More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_03070 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_03070  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  100 
 
 		 313 aa  634    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2454  band 7 protein  51.47 
 
 		 307 aa  295  5e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1870  band 7 protein  47.37 
 
 		 310 aa  288  6e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0180116 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02100  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  45.95 
 
 		 330 aa  252  5.000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0654  band 7 protein  46.85 
 
 		 311 aa  250  3e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.317674  normal  0.0372256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2375  band 7 protein  45.42 
 
 		 334 aa  244  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  normal  0.805333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  43.27 
 
 		 333 aa  243  1.9999999999999999e-63  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2388  band 7 protein  39.79 
 
 		 323 aa  221  9e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.791124  normal  0.159576 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  40.3 
 
 		 298 aa  220  1.9999999999999999e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  41.2 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0544  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.15 
 
 		 290 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1713  band 7 protein  41 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  41.53 
 
 		 279 aa  208  1e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5265  band 7 protein  41.38 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1659  hypothetical protein  39.83 
 
 		 262 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5594  band 7 protein  41.38 
 
 		 290 aa  207  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3885  band 7 protein  38.28 
 
 		 290 aa  205  7e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2166  band 7 protein  39.08 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1784  band 7 protein  37.26 
 
 		 276 aa  185  9e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131245  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  38.18 
 
 		 267 aa  165  8e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.91 
 
 		 270 aa  159  5e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  34.98 
 
 		 281 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  33.77 
 
 		 290 aa  154  2.9999999999999998e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  35.02 
 
 		 281 aa  154  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  34.03 
 
 		 265 aa  152  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  35.11 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  34.38 
 
 		 265 aa  149  6e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0067  band 7 protein  36.07 
 
 		 270 aa  149  6e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.8 
 
 		 252 aa  145  1e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  32.27 
 
 		 258 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3473  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.74 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00917354 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  33.33 
 
 		 251 aa  143  4e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  34.31 
 
 		 253 aa  142  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  34.75 
 
 		 261 aa  142  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  32.79 
 
 		 263 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.31 
 
 		 248 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  34.47 
 
 		 284 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  30.63 
 
 		 255 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  30.04 
 
 		 295 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  32.88 
 
 		 249 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.48 
 
 		 257 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.93 
 
 		 261 aa  140  3e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  34.78 
 
 		 251 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  33.74 
 
 		 258 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  32.79 
 
 		 252 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  35.16 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.22 
 
 		 257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2191  band 7 protein  34.56 
 
 		 266 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  34.21 
 
 		 249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  30.65 
 
 		 247 aa  136  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  32.19 
 
 		 254 aa  136  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.52 
 
 		 270 aa  135  8e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  33.33 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  30.6 
 
 		 259 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  29.54 
 
 		 252 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.19 
 
 		 265 aa  134  9.999999999999999e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1741  SPFH domain, Band 7 family protein  31.84 
 
 		 291 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.011683 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  33.19 
 
 		 267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  33.93 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  32.9 
 
 		 258 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2559  band 7 protein  32.19 
 
 		 285 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166484 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  32.19 
 
 		 287 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.71 
 
 		 249 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0802  putative stomatin-like transmembrane protein  32.44 
 
 		 249 aa  132  5e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  32.02 
 
 		 274 aa  133  5e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0818  band 7 protein  32.43 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3381  band 7 protein  32.5 
 
 		 252 aa  132  7.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0748  band 7 protein  32.43 
 
 		 252 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421043 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.89 
 
 		 251 aa  132  9e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2685  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.26 
 
 		 261 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238135  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1024  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.26 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2166  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.96 
 
 		 265 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  32.64 
 
 		 257 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.33 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2766  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.49 
 
 		 286 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  31.56 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  32.5 
 
 		 248 aa  130  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  31.33 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05890  putative stomatin-like protein  33.49 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.774362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  31.9 
 
 		 261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  30.08 
 
 		 278 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0554  putative stomatin-like protein  33.49 
 
 		 264 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  33.64 
 
 		 259 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.64 
 
 		 257 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  33.64 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  29.05 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  31.22 
 
 		 260 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  33.64 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  33.64 
 
 		 257 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  29.05 
 
 		 259 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  31.67 
 
 		 263 aa  127  3e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.9 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.72 
 
 		 259 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1055  band 7 protein  36.49 
 
 		 275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.525023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2659  band 7 protein  31.89 
 
 		 266 aa  126  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.37049  normal  0.0645118 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  29.96 
 
 		 275 aa  126  5e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.68 
 
 		 259 aa  126  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4388  band 7 protein  32.72 
 
 		 257 aa  126  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  29.95 
 
 		 253 aa  125  9e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4907  band 7 protein  32.72 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551483  normal  0.286339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>