59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3117 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  100 
 
 
322 aa  641    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  97.83 
 
 
322 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  92.55 
 
 
322 aa  577  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  40.32 
 
 
303 aa  223  3e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  37.09 
 
 
328 aa  213  2.9999999999999995e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  41.14 
 
 
281 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  38.31 
 
 
291 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  38.56 
 
 
280 aa  209  5e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  46.85 
 
 
313 aa  209  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  38.02 
 
 
284 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  39.03 
 
 
294 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  42.55 
 
 
281 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  43.94 
 
 
319 aa  206  4e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  40.46 
 
 
302 aa  203  3e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  39.41 
 
 
281 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  40 
 
 
309 aa  202  7e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  39.74 
 
 
281 aa  202  7e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  43.55 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  41.76 
 
 
315 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  39.85 
 
 
280 aa  200  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  42.03 
 
 
305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  45.24 
 
 
310 aa  199  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  43.19 
 
 
302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  41.26 
 
 
289 aa  196  3e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  37.7 
 
 
300 aa  196  5.000000000000001e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  40.99 
 
 
293 aa  196  6e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  40.07 
 
 
310 aa  194  2e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  40.53 
 
 
281 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  40.53 
 
 
281 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.53 
 
 
281 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.53 
 
 
281 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  40.53 
 
 
281 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.53 
 
 
281 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  40.53 
 
 
281 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  40.15 
 
 
281 aa  192  4e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  33.33 
 
 
352 aa  193  4e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  41.2 
 
 
293 aa  193  4e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  40.15 
 
 
281 aa  191  1e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  36.69 
 
 
300 aa  191  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.55 
 
 
281 aa  191  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  40.93 
 
 
309 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  38.1 
 
 
282 aa  189  5e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.06 
 
 
281 aa  189  7e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  39.7 
 
 
287 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  40.74 
 
 
283 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  37.87 
 
 
306 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  35.37 
 
 
288 aa  182  8.000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  32.03 
 
 
285 aa  179  5.999999999999999e-44  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  31.91 
 
 
285 aa  177  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.85 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  39.84 
 
 
286 aa  172  5.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  41.09 
 
 
295 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  32.55 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  37.25 
 
 
132 aa  90.9  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  26.29 
 
 
279 aa  49.3  0.00008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  26 
 
 
384 aa  45.1  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  26 
 
 
382 aa  44.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  24.83 
 
 
306 aa  43.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  27.34 
 
 
361 aa  42.7  0.008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>