More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_2779 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2779  transcriptional regulator, LysR family  100 
 
 		 304 aa  628  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.978059  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2157  transcriptional regulator  47.9 
 
 		 296 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.623501  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1969  LysR family transcriptional regulator  47.18 
 
 		 296 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10090  LysR family transcriptional regulator  44.75 
 
 		 303 aa  270  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000636611  normal  0.898763 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0932  transcriptional regulator  45.7 
 
 		 303 aa  264  2e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0156  HTH-type transcriptional regulator, LysR family  35.42 
 
 		 299 aa  184  2.0000000000000003e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3902  LysR family transcriptional regulator  31.97 
 
 		 296 aa  143  3e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1967  transcriptional regulator, LysR family  31.94 
 
 		 297 aa  142  5e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0256766 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000784  transcriptional regulator  29.51 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.340828  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39900  LysR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 303 aa  139  7.999999999999999e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6611  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.541537 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6129  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.414294 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5764  LysR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 305 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2133  transcriptional regulator, LysR family  30.07 
 
 		 335 aa  138  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.212126  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3747  LysR, substrate-binding  32.53 
 
 		 301 aa  136  4e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7632  LysR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 305 aa  136  5e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.228485 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2339  LysR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 317 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.243483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06683  transcriptional regulator  28.47 
 
 		 302 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4145  transcriptional regulator, LysR family  30.72 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.687298  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1442  regulatory protein, LysR:LysR, substrate-binding  30.5 
 
 		 315 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1518  transcriptional regulator, LysR family  31.74 
 
 		 317 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.462963  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2605  LysR family transcriptional regulator  33 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.983354  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2575  LysR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 298 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.402222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2482  transcriptional regulator, LysR family  32.75 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5843  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 294 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6079  LysR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 294 aa  134  3e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.929985  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0522  transcriptional regulator, LysR family  31.6 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0670  LysR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.87688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6055  LysR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 294 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.031905  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2865  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4592  LysR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 309 aa  131  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3657  LysR family transcriptional regulator  31.86 
 
 		 342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2002  LysR family transcriptional regulator  30.18 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00230596  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2824  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001040  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 318 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2916  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 300 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4510  LysR family transcriptional regulator  29.49 
 
 		 308 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172827  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3472  LysR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.106111 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2366  transcriptional regulator, LysR family  30.03 
 
 		 300 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1123  LysR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 303 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0583  transcriptional regulator, LysR family  32.42 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4053  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4313  LysR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 302 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3240  LysR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 305 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2711  LysR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 303 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2190  transcriptional regulator, LysR family  31.71 
 
 		 304 aa  129  6e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0283977  normal  0.469173 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01082  transcriptional regulator  31.79 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.0000539431  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06237  transcriptional regulator  31.79 
 
 		 337 aa  129  6e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.926001  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05302  transcription regulator protein  32.99 
 
 		 329 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2821  LysR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 306 aa  129  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0445002  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0938  transcriptional regulator, LysR family  28.62 
 
 		 306 aa  128  9.000000000000001e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2375  transcriptional regulator, LysR family  31.12 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00507322  normal  0.595951 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2753  LysR family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1116  LysR family transcriptional regulator  30.03 
 
 		 316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4320  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 298 aa  128  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.270334 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6165  transcriptional regulator, LysR family  31.1 
 
 		 310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516449  normal  0.771556 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2697  transcriptional regulator, LysR family  29.35 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3230  regulatory protein, LysR  26.85 
 
 		 298 aa  127  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.796191 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2957  transcriptional regulator, LysR family  28.52 
 
 		 306 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014906 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39160  LysR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 311 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.255585  normal  0.408672 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1678  transcriptional regulator, LysR family  31.62 
 
 		 305 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2001  LysR family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 300 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0200858  normal  0.0149686 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1296  LysR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 301 aa  126  4.0000000000000003e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3196  transcriptional regulator, LysR family  29.07 
 
 		 304 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00241672  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1970  LysR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 399 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0677  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0583  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 299 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.824085  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1975  LysR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 299 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0760524  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2063  transcriptional regulator, LysR family  31.33 
 
 		 295 aa  125  6e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.656887 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1689  transcriptional regulator, substrate-binding of LysR family protein  30 
 
 		 300 aa  126  6e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1132  LysR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 303 aa  125  8.000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0177356 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0984  LysR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0549  LysR family transcriptional regulator  31.6 
 
 		 322 aa  125  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1650  transcriptional regulator, LysR family  30.67 
 
 		 311 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.190227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5239  transcriptional regulator, LysR family  29.29 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0579  transcriptional regulator, LysR family  32.29 
 
 		 319 aa  124  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3613  LysR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000514722  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5396  LysR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 304 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal  0.350527 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3059  LysR family transcriptional regulator  30.58 
 
 		 310 aa  125  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1103  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1883  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0921981  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1730  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.403048  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1545  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3528  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.365912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4604  transcriptional regulator, LysR family  30.9 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0208  LysR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00341225  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1929  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 308 aa  124  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29440  LysR family transcriptional regulator  30.8 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0615  LysR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.683803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2122  LysR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 293 aa  123  3e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.874672  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0900  LysR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 300 aa  124  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3335  putative transcriptional regulator  32.12 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.661224  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6327  LysR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 291 aa  123  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47830  transcription regulator pirR  28.77 
 
 		 293 aa  123  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.850432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0401  LysR family transcriptional regulator  29.62 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0930057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2310  LysR family transcriptional regulator  32.73 
 
 		 306 aa  123  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.106098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000421  transcriptional regulator  26.9 
 
 		 328 aa  123  4e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.423035  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2087  LysR family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 318 aa  122  5e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0306399  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3189  LysR family transcriptional regulator  30.31 
 
 		 302 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.77747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4929  transcriptional regulator, LysR family  30 
 
 		 301 aa  123  5e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00665073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>