More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1659 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_1659  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  533  1e-150  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2339  band 7 protein  55.68 
 
 		 298 aa  306  2.0000000000000002e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000543382  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  56.35 
 
 		 307 aa  293  2e-78  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  56 
 
 		 279 aa  281  6.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5265  band 7 protein  53.57 
 
 		 290 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5594  band 7 protein  53.57 
 
 		 290 aa  262  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1713  band 7 protein  54.13 
 
 		 290 aa  261  6.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3885  band 7 protein  52.28 
 
 		 290 aa  261  1e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.282263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0544  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.19 
 
 		 290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.048283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2166  band 7 protein  50.84 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2454  band 7 protein  51.77 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1870  band 7 protein  48.07 
 
 		 310 aa  226  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0180116 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0654  band 7 protein  47.72 
 
 		 311 aa  226  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.317674  normal  0.0372256 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  44.44 
 
 		 333 aa  218  7.999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02100  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  44.07 
 
 		 330 aa  211  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2375  band 7 protein  42.61 
 
 		 334 aa  206  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  normal  0.805333 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03070  membrane protease subunit, stomatin/prohibitin  40.97 
 
 		 313 aa  201  9e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1784  band 7 protein  40.68 
 
 		 276 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.131245  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2388  band 7 protein  44.16 
 
 		 323 aa  197  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.791124  normal  0.159576 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  40.41 
 
 		 267 aa  194  1e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0695  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.75 
 
 		 270 aa  194  1e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.323887  hitchhiker  0.000167798 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1730  band 7 protein  39.59 
 
 		 265 aa  191  1e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3473  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.52 
 
 		 264 aa  187  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00917354 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  42.31 
 
 		 252 aa  186  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2049  band 7 protein  41.41 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0039  band 7 protein  38.68 
 
 		 251 aa  181  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1279  band 7 protein  40.69 
 
 		 261 aa  177  1e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4118  Membrane protease subunits stomatin/prohibitin  39.66 
 
 		 308 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119159  normal  0.0618424 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1024  band 7 protein  39.09 
 
 		 274 aa  176  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  39.3 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1624  band 7 protein  39.48 
 
 		 281 aa  173  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.602734 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0430  band 7 protein  39.55 
 
 		 261 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.617904  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  38.64 
 
 		 259 aa  172  5e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3653  band 7 protein  39.13 
 
 		 257 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.467369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  39.06 
 
 		 281 aa  171  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0814  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.77 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000120225  hitchhiker  0.0000000481478 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  37.71 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1305  Band 7 protein  38.36 
 
 		 248 aa  169  4e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.316844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.68 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1489  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.51 
 
 		 265 aa  169  4e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.648158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  39.06 
 
 		 290 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1958  membrane protease subunits, stomatin/prohibitin-like  40.64 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  40.09 
 
 		 259 aa  168  7e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0220  band 7 protein  37.61 
 
 		 253 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.964901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4950  band 7 protein  41.85 
 
 		 278 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.493211  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0199  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.61 
 
 		 248 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1014  band 7 protein  38.56 
 
 		 265 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.855115  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000358  stomatin family protein  38.46 
 
 		 260 aa  166  2.9999999999999998e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0711  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.18 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.948831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5320  band 7 protein  40.18 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0030442  normal  0.0109702 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2975  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.45 
 
 		 278 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.71368  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4966  band 7 protein  40.18 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.848801  normal  0.340284 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3401  band 7 protein  40.18 
 
 		 257 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0915  SPFH domain-containing protein  39.82 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.323341  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2175  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.82 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275738  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0865  band 7 protein  35.96 
 
 		 254 aa  165  5.9999999999999996e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.301749  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0822  SPFH domain-containing protein  39.82 
 
 		 257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645625  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06174  hypothetical protein  38.01 
 
 		 263 aa  165  6.9999999999999995e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2912  band 7 protein  38.72 
 
 		 255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0067  band 7 protein  39.19 
 
 		 270 aa  165  8e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0472  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.93 
 
 		 249 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4388  band 7 protein  39.27 
 
 		 257 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.101759 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2430  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.19 
 
 		 261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.108458  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1699  band 7 protein  37.93 
 
 		 258 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000129402 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0872  band 7 protein  39.17 
 
 		 253 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000276466  normal  0.0470054 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1571  band 7 protein  37.13 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4907  band 7 protein  39.27 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.551483  normal  0.286339 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1081  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.03 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348982  decreased coverage  0.00598719 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5653  band 7 protein  38.03 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592895  normal  0.980998 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1170  band 7 protein  38.14 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.985704  decreased coverage  0.00325794 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2685  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.55 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0238135  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1806  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.81 
 
 		 256 aa  163  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.175938  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1785  band 7 protein  34.11 
 
 		 267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1024  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.5 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.584692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2410  band 7 protein  37.23 
 
 		 287 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.183043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2105  band 7 protein  38.07 
 
 		 275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.585176 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0490  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.23 
 
 		 252 aa  162  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05740  Integral membrane protein, band 7 family  37.18 
 
 		 252 aa  161  9e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.332679  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0464  band 7 protein  36.91 
 
 		 261 aa  161  9e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000381687  normal  0.0261811 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1643  band 7 protein  38.43 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.182156  normal  0.321181 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0267  band 7 protein  38.25 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0223  band 7 protein  37.79 
 
 		 251 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2559  band 7 protein  36.36 
 
 		 285 aa  160  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000166484 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3200  band 7 protein  37.67 
 
 		 278 aa  159  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4520  band 7 protein  37.33 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.551636 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0852  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.17 
 
 		 257 aa  160  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.198296  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0947  Band 7 protein  33.47 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.13935  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28570  SPFH domain, Band 7 family protein  38.02 
 
 		 274 aa  159  4e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2191  band 7 protein  37.27 
 
 		 266 aa  159  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1815  band 7 protein  39.37 
 
 		 254 aa  158  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.217912  normal  0.142899 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5123  band 7 protein  38.01 
 
 		 259 aa  158  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.345813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0818  band 7 protein  35.86 
 
 		 252 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.142501  normal  0.529014 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2128  band 7 protein  36.71 
 
 		 251 aa  158  1e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.257106  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0804  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.73 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.690424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.94 
 
 		 259 aa  157  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0848  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  36.07 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00115336  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_752  SPFH domain/band 7 family domain protein  36.07 
 
 		 267 aa  157  2e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.293007  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0748  band 7 protein  35.46 
 
 		 252 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.421043 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2520  band 7 protein  38.1 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1601  band 7 protein  35.43 
 
 		 252 aa  156  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.829525  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>