137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0522 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  99.69 
 
 
323 aa  635    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  99.69 
 
 
323 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  99.69 
 
 
323 aa  635    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  100 
 
 
323 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  99.69 
 
 
323 aa  635    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  99.38 
 
 
323 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  99.38 
 
 
323 aa  633  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  97.21 
 
 
323 aa  623  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  93.19 
 
 
321 aa  565  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  92.57 
 
 
321 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  92.57 
 
 
321 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  92.57 
 
 
321 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  92.26 
 
 
321 aa  560  1e-158  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  84.57 
 
 
322 aa  531  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  83.33 
 
 
323 aa  527  1e-149  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  81.69 
 
 
326 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  81.02 
 
 
326 aa  474  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  78.6 
 
 
329 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  72.73 
 
 
322 aa  431  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  72.05 
 
 
322 aa  429  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  69.31 
 
 
325 aa  424  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  68.98 
 
 
325 aa  421  1e-117  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  72.19 
 
 
323 aa  424  1e-117  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  70.17 
 
 
344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  68.12 
 
 
323 aa  398  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  63.73 
 
 
324 aa  383  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  55.85 
 
 
343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  55.25 
 
 
341 aa  322  4e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  55.25 
 
 
341 aa  322  5e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  55.56 
 
 
319 aa  320  9.999999999999999e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  55.37 
 
 
316 aa  316  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  51.83 
 
 
323 aa  305  7e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  52.72 
 
 
317 aa  305  8.000000000000001e-82  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  49.15 
 
 
324 aa  303  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  52.72 
 
 
317 aa  300  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  52.72 
 
 
317 aa  299  3e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  51.88 
 
 
317 aa  297  2e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  50 
 
 
370 aa  287  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  52.22 
 
 
321 aa  285  8e-76  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  48.14 
 
 
349 aa  283  3.0000000000000004e-75  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  47.96 
 
 
349 aa  282  4.0000000000000003e-75  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  51.88 
 
 
321 aa  281  8.000000000000001e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  45.69 
 
 
321 aa  265  7e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  46.62 
 
 
322 aa  263  3e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  43.79 
 
 
321 aa  262  6e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  43.4 
 
 
325 aa  253  3e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.52 
 
 
327 aa  245  6.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  43.09 
 
 
341 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  41.92 
 
 
329 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  41.98 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  40.44 
 
 
324 aa  229  4e-59  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  41.23 
 
 
337 aa  225  6e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  39.8 
 
 
337 aa  223  2e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  38.44 
 
 
329 aa  222  8e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.81 
 
 
584 aa  220  3e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  38.14 
 
 
335 aa  215  5.9999999999999996e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  40.55 
 
 
332 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  40.21 
 
 
332 aa  210  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  38.54 
 
 
338 aa  202  6e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  39.62 
 
 
340 aa  199  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  41.05 
 
 
330 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  36.51 
 
 
320 aa  196  3e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  39.3 
 
 
322 aa  194  2e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  39.52 
 
 
320 aa  193  3e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  41.77 
 
 
270 aa  189  4e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  39.73 
 
 
336 aa  187  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  34.8 
 
 
334 aa  186  4e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  34.88 
 
 
328 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  34.25 
 
 
333 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  40.35 
 
 
319 aa  182  6e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  35.49 
 
 
313 aa  182  6e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  34.88 
 
 
359 aa  177  2e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  35.08 
 
 
331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  37.24 
 
 
328 aa  174  2.9999999999999996e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  34.95 
 
 
331 aa  172  7.999999999999999e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  34.6 
 
 
347 aa  169  6e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  36.23 
 
 
298 aa  169  7e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  33.79 
 
 
331 aa  166  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  30.3 
 
 
329 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  30.77 
 
 
334 aa  155  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  35.1 
 
 
322 aa  151  1e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  29.39 
 
 
327 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  32.72 
 
 
640 aa  150  4e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  34.26 
 
 
329 aa  145  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.29 
 
 
344 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  28.93 
 
 
344 aa  125  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  29.62 
 
 
352 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  33.19 
 
 
384 aa  124  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  29.23 
 
 
355 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  30.83 
 
 
320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  26.43 
 
 
322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  25.34 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  26.3 
 
 
324 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  31.98 
 
 
297 aa  105  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  28.57 
 
 
309 aa  96.3  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  28.57 
 
 
354 aa  95.1  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  28.26 
 
 
328 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  28.68 
 
 
329 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  28.94 
 
 
298 aa  90.1  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  30.51 
 
 
287 aa  89.7  6e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>