More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2406 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  100 
 
 		 333 aa  667    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02100  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  63.03 
 
 		 330 aa  396  1e-109  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2375  band 7 protein  58.4 
 
 		 334 aa  310  2e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  normal  0.805333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2454  band 7 protein  50.31 
 
 		 307 aa  305  8.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2388  band 7 protein  50.88 
 
 		 323 aa  275  5e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.791124  normal  0.159576 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1870  band 7 protein  46.34 
 
 		 310 aa  274  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0180116 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0654  band 7 protein  49.47 
 
 		 311 aa  266  2.9999999999999995e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.317674  normal  0.0372256 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03070  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  43.27 
 
 		 313 aa  233  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  44.49 
 
 		 298 aa  229  4e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  43.97 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1659  hypothetical protein  44.44 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  42.37 
 
 		 279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3885  band 7 protein  38.46 
 
 		 290 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2166  band 7 protein  42.74 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5265  band 7 protein  39.11 
 
 		 290 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5594  band 7 protein  39.11 
 
 		 290 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1713  band 7 protein  39.5 
 
 		 290 aa  195  9e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0544  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.5 
 
 		 290 aa  192  7e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1784  band 7 protein  36.74 
 
 		 276 aa  172  5.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  36.32 
 
 		 290 aa  159  6e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  35.4 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  36.04 
 
 		 281 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  35.59 
 
 		 281 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  34.33 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3473  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.07 
 
 		 264 aa  143  4e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00917354 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  32.16 
 
 		 265 aa  143  5e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  33.18 
 
 		 265 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  31.82 
 
 		 259 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  33.49 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.88 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  32.88 
 
 		 267 aa  138  1e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  31.51 
 
 		 249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  30.6 
 
 		 295 aa  136  4e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.42 
 
 		 267 aa  136  4e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  36.63 
 
 		 315 aa  137  4e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.87 
 
 		 270 aa  135  9e-31  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.48 
 
 		 270 aa  135  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1815  band 7 protein  34.75 
 
 		 254 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.142899 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  35.06 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.28 
 
 		 278 aa  134  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  31.42 
 
 		 258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  31.6 
 
 		 259 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  31.6 
 
 		 259 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.19 
 
 		 259 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0067  band 7 protein  32.13 
 
 		 270 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.17 
 
 		 252 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.03 
 
 		 257 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3381  band 7 protein  31.28 
 
 		 252 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.4 
 
 		 265 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1741  SPFH domain, Band 7 family protein  31.08 
 
 		 291 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.011683 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  29.29 
 
 		 278 aa  129  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  34.07 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.07 
 
 		 248 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.58 
 
 		 261 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  29.13 
 
 		 274 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  30.24 
 
 		 248 aa  126  6e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  30.73 
 
 		 253 aa  126  6e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  29.61 
 
 		 255 aa  126  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.42 
 
 		 257 aa  126  7e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2412  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.33 
 
 		 270 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163549  hitchhiker  0.00593532 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  29.15 
 
 		 256 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0620  band 7 protein  34.07 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4950  band 7 protein  31.96 
 
 		 278 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493211  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  33.94 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0802  putative stomatin-like transmembrane protein  30.58 
 
 		 249 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  29.24 
 
 		 284 aa  123  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.08 
 
 		 249 aa  123  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  29.2 
 
 		 252 aa  123  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  33.94 
 
 		 251 aa  123  5e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0818  band 7 protein  30.17 
 
 		 252 aa  122  6e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  31.42 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0748  band 7 protein  30.17 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421043 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  29.61 
 
 		 254 aa  122  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.65 
 
 		 251 aa  121  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.28 
 
 		 259 aa  121  9.999999999999999e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  31.42 
 
 		 248 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  30.31 
 
 		 251 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3200  band 7 protein  32.24 
 
 		 278 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  29.61 
 
 		 263 aa  120  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4389  band 7 protein  28.06 
 
 		 253 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  30.21 
 
 		 261 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1024  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.71 
 
 		 260 aa  119  7e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.91 
 
 		 257 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2559  band 7 protein  31.06 
 
 		 285 aa  119  9e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166484 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  31.72 
 
 		 252 aa  119  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  30.36 
 
 		 257 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  29.91 
 
 		 257 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  28.87 
 
 		 308 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  27.83 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  30.53 
 
 		 267 aa  117  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  29.48 
 
 		 258 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2766  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.73 
 
 		 286 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2685  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.28 
 
 		 261 aa  116  5e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238135  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0323  band 7 protein  31.65 
 
 		 250 aa  116  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.75 
 
 		 257 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  30.22 
 
 		 249 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  27.78 
 
 		 247 aa  116  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  30.93 
 
 		 287 aa  115  8.999999999999998e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  30.28 
 
 		 259 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.345813 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>