115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2818 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_2818  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  100 
 
 		 326 aa  657    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2904  hypothetical protein  37.3 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  31.19 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0039  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  30.77 
 
 		 327 aa  136  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  28.92 
 
 		 365 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  32.64 
 
 		 328 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  34.05 
 
 		 354 aa  127  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1048  hypothetical protein  32.89 
 
 		 344 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  31.23 
 
 		 329 aa  124  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6911  hypothetical protein  31.82 
 
 		 329 aa  119  9e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4781  protein of unknown function DUF534  30.24 
 
 		 334 aa  119  9e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7008  hypothetical protein  34.25 
 
 		 328 aa  116  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  27.96 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1481  hypothetical protein  27.94 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5660  hypothetical protein  29.64 
 
 		 325 aa  105  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6747  hypothetical protein  29.73 
 
 		 331 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5656  hypothetical protein  28.57 
 
 		 328 aa  99.8  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5292  hypothetical protein  29.51 
 
 		 327 aa  96.3  6e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.562532  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  25 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  27.07 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  24.55 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  26.35 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  25.63 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  24.36 
 
 		 341 aa  74.3  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  25.11 
 
 		 329 aa  73.9  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  24.75 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2628  hypothetical protein  23.75 
 
 		 381 aa  73.2  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  25.2 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  24.07 
 
 		 337 aa  71.2  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  25 
 
 		 319 aa  71.6  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  23.6 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  24.32 
 
 		 340 aa  70.5  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.81 
 
 		 327 aa  70.1  0.00000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  24.22 
 
 		 330 aa  68.9  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  23.04 
 
 		 317 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  23.27 
 
 		 344 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  22.54 
 
 		 344 aa  67  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  23.18 
 
 		 324 aa  65.5  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  22.12 
 
 		 317 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.4 
 
 		 321 aa  64.3  0.000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  26.14 
 
 		 336 aa  63.9  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  22.98 
 
 		 328 aa  63.5  0.000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  25.37 
 
 		 322 aa  63.5  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  22.74 
 
 		 331 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  25.1 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  24.66 
 
 		 331 aa  61.6  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  24.55 
 
 		 321 aa  61.2  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  22.22 
 
 		 324 aa  60.8  0.00000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  23.11 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  22.69 
 
 		 292 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  21.78 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  27.5 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  24.15 
 
 		 320 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  22.03 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  23.65 
 
 		 298 aa  58.9  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  21.2 
 
 		 317 aa  59.3  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  23.64 
 
 		 323 aa  58.2  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  24.56 
 
 		 347 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  21.96 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  22.92 
 
 		 323 aa  56.6  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  22.32 
 
 		 334 aa  56.2  0.0000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  22.67 
 
 		 322 aa  56.2  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  25.5 
 
 		 341 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  22.67 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  23.56 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  24.38 
 
 		 270 aa  54.7  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  23.11 
 
 		 325 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0056  hypothetical protein  51.11 
 
 		 154 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.938573 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  25.1 
 
 		 341 aa  54.3  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  18.8 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  22.36 
 
 		 324 aa  53.9  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  24.56 
 
 		 332 aa  53.9  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2999  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  22.61 
 
 		 350 aa  53.5  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000215349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  22.83 
 
 		 332 aa  52.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  25.11 
 
 		 320 aa  52.4  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  22.98 
 
 		 640 aa  52  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  21.05 
 
 		 343 aa  52  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  23.17 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2525  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  21.98 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285848  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  23.56 
 
 		 326 aa  50.8  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  21.17 
 
 		 344 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  23.11 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  20.65 
 
 		 337 aa  49.7  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.36 
 
 		 352 aa  49.7  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3330  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.76 
 
 		 385 aa  49.7  0.00007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.430649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  22.08 
 
 		 327 aa  49.7  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  22.42 
 
 		 328 aa  49.3  0.00009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  22.07 
 
 		 323 aa  48.9  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  22.69 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0180  hypothetical protein  24.6 
 
 		 335 aa  48.9  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  21.17 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.62 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  19.72 
 
 		 359 aa  48.1  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  22.97 
 
 		 323 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  22.75 
 
 		 319 aa  47  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  23.4 
 
 		 320 aa  46.6  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3331  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.86 
 
 		 386 aa  45.8  0.0009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.000133768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  20.72 
 
 		 323 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  22.18 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>