73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_3456 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  100 
 
 
281 aa  575  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  67.97 
 
 
281 aa  384  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  67.84 
 
 
282 aa  381  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  59.77 
 
 
293 aa  324  8.000000000000001e-88  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  67.54 
 
 
305 aa  316  3e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  61.21 
 
 
313 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  57.41 
 
 
305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  61.44 
 
 
287 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  61.28 
 
 
289 aa  300  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  54.39 
 
 
281 aa  299  3e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  52.46 
 
 
281 aa  298  6e-80  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  55.91 
 
 
293 aa  298  6e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  52.6 
 
 
291 aa  297  1e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  54.44 
 
 
303 aa  296  2e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  52.4 
 
 
302 aa  296  3e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  51.75 
 
 
280 aa  295  6e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  61.21 
 
 
302 aa  294  9e-79  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  58.33 
 
 
294 aa  293  2e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  59.65 
 
 
286 aa  290  2e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  53.31 
 
 
284 aa  290  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  56.05 
 
 
283 aa  289  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  57.72 
 
 
315 aa  290  3e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  53.61 
 
 
310 aa  283  3.0000000000000004e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  53.63 
 
 
300 aa  282  5.000000000000001e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  58.87 
 
 
310 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  50.71 
 
 
281 aa  279  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  55.65 
 
 
280 aa  279  3e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  51.57 
 
 
281 aa  279  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  58.19 
 
 
309 aa  278  1e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  48.97 
 
 
309 aa  276  2e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  56.15 
 
 
295 aa  273  3e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  55.6 
 
 
281 aa  271  7e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.7 
 
 
281 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  50.7 
 
 
281 aa  271  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.35 
 
 
281 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  55.6 
 
 
281 aa  271  1e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  50.35 
 
 
281 aa  271  1e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  50.35 
 
 
281 aa  271  1e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  54.77 
 
 
281 aa  270  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  51.04 
 
 
281 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  50.18 
 
 
300 aa  270  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  45.8 
 
 
288 aa  264  1e-69  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  50.37 
 
 
328 aa  263  2e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  53.25 
 
 
306 aa  262  4e-69  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  58.44 
 
 
319 aa  257  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  41.67 
 
 
352 aa  239  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  43.54 
 
 
285 aa  226  3e-58  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  43.91 
 
 
285 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.04 
 
 
281 aa  208  1e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  74.24 
 
 
132 aa  201  9.999999999999999e-51  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  37.99 
 
 
322 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  39.55 
 
 
322 aa  191  8e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  40.39 
 
 
322 aa  188  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  38.5 
 
 
284 aa  160  3e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  25.87 
 
 
359 aa  56.6  0.0000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  25 
 
 
333 aa  52.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  25.57 
 
 
279 aa  48.9  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  22.57 
 
 
356 aa  48.5  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1659  hypothetical protein  27.91 
 
 
262 aa  48.5  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  22.77 
 
 
361 aa  46.2  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  27.92 
 
 
361 aa  45.8  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  26.73 
 
 
363 aa  45.4  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  25 
 
 
307 aa  44.3  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0548  protease subunit HflK  29.1 
 
 
380 aa  44.3  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  20.89 
 
 
345 aa  43.9  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  21.67 
 
 
344 aa  43.9  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0524  protease subunit HflK  29.1 
 
 
380 aa  43.9  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.79 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  27.86 
 
 
336 aa  42.7  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  24.26 
 
 
355 aa  42.7  0.007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2312  band 7 protein  27.61 
 
 
473 aa  42.7  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180673  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  24.72 
 
 
306 aa  42.4  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1870  band 7 protein  27.97 
 
 
310 aa  42.4  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0180116 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>