More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1173 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  100 
 
 
279 aa  561  1.0000000000000001e-159  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  64.62 
 
 
307 aa  335  3.9999999999999995e-91  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  58.94 
 
 
298 aa  290  2e-77  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1659  hypothetical protein  56 
 
 
262 aa  281  7.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3885  band 7 protein  52.97 
 
 
290 aa  264  1e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1713  band 7 protein  52.87 
 
 
290 aa  264  1e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5265  band 7 protein  54.24 
 
 
290 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5594  band 7 protein  54.24 
 
 
290 aa  262  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0544  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  55.08 
 
 
290 aa  262  6e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048283  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2166  band 7 protein  51.02 
 
 
291 aa  256  2e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2454  band 7 protein  44.36 
 
 
307 aa  223  2e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02100  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  45.54 
 
 
330 aa  218  7.999999999999999e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  42.37 
 
 
333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1784  band 7 protein  48.32 
 
 
276 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131245  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03070  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  42.2 
 
 
313 aa  205  7e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1870  band 7 protein  44.83 
 
 
310 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0180116 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2375  band 7 protein  41.95 
 
 
334 aa  200  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  normal  0.805333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0654  band 7 protein  40.39 
 
 
311 aa  196  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.317674  normal  0.0372256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2388  band 7 protein  43.58 
 
 
323 aa  193  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.791124  normal  0.159576 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3473  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.85 
 
 
264 aa  192  4e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00917354 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  41.22 
 
 
267 aa  187  2e-46  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  42.55 
 
 
290 aa  186  5e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  39.24 
 
 
265 aa  185  6e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  40.61 
 
 
259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  41.7 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.93 
 
 
252 aa  183  3e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  38.53 
 
 
275 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  39.3 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  39.83 
 
 
265 aa  178  8e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  39.91 
 
 
259 aa  177  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.93 
 
 
270 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  36.33 
 
 
281 aa  175  6e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.29 
 
 
270 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  37.87 
 
 
258 aa  171  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  38.46 
 
 
281 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.99 
 
 
257 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.73 
 
 
278 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  37.93 
 
 
251 aa  171  1e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  39.32 
 
 
263 aa  171  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.08 
 
 
261 aa  170  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  38.7 
 
 
308 aa  170  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  35.42 
 
 
261 aa  169  4e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  37.99 
 
 
248 aa  169  4e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  36.84 
 
 
252 aa  169  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.08 
 
 
265 aa  169  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  33.73 
 
 
251 aa  169  6e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.46 
 
 
267 aa  169  6e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  37.55 
 
 
255 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  34.66 
 
 
267 aa  168  1e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  39.15 
 
 
257 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2228  band 7 protein  37.96 
 
 
351 aa  167  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  hitchhiker  0.000011879 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  32.95 
 
 
261 aa  167  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1815  band 7 protein  38.43 
 
 
254 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.142899 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1806  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.08 
 
 
256 aa  166  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175938  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3381  band 7 protein  34.82 
 
 
252 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.79 
 
 
257 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  35.47 
 
 
274 aa  166  5e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  39.08 
 
 
252 aa  165  5.9999999999999996e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.26 
 
 
267 aa  165  6.9999999999999995e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  38.37 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.37 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  38.37 
 
 
257 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  38.79 
 
 
257 aa  165  8e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0067  band 7 protein  37.93 
 
 
270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  38.84 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.56 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.28 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  37.17 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  38.84 
 
 
259 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  38.07 
 
 
249 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.71 
 
 
257 aa  163  3e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.99 
 
 
259 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  35.62 
 
 
258 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  33.46 
 
 
260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  37.87 
 
 
258 aa  162  6e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2685  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.5 
 
 
261 aa  162  8.000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238135  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  35.34 
 
 
248 aa  162  8.000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0620  band 7 protein  40.08 
 
 
261 aa  161  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4388  band 7 protein  39.91 
 
 
257 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  33.08 
 
 
267 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4907  band 7 protein  39.91 
 
 
257 aa  160  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551483  normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1741  SPFH domain, Band 7 family protein  36.12 
 
 
291 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.011683 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  34.55 
 
 
263 aa  160  3e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  36.8 
 
 
261 aa  160  3e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  35.11 
 
 
249 aa  159  5e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3399  band 7 protein  37.22 
 
 
279 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.44 
 
 
252 aa  159  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  36.32 
 
 
315 aa  159  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0991  band 7 protein  39.35 
 
 
257 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  33.62 
 
 
254 aa  159  7e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  37.39 
 
 
253 aa  158  8e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4389  band 7 protein  39.46 
 
 
253 aa  158  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  39.45 
 
 
257 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  39.45 
 
 
257 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.39 
 
 
248 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  38.5 
 
 
278 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.45 
 
 
257 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  35.56 
 
 
247 aa  158  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  39.45 
 
 
257 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  35.78 
 
 
270 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>