 
310 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  37.05 
 
 
352 aa  226  4e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  50.63 
 
 
319 aa  224  1e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  39.64 
 
 
285 aa  223  3e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.22 
 
 
281 aa  215  7e-55  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  39.48 
 
 
285 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  39.7 
 
 
322 aa  192  4e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  38.95 
 
 
322 aa  191  1e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  36.69 
 
 
322 aa  191  1e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  59.85 
 
 
132 aa  158  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  37.3 
 
 
284 aa  146  5e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  26.3 
 
 
284 aa  54.7  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  24.19 
 
 
385 aa  49.7  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  30.51 
 
 
344 aa  48.9  0.0001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  31.01 
 
 
370 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  25.93 
 
 
383 aa  48.1  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  28.81 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  25.41 
 
 
362 aa  47.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2852  band 7 protein  26.23 
 
 
284 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0924  HflK protein  27.98 
 
 
380 aa  47  0.0003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  25.93 
 
 
384 aa  47.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0253  band 7 protein  20.08 
 
 
310 aa  47  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  23.66 
 
 
278 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  32.03 
 
 
399 aa  46.2  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  40.82 
 
 
379 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5029  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.290689  normal  0.430447 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  25.12 
 
 
333 aa  44.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  25.93 
 
 
382 aa  43.9  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  26.47 
 
 
361 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4422  band 7 protein  25.13 
 
 
307 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0850578 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  23.66 
 
 
361 aa  43.5  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4401  band 7 protein  24.86 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4464  band 7 protein  24.86 
 
 
268 aa  43.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0054233  normal  0.226289 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  23.35 
 
 
380 aa  43.1  0.006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  26.26 
 
 
356 aa  43.1  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.56 
 
 
345 aa  42.7  0.008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  25.62 
 
 
498 aa  42.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1813  band 7 protein  23.86 
 
 
263 aa  42.4  0.01  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>