76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2131 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  100 
 
 		 300 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  70.75 
 
 		 302 aa  420  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  66.33 
 
 		 300 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  57.24 
 
 		 303 aa  324  1e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  64.49 
 
 		 293 aa  322  6e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  54.78 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  47.56 
 
 		 328 aa  283  2.0000000000000002e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  53.63 
 
 		 281 aa  281  7.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  48.44 
 
 		 282 aa  276  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  47.93 
 
 		 281 aa  275  6e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  51.89 
 
 		 309 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  57.46 
 
 		 305 aa  267  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  57.45 
 
 		 294 aa  266  2e-70  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  48.57 
 
 		 281 aa  265  8e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  56.78 
 
 		 287 aa  264  1e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  50 
 
 		 284 aa  264  1e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  51.3 
 
 		 315 aa  264  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  46.92 
 
 		 291 aa  263  3e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  56.9 
 
 		 313 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  51.02 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  53.33 
 
 		 289 aa  259  3e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  49.63 
 
 		 293 aa  258  6e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  52.23 
 
 		 281 aa  256  3e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  47.04 
 
 		 280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  48.57 
 
 		 280 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  48.12 
 
 		 302 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  45.33 
 
 		 281 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  48.59 
 
 		 305 aa  241  1e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  43.4 
 
 		 281 aa  239  4e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  52.97 
 
 		 283 aa  239  4e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  49.39 
 
 		 281 aa  239  5.999999999999999e-62  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  48.61 
 
 		 281 aa  238  8e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  48.61 
 
 		 281 aa  238  8e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.61 
 
 		 281 aa  238  8e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.61 
 
 		 281 aa  238  8e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  48.61 
 
 		 281 aa  238  8e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  48.21 
 
 		 281 aa  237  1e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  48.21 
 
 		 281 aa  238  1e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  48.21 
 
 		 281 aa  237  2e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  42.51 
 
 		 288 aa  236  4e-61  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  50 
 
 		 286 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  54.37 
 
 		 319 aa  229  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  51.5 
 
 		 310 aa  229  5e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  48.57 
 
 		 306 aa  228  9e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  51.91 
 
 		 295 aa  224  1e-57  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  37.24 
 
 		 352 aa  219  6e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  37.87 
 
 		 285 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.17 
 
 		 281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  37.7 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  37.04 
 
 		 285 aa  192  4e-48  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  37.25 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  37.13 
 
 		 322 aa  180  2e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  56.06 
 
 		 132 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  38.96 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  26.39 
 
 		 344 aa  56.6  0.0000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  27.42 
 
 		 359 aa  52.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  32.54 
 
 		 399 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  31.01 
 
 		 393 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  27.88 
 
 		 347 aa  48.9  0.0001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  26.32 
 
 		 385 aa  48.9  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  28.57 
 
 		 498 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  28.46 
 
 		 503 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  28.12 
 
 		 393 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  28.12 
 
 		 393 aa  45.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  26.72 
 
 		 355 aa  45.4  0.001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  24.4 
 
 		 361 aa  44.7  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  22.95 
 
 		 382 aa  44.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  28 
 
 		 382 aa  44.3  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  22.87 
 
 		 362 aa  43.5  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.89 
 
 		 345 aa  43.5  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  24.84 
 
 		 357 aa  43.5  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0036  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.8 
 
 		 270 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0311937  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  29.01 
 
 		 452 aa  42.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  28.82 
 
 		 370 aa  42.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3637  band 7 protein  24.41 
 
 		 284 aa  42.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0675354  normal  0.0204914 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  24.11 
 
 		 333 aa  42.4  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>