More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5265 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_5265  band 7 protein  100 
 
 
290 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5594  band 7 protein  100 
 
 
290 aa  579  1e-164  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1713  band 7 protein  96.55 
 
 
290 aa  537  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3885  band 7 protein  85.52 
 
 
290 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0544  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  80 
 
 
290 aa  463  1e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048283  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2166  band 7 protein  70.83 
 
 
291 aa  387  1e-106  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1659  hypothetical protein  53.57 
 
 
262 aa  262  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  54.24 
 
 
279 aa  262  4.999999999999999e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  51.69 
 
 
298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  43.4 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1784  band 7 protein  47.77 
 
 
276 aa  228  8e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131245  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2454  band 7 protein  44.3 
 
 
307 aa  216  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1870  band 7 protein  39.85 
 
 
310 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0180116 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0654  band 7 protein  42.21 
 
 
311 aa  203  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.317674  normal  0.0372256 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03070  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  41.41 
 
 
313 aa  202  7e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  39.11 
 
 
333 aa  199  5e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02100  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  40.52 
 
 
330 aa  197  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2375  band 7 protein  41.13 
 
 
334 aa  193  3e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  normal  0.805333 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2388  band 7 protein  40.45 
 
 
323 aa  188  8e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.791124  normal  0.159576 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  40.25 
 
 
284 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  36.02 
 
 
249 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  38.36 
 
 
308 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  33.46 
 
 
290 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  36.68 
 
 
265 aa  159  4e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  37.34 
 
 
278 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  36.48 
 
 
259 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  36.48 
 
 
259 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  35.74 
 
 
267 aa  158  1e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  36.21 
 
 
259 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3473  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.43 
 
 
264 aa  155  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00917354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.23 
 
 
252 aa  154  1e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  33.83 
 
 
295 aa  154  1e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2228  band 7 protein  36.14 
 
 
351 aa  154  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.157467  hitchhiker  0.000011879 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  35.9 
 
 
261 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  36.07 
 
 
251 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  33.33 
 
 
259 aa  154  2e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.84 
 
 
259 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  34.96 
 
 
281 aa  152  5.9999999999999996e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  34.29 
 
 
261 aa  152  5.9999999999999996e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.19 
 
 
270 aa  152  5.9999999999999996e-36  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  33.76 
 
 
274 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  36.12 
 
 
261 aa  150  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.4 
 
 
270 aa  150  4e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  35.81 
 
 
287 aa  149  4e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  33.47 
 
 
248 aa  149  5e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  33.59 
 
 
281 aa  149  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  34.01 
 
 
265 aa  149  6e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2559  band 7 protein  34.93 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000166484 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  35.24 
 
 
249 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3399  band 7 protein  38.12 
 
 
279 aa  145  6e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  33.64 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.47 
 
 
278 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1741  SPFH domain, Band 7 family protein  32.9 
 
 
291 aa  145  1e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.011683 
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.7 
 
 
267 aa  144  2e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  34.33 
 
 
275 aa  144  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  34.7 
 
 
267 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  33.07 
 
 
267 aa  144  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  33.2 
 
 
258 aa  143  3e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0767  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.79 
 
 
267 aa  143  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.351425  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  32.47 
 
 
253 aa  143  4e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  35.17 
 
 
260 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  33.19 
 
 
261 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  33.62 
 
 
251 aa  142  6e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0119  band 7 protein  31.9 
 
 
263 aa  142  8e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  33.62 
 
 
258 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.03 
 
 
248 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  34.35 
 
 
257 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28570  SPFH domain, Band 7 family protein  33.07 
 
 
274 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  32.16 
 
 
248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  32.63 
 
 
254 aa  141  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  32.05 
 
 
256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  34.06 
 
 
257 aa  140  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0067  band 7 protein  33.06 
 
 
270 aa  139  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  29.34 
 
 
257 aa  137  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  31.2 
 
 
247 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  33.76 
 
 
263 aa  138  1e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  31 
 
 
255 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4867  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.53 
 
 
305 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  33.19 
 
 
252 aa  137  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3381  band 7 protein  28.28 
 
 
252 aa  136  4e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.889341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4950  band 7 protein  36.16 
 
 
278 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493211  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.92 
 
 
257 aa  135  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2191  band 7 protein  33.64 
 
 
266 aa  136  5e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4599  band 7 protein  34.98 
 
 
315 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.235432  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  32.5 
 
 
257 aa  135  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  32.56 
 
 
250 aa  135  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.65 
 
 
265 aa  135  9e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  32.63 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  32.63 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2659  band 7 protein  34.96 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.37049  normal  0.0645118 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.42 
 
 
249 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  32.63 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0991  band 7 protein  32.89 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.934291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  33.04 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  33.02 
 
 
251 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  31.52 
 
 
257 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  31.52 
 
 
257 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  31.52 
 
 
257 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3200  band 7 protein  30.9 
 
 
278 aa  133  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1815  band 7 protein  33.79 
 
 
254 aa  133  3e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.142899 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>