139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1473 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  100 
 
 
335 aa  683    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  84.18 
 
 
330 aa  563  1.0000000000000001e-159  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  65.29 
 
 
337 aa  448  1e-125  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  48.19 
 
 
325 aa  305  9.000000000000001e-82  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  46.59 
 
 
341 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000067856  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  46.65 
 
 
329 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  45.36 
 
 
317 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  43.03 
 
 
331 aa  253  3e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  44.75 
 
 
336 aa  247  2e-64  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  45.64 
 
 
321 aa  245  8e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  44.41 
 
 
317 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  45.3 
 
 
321 aa  242  6e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  44.17 
 
 
317 aa  242  6e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  45.45 
 
 
316 aa  241  9e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  41.85 
 
 
328 aa  241  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  43 
 
 
320 aa  239  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  43.49 
 
 
317 aa  239  5e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  43.97 
 
 
325 aa  238  1e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  43.65 
 
 
325 aa  235  6e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  43.71 
 
 
323 aa  235  7e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  44.87 
 
 
329 aa  233  4.0000000000000004e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  42.72 
 
 
337 aa  229  7e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000093059  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  42.57 
 
 
324 aa  227  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  43.45 
 
 
321 aa  227  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  40.34 
 
 
324 aa  225  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  43.31 
 
 
322 aa  225  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  42.71 
 
 
323 aa  225  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  43.01 
 
 
321 aa  225  9e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  43.21 
 
 
326 aa  224  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  37.35 
 
 
338 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  42.86 
 
 
326 aa  223  3e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  0.000000785059 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  42.61 
 
 
322 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  43.82 
 
 
323 aa  222  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  42.61 
 
 
329 aa  222  8e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  43.4 
 
 
323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  38.44 
 
 
323 aa  219  6e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  45.77 
 
 
270 aa  219  6e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  40.71 
 
 
329 aa  219  6e-56  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  41.2 
 
 
344 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  42.36 
 
 
322 aa  218  8.999999999999998e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  41.61 
 
 
322 aa  218  1e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.14 
 
 
323 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.14 
 
 
323 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.14 
 
 
323 aa  217  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.14 
 
 
323 aa  217  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  41.75 
 
 
321 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  41.4 
 
 
323 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  38.14 
 
 
323 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  41.05 
 
 
321 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  41.05 
 
 
321 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  41.05 
 
 
321 aa  215  9.999999999999999e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  37.84 
 
 
323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  39.08 
 
 
324 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  41.05 
 
 
321 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  40.21 
 
 
322 aa  212  7e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  39.86 
 
 
584 aa  211  1e-53  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2494  hypothetical protein  39.73 
 
 
340 aa  210  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  40.21 
 
 
319 aa  210  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  41.43 
 
 
320 aa  210  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  38.49 
 
 
343 aa  208  9e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.62 
 
 
327 aa  207  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  42.01 
 
 
319 aa  206  4e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  39.13 
 
 
341 aa  204  1e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  40.57 
 
 
332 aa  204  2e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  39.44 
 
 
341 aa  202  6e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  40.57 
 
 
332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000204583 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  35.89 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000317435  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  36.05 
 
 
370 aa  182  5.0000000000000004e-45  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  30.5 
 
 
329 aa  178  1e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  35.15 
 
 
349 aa  177  2e-43  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  36.65 
 
 
322 aa  176  6e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  30.92 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  34.35 
 
 
333 aa  172  6.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000138162  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  35.26 
 
 
349 aa  171  1e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  37.11 
 
 
334 aa  170  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1098  hypothetical protein  35.15 
 
 
313 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  33.22 
 
 
334 aa  159  9e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  33.33 
 
 
298 aa  157  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  30.31 
 
 
347 aa  154  2e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000182856  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  31.51 
 
 
328 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  30.65 
 
 
359 aa  148  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1505  hypothetical protein  30.18 
 
 
640 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  31.73 
 
 
327 aa  143  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4371  hypothetical protein  30.85 
 
 
331 aa  135  8e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2289  hypothetical protein  30.29 
 
 
320 aa  117  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1113  hypothetical protein  28.38 
 
 
344 aa  112  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0994451  normal  0.363021 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1116  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  29.21 
 
 
344 aa  112  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3978  hypothetical protein  27.96 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.890464  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0039  putative ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  25 
 
 
327 aa  109  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6721  hypothetical protein  25.27 
 
 
324 aa  105  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  30.29 
 
 
309 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1230  hypothetical protein  26.59 
 
 
320 aa  101  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7008  hypothetical protein  26.17 
 
 
328 aa  100  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0708  protein of unknown function DUF534  26.41 
 
 
315 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1112  ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.87 
 
 
352 aa  98.6  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  29.45 
 
 
292 aa  98.2  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1048  hypothetical protein  25.37 
 
 
344 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  24.82 
 
 
324 aa  97.1  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  26.6 
 
 
326 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6747  hypothetical protein  28.46 
 
 
331 aa  95.9  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0509682 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>