136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMA10247_2907 on replicon NC_009080
Organism: Burkholderia mallei NCTC 10247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  99.69 
 
 
323 aa  634    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  99.69 
 
 
323 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 
323 aa  637    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 
323 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 
323 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  99.69 
 
 
323 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 
323 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  97.52 
 
 
323 aa  625  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  93.5 
 
 
321 aa  567  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  92.88 
 
 
321 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  92.88 
 
 
321 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  92.88 
 
 
321 aa  565  1e-160  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  92.57 
 
 
321 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  84.88 
 
 
322 aa  533  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  83.64 
 
 
323 aa  530  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  82.03 
 
 
326 aa  478  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  81.36 
 
 
326 aa  475  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  78.93 
 
 
329 aa  464  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  73.06 
 
 
322 aa  433  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  72.39 
 
 
322 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  69.64 
 
 
325 aa  426  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  72.52 
 
 
323 aa  426  1e-118  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  69.31 
 
 
325 aa  423  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  70.51 
 
 
344 aa  409  1e-113  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  68.46 
 
 
323 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  64.07 
 
 
324 aa  385  1e-106  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  55.85 
 
 
343 aa  336  3.9999999999999995e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  55.25 
 
 
341 aa  322  7e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  55.25 
 
 
341 aa  321  8e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  55.56 
 
 
319 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  55.03 
 
 
316 aa  315  9e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  51.83 
 
 
323 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  49.49 
 
 
324 aa  305  6e-82  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  52.38 
 
 
317 aa  303  3.0000000000000004e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  52.38 
 
 
317 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  52.38 
 
 
317 aa  297  1e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  51.88 
 
 
317 aa  295  5e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  50.33 
 
 
370 aa  289  6e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.22 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  48.14 
 
 
349 aa  282  6.000000000000001e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  47.96 
 
 
349 aa  281  9e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  51.88 
 
 
321 aa  280  2e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  46.96 
 
 
322 aa  265  8.999999999999999e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  45.37 
 
 
321 aa  263  2e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  43.48 
 
 
321 aa  260  2e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  43.4 
 
 
325 aa  253  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.52 
 
 
327 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  43.42 
 
 
341 aa  239  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  42.27 
 
 
329 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  41.98 
 
 
320 aa  233  3e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  40.44 
 
 
324 aa  228  9e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  41.54 
 
 
337 aa  227  2e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  39.8 
 
 
337 aa  222  6e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  38.44 
 
 
329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.81 
 
 
584 aa  220  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  38.14 
 
 
335 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  40.55 
 
 
332 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  40.21 
 
 
332 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  38.87 
 
 
338 aa  204  2e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  39.94 
 
 
340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  41.05 
 
 
330 aa  200  3e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  36.19 
 
 
320 aa  195  1e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  39.3 
 
 
322 aa  193  3e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  39.18 
 
 
320 aa  191  1e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  42.19 
 
 
270 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  40.07 
 
 
336 aa  189  7e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  35.14 
 
 
334 aa  188  1e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  34.59 
 
 
333 aa  186  5e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  35.84 
 
 
313 aa  184  1.0000000000000001e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  35.05 
 
 
328 aa  183  3e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  40 
 
 
319 aa  181  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  35.19 
 
 
359 aa  179  4.999999999999999e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  37.59 
 
 
328 aa  176  7e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  35.29 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  35.08 
 
 
331 aa  173  3.9999999999999995e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  34.6 
 
 
347 aa  168  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  34.62 
 
 
331 aa  168  1e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  36.23 
 
 
298 aa  167  2e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  30.61 
 
 
329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  30.77 
 
 
334 aa  154  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  33.02 
 
 
640 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  29.39 
 
 
327 aa  151  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  35.1 
 
 
322 aa  151  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  33.91 
 
 
329 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.64 
 
 
344 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  29.29 
 
 
344 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  33.19 
 
 
384 aa  122  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.23 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  28.85 
 
 
355 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  30.83 
 
 
320 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  26.07 
 
 
322 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  25.34 
 
 
320 aa  108  1e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  25.93 
 
 
324 aa  108  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  31.98 
 
 
297 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  28.92 
 
 
354 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  28.57 
 
 
309 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  29.06 
 
 
329 aa  94  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  30.97 
 
 
287 aa  90.9  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  27.9 
 
 
328 aa  90.1  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  28.51 
 
 
298 aa  88.2  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>