119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0708 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  100 
 
 
315 aa  642    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  31.88 
 
 
320 aa  126  4.0000000000000003e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  29.38 
 
 
320 aa  125  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  27.9 
 
 
337 aa  117  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  28.04 
 
 
333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  25.81 
 
 
341 aa  109  5e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  27.8 
 
 
324 aa  108  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  31.25 
 
 
331 aa  108  2e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  26.81 
 
 
334 aa  106  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2525  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  26.71 
 
 
352 aa  105  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.285848  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  26.36 
 
 
317 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  26.41 
 
 
335 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  23.58 
 
 
317 aa  100  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  25.36 
 
 
338 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  25.98 
 
 
327 aa  99.8  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  28.14 
 
 
309 aa  99.4  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  25.36 
 
 
329 aa  96.7  5e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  23.18 
 
 
317 aa  95.9  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  28.1 
 
 
319 aa  95.1  1e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  21.84 
 
 
320 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  26.36 
 
 
321 aa  93.6  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  25 
 
 
329 aa  93.6  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  23.18 
 
 
317 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  26.84 
 
 
292 aa  92.8  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  22.63 
 
 
329 aa  92.8  6e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  25 
 
 
320 aa  92  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  26.03 
 
 
321 aa  92  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  25.78 
 
 
340 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  24.89 
 
 
322 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  26.67 
 
 
330 aa  90.1  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  23.27 
 
 
320 aa  89.7  6e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  24.72 
 
 
325 aa  89.4  8e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  26.91 
 
 
336 aa  88.6  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  24.64 
 
 
332 aa  87.8  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  24.35 
 
 
319 aa  87  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  28.38 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  24.58 
 
 
332 aa  86.3  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  26.58 
 
 
334 aa  84.7  0.000000000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  27.48 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  24.14 
 
 
316 aa  84  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  28.18 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  25.09 
 
 
326 aa  84  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  24.45 
 
 
343 aa  83.2  0.000000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  23.44 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  22.95 
 
 
584 aa  81.6  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  28.18 
 
 
322 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  24.62 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  24.79 
 
 
324 aa  79.7  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  22.26 
 
 
331 aa  79  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  26.81 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.99 
 
 
347 aa  77.8  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2818  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  25 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  24.14 
 
 
341 aa  77.4  0.0000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  25.18 
 
 
354 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  24.02 
 
 
341 aa  77  0.0000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  23.18 
 
 
323 aa  77  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  22.65 
 
 
325 aa  76.6  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  28.02 
 
 
328 aa  76.6  0.0000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.45 
 
 
327 aa  75.1  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  21.98 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  24.34 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  24.15 
 
 
324 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  22.55 
 
 
324 aa  73.2  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  23.3 
 
 
323 aa  72.4  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  24.54 
 
 
313 aa  72  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  21.65 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  21.65 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  22.73 
 
 
344 aa  70.9  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7008  hypothetical protein  26.33 
 
 
328 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  22.43 
 
 
270 aa  69.7  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  23.6 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.44 
 
 
359 aa  69.3  0.00000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2904  hypothetical protein  27.11 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  22.75 
 
 
323 aa  69.3  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  25.99 
 
 
298 aa  67.8  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  23.32 
 
 
344 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  24 
 
 
326 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  24.09 
 
 
329 aa  67  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6747  hypothetical protein  25.11 
 
 
331 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  24 
 
 
326 aa  66.6  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  22.08 
 
 
322 aa  65.9  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  24.79 
 
 
329 aa  65.5  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  22.97 
 
 
344 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  27.05 
 
 
322 aa  65.5  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6911  hypothetical protein  28.02 
 
 
329 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  22.84 
 
 
321 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3366  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  25.28 
 
 
359 aa  64.7  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0619415 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0039  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  27.75 
 
 
327 aa  63.9  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  22.58 
 
 
323 aa  63.9  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  21.98 
 
 
321 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  21.98 
 
 
321 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  21.98 
 
 
321 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.13 
 
 
323 aa  62  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  21.98 
 
 
321 aa  62  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.13 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1048  hypothetical protein  25.52 
 
 
344 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  22.13 
 
 
323 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.13 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.13 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.13 
 
 
323 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>