More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3885 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3885  band 7 protein  100 
 
 		 290 aa  580  1.0000000000000001e-165  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5265  band 7 protein  85.52 
 
 		 290 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5594  band 7 protein  85.52 
 
 		 290 aa  509  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1713  band 7 protein  85.52 
 
 		 290 aa  490  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0544  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  77.24 
 
 		 290 aa  454  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2166  band 7 protein  67.78 
 
 		 291 aa  388  1e-107  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  52.97 
 
 		 279 aa  264  1e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1659  hypothetical protein  52.28 
 
 		 262 aa  261  1e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  48.18 
 
 		 298 aa  253  3e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  40.96 
 
 		 307 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1784  band 7 protein  45.71 
 
 		 276 aa  227  2e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131245  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2454  band 7 protein  38.89 
 
 		 307 aa  212  7.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1870  band 7 protein  39.19 
 
 		 310 aa  203  3e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0180116 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  38.46 
 
 		 333 aa  201  9e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0654  band 7 protein  38.93 
 
 		 311 aa  199  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.317674  normal  0.0372256 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02100  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  39.22 
 
 		 330 aa  198  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03070  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  39.21 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2375  band 7 protein  40.17 
 
 		 334 aa  188  7e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  normal  0.805333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2388  band 7 protein  40.71 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.791124  normal  0.159576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  40.17 
 
 		 284 aa  171  1e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  35.63 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3473  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.97 
 
 		 264 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00917354 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  36.6 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  36.36 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  36.36 
 
 		 259 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  37.5 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  34.75 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  35.68 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  35.83 
 
 		 278 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  36.68 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  33.69 
 
 		 265 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  35.23 
 
 		 295 aa  159  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.4 
 
 		 252 aa  159  6e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  34.36 
 
 		 261 aa  159  7e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  36.67 
 
 		 281 aa  158  8e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  33.73 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.66 
 
 		 270 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  35.39 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.62 
 
 		 270 aa  157  3e-37  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  36.48 
 
 		 281 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2228  band 7 protein  36.41 
 
 		 351 aa  155  6e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  hitchhiker  0.000011879 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.96 
 
 		 259 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  36.65 
 
 		 261 aa  154  1e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.53 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  36.12 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.53 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  36.53 
 
 		 267 aa  154  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  33.33 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  33.48 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  36.36 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.6 
 
 		 278 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2559  band 7 protein  34.68 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166484 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  34.22 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.34 
 
 		 261 aa  149  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28570  SPFH domain, Band 7 family protein  35.37 
 
 		 274 aa  149  6e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  31.8 
 
 		 248 aa  149  8e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  34.43 
 
 		 258 aa  148  8e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1741  SPFH domain, Band 7 family protein  33.77 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.011683 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.35 
 
 		 257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  33.18 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  33.91 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  32.48 
 
 		 254 aa  146  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3399  band 7 protein  36.77 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0067  band 7 protein  34.89 
 
 		 270 aa  146  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  32.2 
 
 		 263 aa  145  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4950  band 7 protein  37.05 
 
 		 278 aa  145  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493211  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  33.91 
 
 		 275 aa  145  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  33.05 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  32.16 
 
 		 248 aa  144  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2191  band 7 protein  35.45 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3381  band 7 protein  29.75 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  33.47 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4867  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.45 
 
 		 305 aa  143  3e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  34.65 
 
 		 260 aa  143  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  34.65 
 
 		 263 aa  142  5e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.88 
 
 		 259 aa  142  8e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  29.48 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  30.71 
 
 		 247 aa  139  4.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  33.19 
 
 		 252 aa  139  4.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  32.78 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  33.04 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.5 
 
 		 265 aa  138  1e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  31.43 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  30.17 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.84 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  33.91 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1815  band 7 protein  33.33 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.142899 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2659  band 7 protein  36.13 
 
 		 266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.37049  normal  0.0645118 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0991  band 7 protein  32.89 
 
 		 257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.44 
 
 		 257 aa  136  4e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  28.94 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  30.84 
 
 		 253 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.03 
 
 		 249 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.84 
 
 		 248 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  28.39 
 
 		 256 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.67 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2150  band 7 protein  30.89 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3200  band 7 protein  31.14 
 
 		 278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.8 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1643  band 7 protein  30.99 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182156  normal  0.321181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>