110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2628 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2628  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  771    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4781  protein of unknown function DUF534  25.07 
 
 		 334 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6911  hypothetical protein  26.78 
 
 		 329 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  27.52 
 
 		 340 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  25.76 
 
 		 333 aa  85.9  0.000000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  25.86 
 
 		 324 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  27.12 
 
 		 354 aa  82.8  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  28.81 
 
 		 319 aa  82.4  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  25.16 
 
 		 322 aa  79.3  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  26.09 
 
 		 325 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  26.87 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  25.8 
 
 		 325 aa  75.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  27.08 
 
 		 321 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  22.64 
 
 		 324 aa  75.1  0.000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  25.68 
 
 		 321 aa  73.2  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2818  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.75 
 
 		 326 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  25.72 
 
 		 317 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.07 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  24.74 
 
 		 329 aa  71.6  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  25 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  27.27 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  25.17 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  24.91 
 
 		 317 aa  70.1  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  22.22 
 
 		 334 aa  70.1  0.00000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  25.68 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  25.54 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  24.92 
 
 		 319 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  24.75 
 
 		 324 aa  69.3  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.94 
 
 		 347 aa  68.6  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  24.54 
 
 		 337 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  22.15 
 
 		 584 aa  67.8  0.0000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  23.83 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5292  hypothetical protein  25.49 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.562532  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  24.18 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  24.65 
 
 		 317 aa  67  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  27.02 
 
 		 320 aa  66.6  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  26.51 
 
 		 337 aa  66.6  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  20.96 
 
 		 334 aa  65.9  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  23.29 
 
 		 343 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  24.24 
 
 		 344 aa  64.3  0.000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  23.91 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  24.58 
 
 		 323 aa  64.3  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  23.03 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.47 
 
 		 321 aa  63.9  0.000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25 
 
 		 321 aa  63.5  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  23.21 
 
 		 335 aa  62.8  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  22.81 
 
 		 341 aa  62  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  24.66 
 
 		 323 aa  62  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  26.51 
 
 		 344 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  26.74 
 
 		 344 aa  62  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  24.13 
 
 		 338 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0039  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  25 
 
 		 327 aa  62  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  22.1 
 
 		 341 aa  62  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  22.54 
 
 		 320 aa  61.2  0.00000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  25 
 
 		 320 aa  60.8  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1048  hypothetical protein  25.4 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.53 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  22.29 
 
 		 341 aa  60.1  0.00000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5656  hypothetical protein  24.92 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  21.62 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  26.09 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1481  hypothetical protein  23.69 
 
 		 336 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  22.66 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.29 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  22.3 
 
 		 324 aa  57  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  23.34 
 
 		 327 aa  57  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2904  hypothetical protein  21.88 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  25.86 
 
 		 292 aa  56.2  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  22.87 
 
 		 329 aa  56.2  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  23.71 
 
 		 324 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  23.43 
 
 		 326 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  23.1 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  22.94 
 
 		 329 aa  54.3  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  23.3 
 
 		 270 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  24.84 
 
 		 331 aa  53.9  0.000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  27.47 
 
 		 315 aa  53.9  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  24 
 
 		 349 aa  53.5  0.000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5660  hypothetical protein  24.67 
 
 		 325 aa  52.8  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  23.05 
 
 		 365 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  22.39 
 
 		 323 aa  51.6  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  22.81 
 
 		 331 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  22.71 
 
 		 328 aa  51.2  0.00003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  26.03 
 
 		 322 aa  51.6  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  23.84 
 
 		 349 aa  50.4  0.00004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  26.19 
 
 		 355 aa  50.4  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  21.2 
 
 		 359 aa  50.4  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6747  hypothetical protein  18.89 
 
 		 331 aa  49.7  0.00009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  22.15 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7008  hypothetical protein  25.08 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  24.09 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  24.5 
 
 		 332 aa  49.7  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  22.36 
 
 		 323 aa  46.6  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.36 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.36 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.36 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.36 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.82 
 
 		 323 aa  45.4  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  24.8 
 
 		 336 aa  45.4  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  25.57 
 
 		 640 aa  45.4  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2999  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  29.37 
 
 		 350 aa  45.1  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000215349  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>