More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3454 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  100 
 
 		 307 aa  623  1e-177  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  64.62 
 
 		 279 aa  335  5e-91  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  53.23 
 
 		 298 aa  293  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1659  hypothetical protein  56.35 
 
 		 262 aa  293  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2454  band 7 protein  50.46 
 
 		 307 aa  238  6.999999999999999e-62  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2166  band 7 protein  45.24 
 
 		 291 aa  238  8e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1713  band 7 protein  44.87 
 
 		 290 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5265  band 7 protein  43.4 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5594  band 7 protein  43.4 
 
 		 290 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3885  band 7 protein  40.96 
 
 		 290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0544  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.72 
 
 		 290 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1870  band 7 protein  42.63 
 
 		 310 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0180116 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  43.97 
 
 		 333 aa  220  3e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2375  band 7 protein  42.37 
 
 		 334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  normal  0.805333 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03070  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  42.4 
 
 		 313 aa  212  7e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0654  band 7 protein  40.08 
 
 		 311 aa  206  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.317674  normal  0.0372256 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02100  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  41.36 
 
 		 330 aa  204  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2388  band 7 protein  43.64 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.791124  normal  0.159576 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1784  band 7 protein  44.74 
 
 		 276 aa  190  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131245  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  42.04 
 
 		 290 aa  185  8e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  40.68 
 
 		 267 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  40 
 
 		 265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3473  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.4 
 
 		 264 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00917354 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.06 
 
 		 270 aa  177  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  41.18 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  35.93 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  37.07 
 
 		 259 aa  169  6e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  34.94 
 
 		 295 aa  169  7e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  38.2 
 
 		 281 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  38.53 
 
 		 284 aa  168  1e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.79 
 
 		 270 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  37.39 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.12 
 
 		 265 aa  166  5e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  36.99 
 
 		 249 aa  165  8e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  39.35 
 
 		 281 aa  165  9e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  37.24 
 
 		 252 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0067  band 7 protein  37.56 
 
 		 270 aa  164  2.0000000000000002e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.16 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  35.16 
 
 		 267 aa  163  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.4 
 
 		 261 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1815  band 7 protein  39.82 
 
 		 254 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.142899 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  39.21 
 
 		 263 aa  162  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.61 
 
 		 278 aa  162  6e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  36.02 
 
 		 251 aa  162  6e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.62 
 
 		 267 aa  162  6e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.09 
 
 		 257 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  36.77 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  35.44 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  35.84 
 
 		 274 aa  160  2e-38  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.02 
 
 		 249 aa  160  3e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  35.65 
 
 		 255 aa  159  6e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.98 
 
 		 257 aa  159  8e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  37.91 
 
 		 251 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  37.04 
 
 		 253 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2166  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.47 
 
 		 265 aa  157  1e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.04 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.99 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1741  SPFH domain, Band 7 family protein  38.73 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.011683 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  39.35 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  39.35 
 
 		 259 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.14 
 
 		 257 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  34.62 
 
 		 248 aa  156  4e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  35.53 
 
 		 254 aa  156  4e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  35.32 
 
 		 248 aa  156  5.0000000000000005e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0620  band 7 protein  41.38 
 
 		 261 aa  156  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2766  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.24 
 
 		 286 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  35.74 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.33 
 
 		 259 aa  155  9e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0402  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  35.9 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.674809  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  35.62 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  35.56 
 
 		 261 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  37.26 
 
 		 275 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  38.5 
 
 		 278 aa  153  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1660  Fis family transcriptional regulator  35.02 
 
 		 270 aa  153  4e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1635  Band 7 protein  34.05 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  37.75 
 
 		 251 aa  152  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  33.79 
 
 		 315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1024  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.6 
 
 		 260 aa  152  5.9999999999999996e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3381  band 7 protein  32.52 
 
 		 252 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0991  band 7 protein  37.96 
 
 		 257 aa  151  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0015  band 7 protein  39.91 
 
 		 262 aa  151  1e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2191  band 7 protein  34.6 
 
 		 266 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0347  band 7 protein  32.75 
 
 		 254 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.315344  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0818  band 7 protein  33.47 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0748  band 7 protein  33.47 
 
 		 252 aa  151  1e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421043 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0802  putative stomatin-like transmembrane protein  36.09 
 
 		 249 aa  151  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.798242 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  34.45 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  36.71 
 
 		 287 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.24 
 
 		 251 aa  151  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  36.91 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  37.25 
 
 		 250 aa  150  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2559  band 7 protein  35.59 
 
 		 285 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166484 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  31.62 
 
 		 247 aa  150  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  36.15 
 
 		 249 aa  150  3e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  35.32 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  33.48 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  34.89 
 
 		 252 aa  148  9e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  36.41 
 
 		 259 aa  148  9e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1643  band 7 protein  33.91 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182156  normal  0.321181 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>