101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_1922 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  100 
 
 
309 aa  611  9.999999999999999e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  73.53 
 
 
315 aa  358  5e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  60.2 
 
 
309 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  68.67 
 
 
313 aa  326  3e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  70.04 
 
 
305 aa  316  2e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  54.05 
 
 
302 aa  312  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  53.87 
 
 
293 aa  297  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  60.79 
 
 
305 aa  286  2e-76  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  58.2 
 
 
283 aa  286  2e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  60.34 
 
 
310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  62.11 
 
 
286 aa  282  4.0000000000000003e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  59.83 
 
 
306 aa  282  4.0000000000000003e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  56.5 
 
 
294 aa  281  8.000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  49.12 
 
 
281 aa  279  4e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  49.13 
 
 
303 aa  278  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  53.19 
 
 
319 aa  278  1e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  48.95 
 
 
281 aa  276  3e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  59.38 
 
 
295 aa  276  3e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  56.71 
 
 
281 aa  275  5e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  49.31 
 
 
282 aa  275  9e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  48.59 
 
 
281 aa  271  8.000000000000001e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  51.16 
 
 
300 aa  270  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  57.2 
 
 
287 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  49.66 
 
 
302 aa  268  8e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  47.18 
 
 
281 aa  268  1e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  49.13 
 
 
300 aa  266  4e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  47.77 
 
 
291 aa  265  1e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  47.93 
 
 
284 aa  265  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  49.29 
 
 
310 aa  264  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  49.08 
 
 
328 aa  262  4.999999999999999e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  45.77 
 
 
281 aa  261  1e-68  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  50.84 
 
 
280 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  46.79 
 
 
280 aa  260  3e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  51.91 
 
 
281 aa  257  1e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.49 
 
 
281 aa  257  2e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.49 
 
 
281 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  51.49 
 
 
281 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  51.49 
 
 
281 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  51.49 
 
 
281 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  51.49 
 
 
281 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  51.49 
 
 
281 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  54.2 
 
 
293 aa  255  6e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  51.06 
 
 
281 aa  255  7e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  53.78 
 
 
289 aa  254  2.0000000000000002e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  44.98 
 
 
288 aa  253  3e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  43.21 
 
 
352 aa  236  5.0000000000000005e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  40.52 
 
 
285 aa  211  9e-54  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  40.59 
 
 
285 aa  211  1e-53  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.3 
 
 
281 aa  207  2e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  39.1 
 
 
322 aa  195  8.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  40.93 
 
 
322 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  40.93 
 
 
322 aa  190  2e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  39.74 
 
 
284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  58.33 
 
 
132 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  28.48 
 
 
279 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  27.27 
 
 
304 aa  55.8  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2215  band 7 protein  28.57 
 
 
304 aa  52.8  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00993156  normal  0.0579 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61642  Stomatin-like protein 3  26.8 
 
 
340 aa  52  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  23.84 
 
 
278 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  27.96 
 
 
380 aa  51.2  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2641  band 7 protein  28.57 
 
 
409 aa  51.6  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  29.75 
 
 
307 aa  50.4  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  24.06 
 
 
356 aa  50.8  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  27.27 
 
 
336 aa  49.7  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0841  band 7 protein  27.96 
 
 
399 aa  49.7  0.00007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  24.2 
 
 
295 aa  49.3  0.00009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.17 
 
 
311 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  25.39 
 
 
359 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2800  band 7 protein  26.88 
 
 
392 aa  48.5  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.45 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  24.35 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0139  band 7 protein  27.92 
 
 
289 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.889576  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  24.35 
 
 
259 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2388  band 7 protein  26.69 
 
 
323 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.791124  normal  0.159576 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  27.22 
 
 
386 aa  48.1  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.86 
 
 
309 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  25.81 
 
 
376 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0260  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.78 
 
 
286 aa  47  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  26.44 
 
 
332 aa  45.8  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.45 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.45 
 
 
316 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0702  HflK protein  24.84 
 
 
306 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3607  band 7 protein  26.9 
 
 
346 aa  45.4  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  25.26 
 
 
333 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5265  band 7 protein  25 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5594  band 7 protein  25 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  25.43 
 
 
331 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2375  band 7 protein  24.42 
 
 
334 aa  44.3  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.469679  normal  0.805333 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03163  stomatin family protein (AFU_orthologue; AFUA_3G13440)  25.38 
 
 
344 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000111166  normal  0.837259 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2704  band 7 protein  26.04 
 
 
332 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0620  band 7 protein  27.7 
 
 
261 aa  44.3  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.7 
 
 
270 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2022  band 7 protein  24.85 
 
 
303 aa  43.9  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3720  hypothetical protein  26.7 
 
 
344 aa  43.9  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2413  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.26 
 
 
303 aa  43.5  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132668  normal  0.549514 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.8 
 
 
312 aa  43.1  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1478  band 7 protein  25.13 
 
 
290 aa  43.5  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.965054  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.23 
 
 
314 aa  43.1  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  24.22 
 
 
363 aa  43.1  0.007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3259  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.19 
 
 
304 aa  42.7  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.849925  normal  0.405383 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>