123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6747 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_6747  hypothetical protein  100 
 
 
331 aa  671    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0509682 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7008  hypothetical protein  30.6 
 
 
328 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5660  hypothetical protein  31.13 
 
 
325 aa  157  3e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.857486  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5656  hypothetical protein  29.51 
 
 
328 aa  152  5e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  31.94 
 
 
328 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  30.47 
 
 
324 aa  125  7e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6424  hypothetical protein  29.63 
 
 
329 aa  122  6e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.680283  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1048  hypothetical protein  28.2 
 
 
344 aa  122  9e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1052  hypothetical protein  27.86 
 
 
354 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0655813  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6911  hypothetical protein  29.06 
 
 
329 aa  117  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  30.45 
 
 
326 aa  116  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0039  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  27.52 
 
 
327 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  29.21 
 
 
321 aa  113  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5292  hypothetical protein  28.84 
 
 
327 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.562532  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  29.96 
 
 
321 aa  105  8e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  29.21 
 
 
319 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2818  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  29.73 
 
 
326 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  28.09 
 
 
322 aa  102  7e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2904  hypothetical protein  24.72 
 
 
320 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0853596  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  24.33 
 
 
316 aa  97.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  24.71 
 
 
317 aa  97.8  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2884  hypothetical protein  27.57 
 
 
365 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  28.46 
 
 
335 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.1 
 
 
321 aa  93.6  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.48 
 
 
321 aa  93.6  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  24.31 
 
 
324 aa  92.4  9e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  26.16 
 
 
329 aa  92.4  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  23.95 
 
 
317 aa  90.5  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  27.09 
 
 
325 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  23.92 
 
 
324 aa  90.5  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  28.06 
 
 
329 aa  89  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  26.56 
 
 
325 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  26.69 
 
 
322 aa  89  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  27.09 
 
 
323 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  29.52 
 
 
330 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  23.86 
 
 
317 aa  87.8  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  23.86 
 
 
317 aa  87.4  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  26.29 
 
 
322 aa  87  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  22.35 
 
 
324 aa  87.4  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.47 
 
 
323 aa  87  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.47 
 
 
323 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  27.72 
 
 
326 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.47 
 
 
323 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  25.47 
 
 
323 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.47 
 
 
323 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.47 
 
 
323 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.47 
 
 
323 aa  86.7  5e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.47 
 
 
323 aa  86.7  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  27.72 
 
 
326 aa  86.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  26.67 
 
 
337 aa  86.3  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  27.92 
 
 
323 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  24.22 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  27.69 
 
 
322 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  27.09 
 
 
337 aa  84  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  25.58 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4781  protein of unknown function DUF534  25.5 
 
 
334 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  25.58 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  25.58 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  25.58 
 
 
321 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  25.48 
 
 
321 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  24.92 
 
 
341 aa  82.4  0.00000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1481  hypothetical protein  24.14 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  23.6 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  25.29 
 
 
332 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  24.25 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  28.06 
 
 
323 aa  80.1  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  23.97 
 
 
343 aa  79.7  0.00000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  26.35 
 
 
334 aa  78.2  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  28.45 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.27 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  28.89 
 
 
328 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  25.29 
 
 
332 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  25.94 
 
 
323 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  27.55 
 
 
329 aa  75.1  0.000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  22.83 
 
 
340 aa  75.9  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.9 
 
 
325 aa  75.1  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  24.48 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  23.94 
 
 
329 aa  73.6  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  26.94 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  25.56 
 
 
320 aa  72.4  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  24.31 
 
 
322 aa  71.2  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  23.85 
 
 
341 aa  71.6  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  26.27 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  22.53 
 
 
320 aa  69.7  0.00000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  23.75 
 
 
584 aa  67.8  0.0000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  25.11 
 
 
315 aa  67  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  33.33 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  25.57 
 
 
640 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  21.74 
 
 
349 aa  63.2  0.000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  32.71 
 
 
328 aa  62.8  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  24.24 
 
 
347 aa  62.4  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  22.38 
 
 
334 aa  62  0.00000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  25.28 
 
 
338 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  23.1 
 
 
359 aa  61.6  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  22.83 
 
 
349 aa  61.2  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  25.71 
 
 
331 aa  60.8  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  22.31 
 
 
327 aa  59.7  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  20.15 
 
 
370 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  22.35 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  23.81 
 
 
320 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>