133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1444 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  100 
 
 		 297 aa  584  1e-166  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1244  hypothetical protein  61.62 
 
 		 336 aa  396  1e-109  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0648578 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  50.67 
 
 		 298 aa  333  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2736  hypothetical protein  40.97 
 
 		 287 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0882  hypothetical protein  44.37 
 
 		 290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.960204  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2388  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  39.85 
 
 		 283 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0995379  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1831  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  39.46 
 
 		 283 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00143408 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1965  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  37.01 
 
 		 298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0577  hypothetical protein  38.33 
 
 		 285 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2901  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  37.12 
 
 		 289 aa  187  1e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1177  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  40.45 
 
 		 282 aa  179  7e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3118  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  39.7 
 
 		 282 aa  172  9e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1359  hypothetical protein  37.08 
 
 		 297 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  31.02 
 
 		 324 aa  108  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  30.45 
 
 		 319 aa  108  1e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  32.39 
 
 		 323 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  31.25 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.98 
 
 		 323 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  30.65 
 
 		 326 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  31.98 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.98 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.98 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.98 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  31.98 
 
 		 323 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  30.65 
 
 		 326 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  30.65 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  30.74 
 
 		 329 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  31.43 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  31.43 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  31.43 
 
 		 321 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  31.43 
 
 		 321 aa  102  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  31.58 
 
 		 323 aa  100  2e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  31.43 
 
 		 321 aa  100  2e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  30.61 
 
 		 323 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  27.8 
 
 		 343 aa  100  2e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  28.22 
 
 		 341 aa  99.4  6e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  27.8 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  31.82 
 
 		 325 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  30.61 
 
 		 321 aa  98.2  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  29.8 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  31.65 
 
 		 325 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  26.01 
 
 		 317 aa  96.3  5e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  29.51 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  25.86 
 
 		 370 aa  95.1  1e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  25.76 
 
 		 317 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  28.95 
 
 		 584 aa  93.6  4e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  25.16 
 
 		 317 aa  92.8  6e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  27.5 
 
 		 317 aa  92.8  6e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  29.58 
 
 		 323 aa  91.7  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  29.32 
 
 		 322 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  28.81 
 
 		 325 aa  91.3  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  27.08 
 
 		 321 aa  90.1  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  28.03 
 
 		 327 aa  90.1  4e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  30.33 
 
 		 349 aa  89  8e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  27.71 
 
 		 321 aa  88.6  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  29.96 
 
 		 344 aa  87.8  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  29.91 
 
 		 322 aa  87.4  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  30.29 
 
 		 349 aa  87  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.67 
 
 		 321 aa  87  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  28.81 
 
 		 324 aa  86.7  4e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  29.49 
 
 		 323 aa  86.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  29.49 
 
 		 322 aa  85.9  7e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  28.46 
 
 		 329 aa  85.9  8e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3415  hypothetical protein  29.57 
 
 		 321 aa  84.7  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.952099  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  24.79 
 
 		 334 aa  82.8  0.000000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  27.08 
 
 		 316 aa  82.4  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  27.74 
 
 		 331 aa  82  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  28.93 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  28.09 
 
 		 323 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  27.31 
 
 		 337 aa  80.1  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1116  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  26.87 
 
 		 304 aa  79.3  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0134  hypothetical protein  26.6 
 
 		 301 aa  79  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.9202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  28.12 
 
 		 338 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  28.63 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  27.02 
 
 		 331 aa  76.6  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  26.95 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  26.02 
 
 		 333 aa  75.5  0.0000000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  26.61 
 
 		 320 aa  75.1  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  27.35 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  29.85 
 
 		 341 aa  75.1  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0553  hypothetical protein  25.88 
 
 		 314 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.5903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  27.73 
 
 		 320 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  28.33 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  26.17 
 
 		 359 aa  72.8  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1661  hypothetical protein  25.99 
 
 		 324 aa  71.6  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.8813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2037  hypothetical protein  30.11 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  27 
 
 		 322 aa  72  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  24.89 
 
 		 335 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  27.43 
 
 		 347 aa  70.1  0.00000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  25.1 
 
 		 329 aa  68.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  27.73 
 
 		 328 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  23.66 
 
 		 298 aa  67  0.0000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  22.36 
 
 		 334 aa  66.2  0.0000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  23.89 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  23.75 
 
 		 327 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4781  protein of unknown function DUF534  22.95 
 
 		 334 aa  64.7  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  25.32 
 
 		 320 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  24.9 
 
 		 324 aa  63.9  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  27.8 
 
 		 292 aa  63.9  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  23.6 
 
 		 330 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>