112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5660 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5660  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  649    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7008  hypothetical protein  36.88 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5656  hypothetical protein  37.39 
 
 		 328 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6747  hypothetical protein  31.13 
 
 		 331 aa  157  3e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5292  hypothetical protein  38.87 
 
 		 327 aa  153  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.562532  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  34.74 
 
 		 328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  31.23 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  33.23 
 
 		 326 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  32.02 
 
 		 329 aa  139  7e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6911  hypothetical protein  30.38 
 
 		 329 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  32.98 
 
 		 354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1048  hypothetical protein  32.49 
 
 		 344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2904  hypothetical protein  32.98 
 
 		 320 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0039  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  32.23 
 
 		 327 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  30.03 
 
 		 365 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1481  hypothetical protein  29.67 
 
 		 336 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4781  protein of unknown function DUF534  27.84 
 
 		 334 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2818  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  29.64 
 
 		 326 aa  105  8e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  26.49 
 
 		 335 aa  88.6  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  28.81 
 
 		 321 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  27.1 
 
 		 329 aa  87  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  27.98 
 
 		 317 aa  85.9  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  27.5 
 
 		 317 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  25.54 
 
 		 316 aa  84.3  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  27.5 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.76 
 
 		 334 aa  83.2  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  28.57 
 
 		 309 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  25.26 
 
 		 584 aa  82  0.00000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  27.85 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.4 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  27.2 
 
 		 317 aa  79  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.4 
 
 		 321 aa  78.2  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  27.37 
 
 		 330 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  26.81 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  25.2 
 
 		 326 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  23.79 
 
 		 337 aa  75.1  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  24.14 
 
 		 329 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  26.21 
 
 		 322 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  25.6 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  23.36 
 
 		 333 aa  73.2  0.000000000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  23.77 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  26.75 
 
 		 320 aa  72.8  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  25.4 
 
 		 329 aa  72.8  0.000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  25 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  25 
 
 		 321 aa  72.8  0.000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  26.48 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.24 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  24.9 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  24.91 
 
 		 329 aa  69.7  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  24.89 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  22.8 
 
 		 341 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  25.4 
 
 		 324 aa  69.3  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  25.88 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  26.18 
 
 		 319 aa  68.2  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  24.4 
 
 		 321 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  23.78 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.6 
 
 		 347 aa  66.2  0.0000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.82 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  28.17 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  21.82 
 
 		 323 aa  65.9  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  24.19 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  21.82 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  24.32 
 
 		 341 aa  65.1  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  23.6 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  23.6 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.82 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.82 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.82 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.82 
 
 		 323 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  24 
 
 		 321 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  23.6 
 
 		 321 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  24.6 
 
 		 324 aa  65.1  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  24.59 
 
 		 320 aa  65.1  0.000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.12 
 
 		 323 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  25.68 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  24.07 
 
 		 341 aa  63.5  0.000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  28.69 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  23.2 
 
 		 323 aa  63.5  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  22.76 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  27.75 
 
 		 336 aa  62.8  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  24.11 
 
 		 329 aa  62  0.00000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.14 
 
 		 327 aa  62  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  22.8 
 
 		 322 aa  61.2  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  22.71 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.79 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  22.71 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  22.65 
 
 		 320 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  24.58 
 
 		 297 aa  59.3  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  22.4 
 
 		 322 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  22.85 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  22.27 
 
 		 334 aa  57.8  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  23.43 
 
 		 336 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  26.27 
 
 		 340 aa  57.8  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  25.19 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  22.89 
 
 		 320 aa  57  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  26.74 
 
 		 270 aa  53.9  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  21.15 
 
 		 331 aa  54.3  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2628  hypothetical protein  24.67 
 
 		 381 aa  52.8  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  23.69 
 
 		 338 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  23.68 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>