95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6391 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  100 
 
 
284 aa  573  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  64.73 
 
 
287 aa  361  7.0000000000000005e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  57.24 
 
 
291 aa  335  5.999999999999999e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  57.09 
 
 
303 aa  317  1e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  54.36 
 
 
282 aa  310  2e-83  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  53.61 
 
 
302 aa  298  6e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  54.77 
 
 
281 aa  298  8e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  51.94 
 
 
280 aa  293  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  61.11 
 
 
289 aa  291  6e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  60.68 
 
 
313 aa  291  9e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.45 
 
 
281 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  52.88 
 
 
293 aa  289  4e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  50 
 
 
281 aa  285  8e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  56.85 
 
 
293 aa  282  4.0000000000000003e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  45.2 
 
 
328 aa  282  5.000000000000001e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  51.86 
 
 
294 aa  281  6.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  52.88 
 
 
310 aa  281  7.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  55.6 
 
 
315 aa  280  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  51.37 
 
 
305 aa  279  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  59.13 
 
 
305 aa  278  6e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  50.74 
 
 
281 aa  278  7e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  52.19 
 
 
302 aa  274  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  49.66 
 
 
300 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  49.12 
 
 
280 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  47.93 
 
 
309 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  47.24 
 
 
281 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  57.02 
 
 
283 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  51.55 
 
 
300 aa  265  8.999999999999999e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  46.15 
 
 
281 aa  262  4.999999999999999e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  54.47 
 
 
309 aa  261  8e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  51.64 
 
 
281 aa  261  1e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  51.64 
 
 
281 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  51.64 
 
 
281 aa  261  1e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.23 
 
 
281 aa  260  2e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  51.23 
 
 
281 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  51.23 
 
 
281 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.23 
 
 
281 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.23 
 
 
281 aa  260  2e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  42.77 
 
 
352 aa  259  4e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  46.34 
 
 
288 aa  259  4e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  51.23 
 
 
281 aa  259  5.0000000000000005e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  52.4 
 
 
306 aa  258  9e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  54.55 
 
 
286 aa  255  5e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  55.24 
 
 
319 aa  255  8e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  56.84 
 
 
310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  55.04 
 
 
295 aa  252  6e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  38.02 
 
 
322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  37.46 
 
 
322 aa  215  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  39.49 
 
 
322 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  43.62 
 
 
285 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  45.11 
 
 
281 aa  212  7e-54  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  43.01 
 
 
285 aa  211  7.999999999999999e-54  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  63.43 
 
 
132 aa  169  3e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  37.6 
 
 
284 aa  153  4e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  28.5 
 
 
384 aa  62.4  0.000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  24.65 
 
 
295 aa  61.2  0.00000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  22.94 
 
 
361 aa  57  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0841  band 7 protein  27.32 
 
 
399 aa  54.3  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.2 
 
 
345 aa  53.9  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2800  band 7 protein  26.8 
 
 
392 aa  53.5  0.000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  29.7 
 
 
356 aa  52.8  0.000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  25.12 
 
 
376 aa  52.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  25.84 
 
 
381 aa  52.4  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2641  band 7 protein  25 
 
 
409 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  24.61 
 
 
279 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  24.76 
 
 
278 aa  50.8  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  24.49 
 
 
386 aa  49.3  0.00008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  24.73 
 
 
259 aa  47.8  0.0002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  24.87 
 
 
380 aa  47.8  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  21.61 
 
 
333 aa  47.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  23.98 
 
 
403 aa  46.6  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  26.82 
 
 
304 aa  47  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  26.36 
 
 
363 aa  47  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0654  band 7 protein  25.52 
 
 
311 aa  46.6  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.317674  normal  0.0372256 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  26.98 
 
 
384 aa  46.6  0.0005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.11 
 
 
270 aa  45.8  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33080  hypothetical protein  26.18 
 
 
337 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000208318  hitchhiker  0.00231515 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  25.54 
 
 
274 aa  44.7  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2814  hypothetical protein  25.4 
 
 
339 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  22.61 
 
 
310 aa  43.9  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  26.82 
 
 
304 aa  44.3  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5083  Band 7 protein  26.37 
 
 
345 aa  43.9  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.55 
 
 
304 aa  43.9  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  25.79 
 
 
383 aa  43.9  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5669  Band 7 protein  26.02 
 
 
348 aa  43.5  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.324788 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2664  protease subunit HflC  21.89 
 
 
291 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5534  SPFH domain / Band 7 family protein  26.37 
 
 
345 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  24.38 
 
 
249 aa  43.1  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  20.85 
 
 
309 aa  43.1  0.005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  22.6 
 
 
275 aa  42.7  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  24.1 
 
 
251 aa  43.1  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  25.93 
 
 
382 aa  43.1  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  23.79 
 
 
301 aa  42.7  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  24.76 
 
 
376 aa  42.4  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3473  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.67 
 
 
264 aa  42  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00917354 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>