145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1740 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  100 
 
 		 329 aa  651    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  88.45 
 
 		 326 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  88.45 
 
 		 326 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  78.53 
 
 		 322 aa  482  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  77.96 
 
 		 323 aa  479  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  80.34 
 
 		 321 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  75.38 
 
 		 323 aa  472  1e-132  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  80.34 
 
 		 321 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  80.34 
 
 		 321 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  80.34 
 
 		 321 aa  471  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  80.34 
 
 		 321 aa  472  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  75.08 
 
 		 323 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  75.08 
 
 		 323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  75.08 
 
 		 323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  75.08 
 
 		 323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  75.08 
 
 		 323 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  74.77 
 
 		 323 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  74.77 
 
 		 323 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  74.58 
 
 		 322 aa  444  1.0000000000000001e-124  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  73.9 
 
 		 322 aa  441  1e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  68.79 
 
 		 325 aa  437  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  68.15 
 
 		 325 aa  433  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  72.54 
 
 		 323 aa  431  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  71.19 
 
 		 344 aa  419  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  68.87 
 
 		 323 aa  409  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  67.12 
 
 		 324 aa  408  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  57.63 
 
 		 343 aa  345  7e-94  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  55.25 
 
 		 341 aa  326  4.0000000000000003e-88  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  55.25 
 
 		 341 aa  325  5e-88  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  49.53 
 
 		 324 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  51.1 
 
 		 317 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  56.12 
 
 		 317 aa  310  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  52.51 
 
 		 316 aa  309  5e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  54.67 
 
 		 319 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  51.86 
 
 		 323 aa  306  3e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  52.04 
 
 		 317 aa  301  9e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  50.34 
 
 		 349 aa  301  1e-80  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  55.76 
 
 		 321 aa  300  2e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  51.36 
 
 		 317 aa  298  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  55.4 
 
 		 321 aa  296  3e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  50.51 
 
 		 370 aa  296  4e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  49.48 
 
 		 349 aa  295  5e-79  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  48.79 
 
 		 322 aa  279  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  47.06 
 
 		 321 aa  278  1e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  44.94 
 
 		 321 aa  272  5.000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  43.89 
 
 		 325 aa  257  1e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  43.62 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  43.3 
 
 		 329 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  43.08 
 
 		 320 aa  238  8e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  43.69 
 
 		 341 aa  237  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  40.34 
 
 		 337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  43.4 
 
 		 337 aa  226  3e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  42.7 
 
 		 584 aa  226  6e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  42.61 
 
 		 335 aa  222  7e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  42.18 
 
 		 324 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  42.71 
 
 		 332 aa  220  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  39.38 
 
 		 329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  39.25 
 
 		 338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  43.06 
 
 		 332 aa  218  7.999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  41.01 
 
 		 320 aa  209  6e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  44.92 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  41.28 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  38.6 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  45.18 
 
 		 270 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  38.32 
 
 		 340 aa  194  3e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  35.11 
 
 		 320 aa  189  8e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  39.3 
 
 		 319 aa  187  3e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  35.62 
 
 		 313 aa  183  3e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  33.33 
 
 		 333 aa  182  7e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  37.59 
 
 		 359 aa  181  1e-44  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  37.15 
 
 		 331 aa  181  1e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  35.17 
 
 		 328 aa  177  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  34.34 
 
 		 331 aa  176  3e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  37.72 
 
 		 328 aa  177  3e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  35.38 
 
 		 331 aa  173  2.9999999999999996e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  37.69 
 
 		 298 aa  172  5e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  36.9 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  34.02 
 
 		 334 aa  172  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  31.86 
 
 		 334 aa  160  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  31.43 
 
 		 329 aa  159  6e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  36 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  32.98 
 
 		 640 aa  142  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  36.55 
 
 		 322 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  27.48 
 
 		 327 aa  138  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  28.97 
 
 		 344 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  28.57 
 
 		 344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  30.38 
 
 		 352 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1117  hypothetical protein  30.68 
 
 		 355 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  30.65 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0074  protein of unknown function DUF534  28.01 
 
 		 322 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2859  protein of unknown function DUF534  30.8 
 
 		 384 aa  111  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  26.79 
 
 		 320 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  28.47 
 
 		 324 aa  103  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1444  hypothetical protein  30.8 
 
 		 297 aa  103  6e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2427  hypothetical protein  28.66 
 
 		 298 aa  95.9  9e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000824724  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  27.64 
 
 		 328 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  28.57 
 
 		 329 aa  89  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6747  hypothetical protein  28.06 
 
 		 331 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  28.79 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  29.47 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>