113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0106 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0106  band 7 protein  100 
 
 
315 aa  632  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1211  band 7 protein  64.56 
 
 
305 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1922  band 7 protein  64.97 
 
 
309 aa  366  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1437  band 7 protein  64.17 
 
 
313 aa  360  1e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.11643  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1902  band 7 protein  62.21 
 
 
309 aa  360  2e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156921  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2250  band 7 protein  58.94 
 
 
302 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643053  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1106  band 7 protein  57.36 
 
 
293 aa  311  1e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0783  band 7 protein  61.13 
 
 
283 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0345  band 7 protein  51.86 
 
 
294 aa  293  3e-78  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.984706  normal  0.255057 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2423  band 7 protein  62.56 
 
 
305 aa  291  7e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.629628  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3456  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  57.09 
 
 
281 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63003  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2237  band 7 protein  52.98 
 
 
303 aa  290  3e-77  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.13253 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2874  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  58.2 
 
 
281 aa  288  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1974  band 7 protein  61.37 
 
 
310 aa  286  2e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01581  SPFH domain/Band 7 family protein  53.51 
 
 
282 aa  286  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0387  band 7 protein  55.82 
 
 
281 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.003023  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1298  band 7 protein  61.84 
 
 
286 aa  283  2.0000000000000002e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1263  band 7 protein  55.13 
 
 
281 aa  281  9e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1882  band 7 protein  47.75 
 
 
291 aa  280  3e-74  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6391  band 7 protein  57.69 
 
 
284 aa  276  3e-73  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.163911  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3863  band 7 protein  53.23 
 
 
306 aa  276  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3446  band 7 protein  56.6 
 
 
319 aa  273  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0174977 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3657  band 7 protein  58.05 
 
 
287 aa  272  5.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2131  band 7 protein  49.49 
 
 
300 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.481832  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2916  band 7 protein  54.36 
 
 
280 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.568933  normal  0.206568 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0217  band 7 protein  51.53 
 
 
300 aa  268  5.9999999999999995e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0282  band 7 protein  52.59 
 
 
281 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0786  band 7 protein  48.93 
 
 
280 aa  268  5.9999999999999995e-71  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2127  band 7 protein  47.1 
 
 
310 aa  268  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.825595 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3488  band 7 protein  60 
 
 
295 aa  268  7e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0282  band 7 protein  50.92 
 
 
281 aa  266  5e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1361  band 7 protein  53.17 
 
 
289 aa  263  2e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0272  band 7 family protein  52.96 
 
 
281 aa  261  8e-69  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0330  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.96 
 
 
281 aa  261  1e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0288  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.96 
 
 
281 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0301  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  52.96 
 
 
281 aa  261  1e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0374  SPFH domain/band 7 family protein  52.96 
 
 
281 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0347  SPFH domain/band 7 family protein  52.96 
 
 
281 aa  261  1e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0333  SPFH domain/band 7 family protein  52.96 
 
 
281 aa  261  1e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0275  band 7 family protein  52.96 
 
 
281 aa  260  2e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2841  band 7 protein  53.75 
 
 
293 aa  259  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0320594  normal  0.0434623 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4973  SPFH domain/band 7 family protein  52.96 
 
 
281 aa  259  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0055  band 7 protein  44.14 
 
 
328 aa  260  3e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3197  band 7 protein  48.61 
 
 
302 aa  256  4e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.194642  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0902  band 7 protein  45.09 
 
 
288 aa  251  1e-65  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0211  band 7 protein  38.79 
 
 
352 aa  248  8e-65  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0626  Band 7 protein  47.86 
 
 
285 aa  222  7e-57  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.319786  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0390  SPFH domain-containing protein  46.56 
 
 
285 aa  221  9.999999999999999e-57  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.911481  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0482  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.6 
 
 
281 aa  208  1e-52  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3117  band 7 protein  40.39 
 
 
322 aa  205  9e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.818666 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3436  band 7 protein  41.76 
 
 
322 aa  202  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.195977 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3312  band 7 protein  40.52 
 
 
322 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.436848  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4139  band 7 protein  40.33 
 
 
284 aa  170  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04452  spfh domain/band 7 family protein  62.12 
 
 
132 aa  162  8.000000000000001e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2221  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  32.24 
 
 
312 aa  60.8  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674457 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1173  band 7 protein  28.5 
 
 
279 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.438016  normal  0.450996 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2406  band 7 protein  28.12 
 
 
333 aa  56.6  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0391283  normal  0.226539 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1502  band 7 protein  24.91 
 
 
278 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.486349  normal  0.763804 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0786  band 7 protein  26.05 
 
 
295 aa  54.7  0.000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5669  Band 7 protein  28.74 
 
 
348 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.324788 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2368  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.75 
 
 
259 aa  52.8  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.843969  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  23.81 
 
 
359 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1316  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.27 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0215756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1132  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.27 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1496  band 7 protein  27.78 
 
 
259 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1591  band 7 protein  27.78 
 
 
259 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1620  band 7 protein  30.62 
 
 
284 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000904409  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  29.71 
 
 
393 aa  50.1  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4843  band 7 protein  27.42 
 
 
336 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5534  SPFH domain / Band 7 family protein  27.92 
 
 
345 aa  49.3  0.00009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5083  Band 7 protein  27.92 
 
 
345 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0929  Band 7 protein  26.2 
 
 
332 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  27.91 
 
 
344 aa  47.8  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2814  hypothetical protein  30.26 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.320568  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  30.15 
 
 
304 aa  47.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3110  band 7 protein  29.72 
 
 
282 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00709216  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33080  hypothetical protein  29.84 
 
 
337 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000208318  hitchhiker  0.00231515 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  32.06 
 
 
435 aa  47.4  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4303  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25 
 
 
311 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  22.73 
 
 
293 aa  47.8  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  29.41 
 
 
305 aa  47.4  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5109  band 7 protein  28.8 
 
 
326 aa  46.6  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000505876  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0944  band 7 protein  25.44 
 
 
331 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.188485  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0416  band 7 protein  26.7 
 
 
304 aa  46.6  0.0005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  27.11 
 
 
309 aa  46.6  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1659  hypothetical protein  27.5 
 
 
262 aa  46.2  0.0006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7190  membrane protease  28.9 
 
 
367 aa  46.2  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.996167  normal  0.693971 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0697  band 7 protein  28.73 
 
 
259 aa  46.2  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.918987  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  26.64 
 
 
361 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  24.64 
 
 
356 aa  46.2  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  28.12 
 
 
363 aa  46.2  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1359  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.67 
 
 
334 aa  46.2  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0198882 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  24.04 
 
 
326 aa  45.8  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4125  HflK protein  28.18 
 
 
515 aa  45.4  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4127  HflK protein  26.32 
 
 
375 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.848756  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  28.26 
 
 
304 aa  45.4  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1337  band 7 protein  27.14 
 
 
281 aa  45.4  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.773345  normal  0.981005 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  25.42 
 
 
356 aa  45.1  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4419  band 7 protein  26.7 
 
 
319 aa  44.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  25 
 
 
380 aa  44.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>