More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_02100 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_02100  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  100 
 
 		 330 aa  668    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  63.03 
 
 		 333 aa  411  1e-114  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2375  band 7 protein  50.48 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  normal  0.805333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2454  band 7 protein  53.21 
 
 		 307 aa  288  1e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2388  band 7 protein  49.47 
 
 		 323 aa  268  7e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.791124  normal  0.159576 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0654  band 7 protein  49.63 
 
 		 311 aa  261  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.317674  normal  0.0372256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1870  band 7 protein  45.07 
 
 		 310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0180116 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03070  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  46.28 
 
 		 313 aa  253  3e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  43.39 
 
 		 279 aa  223  3e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  47.16 
 
 		 298 aa  219  3.9999999999999997e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1659  hypothetical protein  43.37 
 
 		 262 aa  218  1e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  39.91 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1713  band 7 protein  40.8 
 
 		 290 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3885  band 7 protein  39.6 
 
 		 290 aa  203  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5265  band 7 protein  41.74 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5594  band 7 protein  41.74 
 
 		 290 aa  202  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2166  band 7 protein  38.13 
 
 		 291 aa  195  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0544  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.2 
 
 		 290 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048283  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1784  band 7 protein  37.36 
 
 		 276 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131245  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  36.91 
 
 		 261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.04 
 
 		 270 aa  148  1.0000000000000001e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  36.11 
 
 		 267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3473  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.33 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00917354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.66 
 
 		 252 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  38.12 
 
 		 315 aa  140  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  34.47 
 
 		 261 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  33.76 
 
 		 284 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  34.68 
 
 		 281 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  33.88 
 
 		 281 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  29.85 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  33.19 
 
 		 290 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.02 
 
 		 270 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  31.78 
 
 		 265 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  31.2 
 
 		 295 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.36 
 
 		 257 aa  129  5.0000000000000004e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  32.19 
 
 		 258 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0067  band 7 protein  32.43 
 
 		 270 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  30.74 
 
 		 248 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.43 
 
 		 261 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  32.2 
 
 		 255 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  30.59 
 
 		 249 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1815  band 7 protein  34.26 
 
 		 254 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.142899 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  30.47 
 
 		 260 aa  125  8.000000000000001e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  30 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  32.89 
 
 		 259 aa  125  1e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30 
 
 		 248 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  30.04 
 
 		 263 aa  123  5e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  28.75 
 
 		 254 aa  123  5e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  28.51 
 
 		 252 aa  122  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3200  band 7 protein  31.63 
 
 		 278 aa  122  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.24 
 
 		 265 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.02 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  29.09 
 
 		 259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  31.02 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3381  band 7 protein  27.9 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  30.09 
 
 		 267 aa  120  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  29.74 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  27.1 
 
 		 256 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  29.74 
 
 		 259 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  29.79 
 
 		 248 aa  119  6e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 270 aa  119  6e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4389  band 7 protein  27.76 
 
 		 253 aa  119  6e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  34.48 
 
 		 287 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  30 
 
 		 250 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.81 
 
 		 249 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  29.87 
 
 		 308 aa  119  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28570  SPFH domain, Band 7 family protein  32.41 
 
 		 274 aa  119  9e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  31.47 
 
 		 258 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  27.78 
 
 		 274 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  28.9 
 
 		 253 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  30.47 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.36 
 
 		 259 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  29.74 
 
 		 278 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  30 
 
 		 251 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  27.66 
 
 		 247 aa  117  3e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  29.82 
 
 		 261 aa  117  3e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2559  band 7 protein  33.62 
 
 		 285 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166484 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  28.94 
 
 		 254 aa  116  5e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  27.91 
 
 		 267 aa  116  6e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.18 
 
 		 257 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.85 
 
 		 259 aa  116  6e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  28.45 
 
 		 263 aa  116  6e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2228  band 7 protein  33.49 
 
 		 351 aa  115  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  hitchhiker  0.000011879 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  28.76 
 
 		 257 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.6 
 
 		 257 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  29.88 
 
 		 251 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.89 
 
 		 278 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0323  band 7 protein  29.36 
 
 		 250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  28.39 
 
 		 252 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.82 
 
 		 251 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  27.63 
 
 		 251 aa  114  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  27.48 
 
 		 258 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  29.02 
 
 		 249 aa  113  4.0000000000000004e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3399  band 7 protein  33.78 
 
 		 279 aa  113  4.0000000000000004e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.31 
 
 		 257 aa  113  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4867  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.87 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1024  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.36 
 
 		 260 aa  112  6e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0620  band 7 protein  33.48 
 
 		 261 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.15 
 
 		 257 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  28.15 
 
 		 257 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>