More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0502 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  100 
 
 
363 aa  712    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  79.58 
 
 
361 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  75.57 
 
 
356 aa  512  1e-144  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  71.6 
 
 
345 aa  486  1e-136  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  55.06 
 
 
361 aa  343  2e-93  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  40.72 
 
 
384 aa  268  8.999999999999999e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2800  band 7 protein  43.8 
 
 
392 aa  247  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  41.28 
 
 
376 aa  247  2e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  43.14 
 
 
381 aa  246  6e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0841  band 7 protein  42.55 
 
 
399 aa  242  7e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0061  band 7 protein  44.18 
 
 
305 aa  240  2e-62  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00313093  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  39.58 
 
 
386 aa  239  5.999999999999999e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0061  band 7 protein  43.84 
 
 
305 aa  238  9e-62  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0011407  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1327  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  46.97 
 
 
285 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.7737 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  42.65 
 
 
380 aa  235  8e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1330  band 7 protein  44.14 
 
 
304 aa  233  3e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.373996  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  41.78 
 
 
307 aa  232  6e-60  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0842  band 7 protein  46.01 
 
 
290 aa  232  9e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.360301 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2641  band 7 protein  41.45 
 
 
409 aa  228  8e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0729  band 7 protein  42.11 
 
 
310 aa  228  1e-58  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0564  band 7 protein  40.48 
 
 
309 aa  228  2e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.396207  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0557  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  44.98 
 
 
268 aa  227  3e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0290  band 7 protein  44.98 
 
 
268 aa  226  4e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0917443  normal  0.201175 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1623  band 7 protein  44.61 
 
 
268 aa  225  8e-58  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0769  band 7 protein  46.64 
 
 
266 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.953295  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0359  band 7 protein  44.24 
 
 
268 aa  220  3.9999999999999997e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.741854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  40.75 
 
 
312 aa  214  9.999999999999999e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14640  band 7 protein  38.66 
 
 
326 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000590764  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2310  band 7 protein  39.62 
 
 
356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0307  band 7 protein  44.7 
 
 
285 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0832  band 7 protein  38.26 
 
 
289 aa  210  4e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.687867  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.38 
 
 
376 aa  209  5e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  43.34 
 
 
314 aa  208  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3075  band 7 protein  40.55 
 
 
319 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0686773 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1714  band 7 protein  43.12 
 
 
314 aa  206  4e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  38.38 
 
 
359 aa  204  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0965  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.14 
 
 
304 aa  203  4e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.543775  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2312  band 7 protein  38.28 
 
 
473 aa  202  6e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00180673  hitchhiker  0.000141748 
 
 
-
 
NC_002950  PG1334  band 7/Mec-2 family protein  39.8 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3439  band 7 protein  41.54 
 
 
361 aa  200  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717632  normal  0.970499 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2939  band 7 protein  43.1 
 
 
312 aa  199  6e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0124635  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00440  predicted protease, membrane anchored  39.79 
 
 
305 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3121  band 7 protein  39.79 
 
 
305 aa  199  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0538  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.79 
 
 
305 aa  199  7e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0593  SPFH domain/band 7 family protein  39.79 
 
 
305 aa  199  7e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.554445 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00445  hypothetical protein  39.79 
 
 
305 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3127  band 7 protein  39.79 
 
 
305 aa  199  7e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000985996 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0568  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.79 
 
 
305 aa  199  7e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0424  SPFH domain/band 7 family protein  39.79 
 
 
305 aa  199  7.999999999999999e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  39.68 
 
 
403 aa  199  7.999999999999999e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0555  band 7 protein  39.79 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.857194  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0609  band 7 protein  39.79 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0565  band 7 protein  39.79 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0550  band 7 protein  39.79 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0548  band 7 protein  39.79 
 
 
305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0528  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  39.44 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2313  band 7 protein  39.01 
 
 
398 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19780  SPFH domain, Band 7 family protein  36.95 
 
 
456 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.295891  hitchhiker  0.000474854 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1429  band 7 protein  38.51 
 
 
394 aa  197  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11517  hypothetical protein  36.66 
 
 
381 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.18068 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0157  inner membrane protein  36.39 
 
 
318 aa  194  2e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.131876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1153  band 7 protein  44.59 
 
 
301 aa  193  3e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.294255  hitchhiker  0.000000366449 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0138  band 7 protein  36.27 
 
 
318 aa  193  5e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0360  band 7 protein  35.69 
 
 
327 aa  192  6e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.259397 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1100  band 7 protein  40.36 
 
 
304 aa  192  6e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  39.49 
 
 
359 aa  192  7e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3421  band 7 protein  39.27 
 
 
402 aa  192  8e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  38.24 
 
 
356 aa  192  8e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.22 
 
 
318 aa  192  9e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  40.68 
 
 
327 aa  192  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1560  band 7 protein  36.4 
 
 
322 aa  191  2e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.140523  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  38.05 
 
 
336 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3216  band 7 protein  37.81 
 
 
304 aa  191  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2111  band 7 protein  40 
 
 
395 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3244  band 7 protein  36.62 
 
 
369 aa  190  4e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3018  band 7 protein  35.35 
 
 
369 aa  189  5.999999999999999e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.506434  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1932  band 7 protein  38.41 
 
 
315 aa  189  9e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000138273 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2189  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  37.12 
 
 
328 aa  189  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0577591  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3653  band 7 protein  35.84 
 
 
403 aa  189  9e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1924  band 7 protein  35.13 
 
 
322 aa  188  1e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.159861  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3162  band 7 protein  40.14 
 
 
304 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0466  band 7 protein  40 
 
 
321 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0480  band 7 protein  40 
 
 
321 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3024  SPFH/band 7 family protein  40.14 
 
 
304 aa  187  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0497  hypothetical protein  42.53 
 
 
306 aa  187  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.988378  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1268  hypothetical protein  40.14 
 
 
304 aa  187  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.169836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2051  band 7 protein  39.93 
 
 
439 aa  187  3e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.471473 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21690  SPFH domain, Band 7 family protein  43.48 
 
 
429 aa  187  3e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.389538  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2247  band 7 protein  39.87 
 
 
324 aa  187  3e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0154537 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004150  stomatin family protein  41.96 
 
 
305 aa  186  6e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2091  band 7 protein  36.51 
 
 
401 aa  186  6e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0259831  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  41.64 
 
 
314 aa  186  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2759  band 7 protein  35.84 
 
 
406 aa  186  8e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.84305  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18370  SPFH domain, Band 7 family protein  39.37 
 
 
416 aa  186  8e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.848038  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1632  band 7 protein  39.78 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0121873  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3112  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  40.31 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3243  SPFH domain/Band 7 family protein  34.18 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000635475  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01317  hypothetical protein  42.41 
 
 
304 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  37.31 
 
 
360 aa  184  2.0000000000000003e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1226  band 7 protein  38.52 
 
 
293 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>