94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0180 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0180  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  690    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1244  hypothetical protein  33.33 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881206 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1140  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  31.66 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3021  hypothetical protein  35.46 
 
 		 401 aa  157  3e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1141  hypothetical protein  29.79 
 
 		 336 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1972  ABC-type sugar transport system, ATPase component  28.94 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2568  hypothetical protein  30.72 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1583  hypothetical protein  29.11 
 
 		 315 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4292  hypothetical protein  25.24 
 
 		 346 aa  114  3e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000159214 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1509  diguanylate cyclase  30.11 
 
 		 835 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0192657  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2622  hypothetical protein  30.27 
 
 		 330 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.161773  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4029  hypothetical protein  26.73 
 
 		 335 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0226  hypothetical protein  27.41 
 
 		 334 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00330504  unclonable  0.0000000000368394 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0226  hypothetical protein  26.73 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0465216  normal  0.0653246 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0226  hypothetical protein  26.77 
 
 		 334 aa  107  4e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276636  unclonable  0.0000000000664579 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0240  hypothetical protein  27.3 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0655032  unclonable  0.00000986847 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0223  hypothetical protein  26.73 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.016326  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0185  hypothetical protein  24.61 
 
 		 325 aa  104  3e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001088  hitchhiker  0.00158714 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0911  sensory box histidine kinase  26.65 
 
 		 581 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2242  ABC-type sugar transport system, ATPase component  26.22 
 
 		 324 aa  100  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.883612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2569  hypothetical protein  28.04 
 
 		 348 aa  99.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1017  hypothetical protein  26.53 
 
 		 349 aa  95.5  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.48 
 
 		 916 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  25.67 
 
 		 775 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  27.13 
 
 		 1246 aa  85.5  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0273  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.64 
 
 		 917 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  26.33 
 
 		 862 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1057  hypothetical protein  22.92 
 
 		 725 aa  84.7  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2075  signal transduction protein  22.94 
 
 		 988 aa  84  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1837  diguanylate cyclase  25 
 
 		 544 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.980403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3102  GGDEF domain-containing protein  24.36 
 
 		 580 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  23.98 
 
 		 1121 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  25.99 
 
 		 867 aa  75.9  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 		 833 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.73 
 
 		 1140 aa  75.5  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  24.84 
 
 		 779 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  27.41 
 
 		 794 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.01 
 
 		 842 aa  74.7  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0626  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.59 
 
 		 856 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.29 
 
 		 1151 aa  72.8  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2313  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.41 
 
 		 981 aa  72.4  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.762814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  23.73 
 
 		 882 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  23.03 
 
 		 758 aa  70.9  0.00000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2138  metal dependent phosphohydrolase  23.61 
 
 		 606 aa  70.1  0.00000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258694  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.94 
 
 		 1101 aa  70.1  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0926  sensory box protein  25.08 
 
 		 1063 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.39 
 
 		 1050 aa  69.3  0.00000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  20.85 
 
 		 1019 aa  68.9  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  22.49 
 
 		 728 aa  68.6  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00528  hypothetical protein  23.71 
 
 		 1049 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.57 
 
 		 1191 aa  66.6  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3914  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.46 
 
 		 918 aa  65.5  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.161625  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001950  sensory box/GGDEF family protein  23.49 
 
 		 1041 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  24.62 
 
 		 333 aa  64.7  0.000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.83 
 
 		 802 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43493  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.37 
 
 		 962 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.4 
 
 		 1039 aa  63.5  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.08 
 
 		 954 aa  63.2  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.993227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 		 793 aa  60.1  0.00000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.64 
 
 		 868 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.371238 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3101  hypothetical protein  22.61 
 
 		 757 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  19.8 
 
 		 1309 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  21.4 
 
 		 617 aa  58.5  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  24.12 
 
 		 774 aa  56.6  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  21.64 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  24.34 
 
 		 328 aa  56.2  0.0000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0677  sensory box/GGDEF family protein  23.13 
 
 		 947 aa  55.5  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000825914  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0744  ATP-binding region ATPase domain protein  24.18 
 
 		 616 aa  54.7  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.85 
 
 		 347 aa  53.5  0.000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  25.38 
 
 		 337 aa  53.5  0.000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2290  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.36 
 
 		 975 aa  52  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.27 
 
 		 327 aa  51.2  0.00003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  23.46 
 
 		 331 aa  50.4  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.43 
 
 		 1054 aa  49.7  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  21.59 
 
 		 334 aa  49.3  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2818  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  24.6 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  24.33 
 
 		 324 aa  48.9  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5660  hypothetical protein  25.27 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  26.15 
 
 		 341 aa  48.1  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  22.04 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  26.13 
 
 		 329 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  22.35 
 
 		 740 aa  47.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0591  putative membrane associated signaling protein  20.21 
 
 		 596 aa  45.8  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  26.53 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4781  protein of unknown function DUF534  21.74 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5656  hypothetical protein  25.46 
 
 		 328 aa  44.3  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  22.22 
 
 		 298 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  21.66 
 
 		 1154 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  21.89 
 
 		 317 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2628  hypothetical protein  37.31 
 
 		 381 aa  43.5  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  23.57 
 
 		 349 aa  42.7  0.009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  21.86 
 
 		 326 aa  42.7  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  23.08 
 
 		 341 aa  42.7  0.01  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  23.81 
 
 		 327 aa  42.7  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>