127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3116 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  100 
 
 		 309 aa  624  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  94.52 
 
 		 292 aa  567  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  59.55 
 
 		 320 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  55.34 
 
 		 320 aa  369  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  52.27 
 
 		 324 aa  347  2e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  31.72 
 
 		 316 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  27.3 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  30.29 
 
 		 335 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  27.51 
 
 		 343 aa  101  1e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  30.11 
 
 		 317 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.18 
 
 		 321 aa  101  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  29.86 
 
 		 322 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  31.1 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  27.7 
 
 		 341 aa  100  3e-20  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  29.68 
 
 		 321 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  28.14 
 
 		 317 aa  100  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  29.68 
 
 		 321 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  28.72 
 
 		 341 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  26.23 
 
 		 337 aa  99.8  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.18 
 
 		 321 aa  99.8  6e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  28.14 
 
 		 315 aa  99.4  6e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  29.33 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  29.33 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  29.33 
 
 		 321 aa  98.6  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  29.45 
 
 		 321 aa  97.4  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  28.72 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  28.57 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  27.8 
 
 		 317 aa  97.4  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  28.82 
 
 		 323 aa  96.7  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  29.97 
 
 		 322 aa  96.7  4e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  25.61 
 
 		 329 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  28.87 
 
 		 326 aa  96.3  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.57 
 
 		 323 aa  96.3  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  29.37 
 
 		 325 aa  96.3  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  28.62 
 
 		 317 aa  95.9  7e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  28.04 
 
 		 325 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  31.15 
 
 		 319 aa  95.5  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  27.82 
 
 		 320 aa  94.4  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  28.57 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.57 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.57 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.57 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.57 
 
 		 323 aa  94.7  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.62 
 
 		 323 aa  94  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  28.17 
 
 		 326 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  27.8 
 
 		 332 aa  93.6  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  25.08 
 
 		 329 aa  93.6  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  27.7 
 
 		 337 aa  92.8  6e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.22 
 
 		 323 aa  91.7  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  25.22 
 
 		 333 aa  90.1  4e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  28.67 
 
 		 323 aa  89.4  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.71 
 
 		 334 aa  89  9e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.46 
 
 		 327 aa  89  1e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  28.63 
 
 		 329 aa  87.8  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  27.18 
 
 		 336 aa  87.8  2e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  28.98 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  26.22 
 
 		 322 aa  86.3  6e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  27.69 
 
 		 323 aa  84.3  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  24.56 
 
 		 584 aa  84  0.000000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2904  hypothetical protein  26.91 
 
 		 320 aa  83.6  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  27.07 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  28 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  25.52 
 
 		 322 aa  83.2  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5660  hypothetical protein  28.57 
 
 		 325 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  33.33 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  28.83 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  24.54 
 
 		 322 aa  81.6  0.00000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  25.8 
 
 		 340 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  28.36 
 
 		 328 aa  80.9  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  21.74 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  25.09 
 
 		 331 aa  77.4  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  25.89 
 
 		 344 aa  77.8  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  23.4 
 
 		 334 aa  76.3  0.0000000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  24.31 
 
 		 320 aa  75.9  0.0000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  22.38 
 
 		 338 aa  72.8  0.000000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  25.38 
 
 		 349 aa  72.4  0.000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  23.67 
 
 		 328 aa  72.4  0.000000000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  26.05 
 
 		 349 aa  72  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  26.16 
 
 		 324 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.49 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  26.17 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  22.89 
 
 		 329 aa  70.9  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.68 
 
 		 347 aa  70.5  0.00000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  26.35 
 
 		 640 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  26.45 
 
 		 328 aa  69.7  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  26.45 
 
 		 320 aa  69.3  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5292  hypothetical protein  29.63 
 
 		 327 aa  69.7  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.562532  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2525  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  25.71 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  23.65 
 
 		 313 aa  68.9  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  25.65 
 
 		 319 aa  67.8  0.0000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  22.88 
 
 		 370 aa  67.4  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  25 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  23.95 
 
 		 365 aa  66.2  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  24.91 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  22.51 
 
 		 329 aa  65.1  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7008  hypothetical protein  26.72 
 
 		 328 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  23.43 
 
 		 331 aa  63.9  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0039  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  29.39 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  25.64 
 
 		 384 aa  62.8  0.000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  27.8 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>