139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1461 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  98.77 
 
 		 326 aa  638    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  100 
 
 		 326 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  88.45 
 
 		 329 aa  554  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  80.77 
 
 		 322 aa  498  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  76.99 
 
 		 323 aa  491  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  78.66 
 
 		 323 aa  488  1e-137  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  78.37 
 
 		 321 aa  486  1e-136  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  78.37 
 
 		 321 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  78.37 
 
 		 321 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  78.37 
 
 		 321 aa  486  1e-136  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  78.05 
 
 		 323 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  78.05 
 
 		 323 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  78.05 
 
 		 323 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  78.05 
 
 		 323 aa  483  1e-135  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  77.74 
 
 		 323 aa  481  1e-135  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  78.05 
 
 		 323 aa  483  1e-135  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  78.06 
 
 		 321 aa  483  1e-135  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  77.74 
 
 		 323 aa  479  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  75.59 
 
 		 322 aa  451  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  74.92 
 
 		 322 aa  448  1e-125  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  69.63 
 
 		 325 aa  445  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  69.02 
 
 		 325 aa  441  1e-123  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  74.24 
 
 		 323 aa  439  9.999999999999999e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  71.86 
 
 		 344 aa  425  1e-118  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  69.54 
 
 		 323 aa  412  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  66.44 
 
 		 324 aa  406  1.0000000000000001e-112  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  58.64 
 
 		 343 aa  347  2e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  56.61 
 
 		 341 aa  329  3e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  56.61 
 
 		 341 aa  329  4e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  50 
 
 		 324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  57.55 
 
 		 317 aa  316  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  53.72 
 
 		 316 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  53.22 
 
 		 323 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  52.72 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  55.71 
 
 		 319 aa  309  2.9999999999999997e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  57.19 
 
 		 321 aa  304  1.0000000000000001e-81  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  52.38 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  56.83 
 
 		 321 aa  301  1e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  52.04 
 
 		 317 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  50 
 
 		 349 aa  296  3e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  49.15 
 
 		 349 aa  293  3e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  50 
 
 		 370 aa  291  9e-78  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  50.17 
 
 		 322 aa  283  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  47.19 
 
 		 321 aa  276  4e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  45.25 
 
 		 321 aa  273  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  45.45 
 
 		 325 aa  266  5e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  44.48 
 
 		 327 aa  258  7e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  44.33 
 
 		 329 aa  248  1e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  45.07 
 
 		 341 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  42.52 
 
 		 337 aa  241  9e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  42.17 
 
 		 320 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.21 
 
 		 584 aa  234  2.0000000000000002e-60  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  44.79 
 
 		 337 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  43.34 
 
 		 338 aa  228  1e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  40.48 
 
 		 329 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  43.1 
 
 		 332 aa  224  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  42.56 
 
 		 335 aa  224  2e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  43.1 
 
 		 332 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  39.06 
 
 		 324 aa  223  3e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  42.56 
 
 		 330 aa  209  7e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  40.63 
 
 		 340 aa  206  6e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  40.13 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  39.3 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  46.05 
 
 		 270 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  35.95 
 
 		 320 aa  195  8.000000000000001e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  40.27 
 
 		 336 aa  193  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  37.37 
 
 		 313 aa  193  4e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  40 
 
 		 319 aa  189  4e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  39.52 
 
 		 328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  37.85 
 
 		 331 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  35.69 
 
 		 331 aa  182  5.0000000000000004e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  33.64 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  37 
 
 		 359 aa  180  2.9999999999999997e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  35.47 
 
 		 328 aa  176  5e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  37.87 
 
 		 298 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  34.14 
 
 		 347 aa  168  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  34.62 
 
 		 331 aa  166  5.9999999999999996e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  33.22 
 
 		 334 aa  165  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  32.54 
 
 		 334 aa  163  3e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  31.43 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  34.15 
 
 		 329 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  32.98 
 
 		 640 aa  143  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  28.12 
 
 		 327 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  35.62 
 
 		 322 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  28.57 
 
 		 344 aa  126  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.86 
 
 		 352 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  29.76 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  27.82 
 
 		 344 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  29.84 
 
 		 320 aa  119  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  30.86 
 
 		 384 aa  115  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  26.05 
 
 		 320 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  26.94 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  30.65 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  26.94 
 
 		 324 aa  105  1e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  29.1 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  28.87 
 
 		 309 aa  96.7  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  27.94 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  27.97 
 
 		 292 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  27.78 
 
 		 336 aa  89  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  27.99 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>