More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2454 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2454  band 7 protein  100 
 
 
307 aa  617  1e-176  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  50.62 
 
 
333 aa  311  1e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0654  band 7 protein  53.68 
 
 
311 aa  305  8.000000000000001e-82  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.317674  normal  0.0372256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1870  band 7 protein  51.96 
 
 
310 aa  303  3.0000000000000004e-81  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0180116 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03070  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  51.47 
 
 
313 aa  296  3e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2375  band 7 protein  57.38 
 
 
334 aa  291  1e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  normal  0.805333 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02100  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  52.86 
 
 
330 aa  287  2e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2388  band 7 protein  48.57 
 
 
323 aa  276  3e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.791124  normal  0.159576 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  51.48 
 
 
298 aa  256  4e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1659  hypothetical protein  50.21 
 
 
262 aa  253  3e-66  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  48.48 
 
 
307 aa  242  5e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0544  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.75 
 
 
290 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048283  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  46.44 
 
 
279 aa  224  2e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5265  band 7 protein  41.85 
 
 
290 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5594  band 7 protein  41.85 
 
 
290 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3885  band 7 protein  40.74 
 
 
290 aa  222  6e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1713  band 7 protein  43.27 
 
 
290 aa  218  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2166  band 7 protein  42.97 
 
 
291 aa  212  5.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1784  band 7 protein  40.08 
 
 
276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131245  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  38.96 
 
 
267 aa  175  7e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  38.46 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  37.65 
 
 
281 aa  173  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  38.53 
 
 
290 aa  169  6e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  36.07 
 
 
265 aa  169  7e-41  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  36.6 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3473  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.41 
 
 
264 aa  163  3e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00917354 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.05 
 
 
270 aa  162  7e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.73 
 
 
252 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.47 
 
 
265 aa  160  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  35.59 
 
 
261 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  35.91 
 
 
259 aa  157  1e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  36.36 
 
 
261 aa  158  1e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  35.65 
 
 
255 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  35.71 
 
 
284 aa  156  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0067  band 7 protein  37.27 
 
 
270 aa  156  4e-37  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.5 
 
 
257 aa  155  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  35.15 
 
 
258 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  35.37 
 
 
251 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.53 
 
 
261 aa  153  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.17 
 
 
270 aa  153  4e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  40.39 
 
 
315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  35.48 
 
 
249 aa  152  7e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  33.47 
 
 
263 aa  152  8e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  32.79 
 
 
295 aa  150  2e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  36.41 
 
 
251 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  35.15 
 
 
258 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  36.21 
 
 
274 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  34.73 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  36.28 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  32.08 
 
 
308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.33 
 
 
249 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2766  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.56 
 
 
286 aa  146  5e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  33.47 
 
 
248 aa  145  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.33 
 
 
259 aa  145  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  34.06 
 
 
257 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.06 
 
 
257 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0832  band 7 protein  42.7 
 
 
289 aa  144  2e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.687867  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.06 
 
 
248 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  35.06 
 
 
253 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  34.56 
 
 
250 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  32.48 
 
 
252 aa  143  5e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2440  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.91 
 
 
270 aa  142  6e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.169483  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  34.1 
 
 
251 aa  142  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  34.2 
 
 
261 aa  142  7e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4950  band 7 protein  35.37 
 
 
278 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493211  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1815  band 7 protein  36.11 
 
 
254 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.142899 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  31.9 
 
 
254 aa  142  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  30.97 
 
 
247 aa  141  9.999999999999999e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.4 
 
 
278 aa  141  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05890  putative stomatin-like protein  34.88 
 
 
264 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.774362  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  31.78 
 
 
254 aa  141  9.999999999999999e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  35.21 
 
 
275 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  32.4 
 
 
252 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1024  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.81 
 
 
260 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584692  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  33.9 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0554  putative stomatin-like protein  34.88 
 
 
264 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  30.93 
 
 
260 aa  139  6e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1806  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.93 
 
 
256 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175938  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3200  band 7 protein  33.95 
 
 
278 aa  139  7.999999999999999e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  34.93 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  34.93 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.93 
 
 
257 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  33.79 
 
 
259 aa  138  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  30.21 
 
 
256 aa  138  1e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  32.58 
 
 
256 aa  138  1e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  35.02 
 
 
253 aa  138  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  31.36 
 
 
263 aa  137  2e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.67 
 
 
251 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.88 
 
 
267 aa  137  2e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.72 
 
 
257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  33.19 
 
 
257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  34.48 
 
 
270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.96 
 
 
267 aa  136  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  31.96 
 
 
267 aa  136  4e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1741  SPFH domain, Band 7 family protein  30.47 
 
 
291 aa  136  4e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.011683 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2228  band 7 protein  33.18 
 
 
351 aa  136  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  hitchhiker  0.000011879 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.72 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3381  band 7 protein  32.72 
 
 
252 aa  135  7.000000000000001e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.61 
 
 
252 aa  135  8e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  32.19 
 
 
287 aa  135  8e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>