182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_4139 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  100 
 
 
284 aa  578  1e-164  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  40.33 
 
 
315 aa  170  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  37.92 
 
 
305 aa  168  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  40.09 
 
 
313 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  42.04 
 
 
294 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  39.92 
 
 
283 aa  166  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  38.56 
 
 
302 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  38.91 
 
 
309 aa  165  8e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  39.51 
 
 
306 aa  164  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  39.74 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.5 
 
 
281 aa  160  3e-38  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  37.05 
 
 
293 aa  159  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  39.39 
 
 
287 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  37.7 
 
 
288 aa  159  6e-38  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  39.41 
 
 
328 aa  158  1e-37  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  41.04 
 
 
295 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  38.19 
 
 
282 aa  156  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  39.91 
 
 
305 aa  155  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  39.21 
 
 
310 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  36.03 
 
 
310 aa  154  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  36.69 
 
 
281 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  39.38 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  37.66 
 
 
281 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  37.24 
 
 
281 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.24 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.24 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.24 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  37.24 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  37.24 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  37.66 
 
 
281 aa  152  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  36.84 
 
 
281 aa  152  7e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  37.55 
 
 
293 aa  152  7e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  37.24 
 
 
281 aa  152  8e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  38.34 
 
 
289 aa  151  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  39.01 
 
 
286 aa  150  2e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  36.73 
 
 
281 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  36.84 
 
 
291 aa  150  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  37.45 
 
 
284 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.73 
 
 
281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  36.65 
 
 
319 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  36.71 
 
 
280 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  35.47 
 
 
281 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  38.96 
 
 
300 aa  146  3e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  37.3 
 
 
300 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  37.14 
 
 
302 aa  144  1e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  31.62 
 
 
352 aa  143  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  35.32 
 
 
280 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  33.33 
 
 
322 aa  138  1e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  33.33 
 
 
322 aa  137  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.8 
 
 
281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  32.55 
 
 
322 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  35.53 
 
 
285 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  34.68 
 
 
285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  40.94 
 
 
132 aa  90.5  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  25.82 
 
 
384 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.81 
 
 
270 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.33 
 
 
309 aa  55.8  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  24.89 
 
 
261 aa  55.1  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  25.11 
 
 
356 aa  54.7  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  28.97 
 
 
361 aa  53.9  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  25.27 
 
 
318 aa  53.1  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  26.47 
 
 
356 aa  52.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  25.27 
 
 
318 aa  52.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  27.19 
 
 
380 aa  52.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1740  SPFH domain, Band 7 family protein  24.05 
 
 
256 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0109204 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1815  band 7 protein  25.67 
 
 
254 aa  51.6  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.142899 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1741  SPFH domain, Band 7 family protein  23.46 
 
 
291 aa  51.2  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.011683 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  29.29 
 
 
304 aa  50.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  31.13 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  33.01 
 
 
278 aa  50.8  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0620  band 7 protein  23.39 
 
 
261 aa  51.2  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0841  band 7 protein  25.66 
 
 
399 aa  50.8  0.00003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  27.59 
 
 
363 aa  50.4  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  24.49 
 
 
327 aa  50.8  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  30.19 
 
 
252 aa  50.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.59 
 
 
259 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  25.79 
 
 
248 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  27.59 
 
 
259 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  27.59 
 
 
259 aa  49.7  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2559  band 7 protein  32.53 
 
 
285 aa  49.7  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166484 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  25.14 
 
 
333 aa  48.9  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0544  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.68 
 
 
290 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048283  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3071  band 7 protein  20.96 
 
 
314 aa  48.9  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0976397  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1484  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.07 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.762715  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1506  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.07 
 
 
296 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  22.9 
 
 
386 aa  48.9  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  21.36 
 
 
311 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  26.84 
 
 
274 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  25.53 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  26.03 
 
 
267 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  26.54 
 
 
265 aa  47.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0139  band 7 protein  31.19 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.889576  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2800  band 7 protein  25.22 
 
 
392 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.07 
 
 
310 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3533  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.54 
 
 
316 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1446  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.72 
 
 
305 aa  47  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0162555  normal  0.124024 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2048  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  20.87 
 
 
315 aa  47  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.010338  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  24.86 
 
 
307 aa  46.6  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  29.76 
 
 
308 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1878  band 7 protein  24.55 
 
 
311 aa  46.6  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.292524  normal  0.0408488 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>