61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1583 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1583  hypothetical protein  100 
 
 		 315 aa  641    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2569  hypothetical protein  47.33 
 
 		 348 aa  288  1e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2568  hypothetical protein  44.77 
 
 		 350 aa  270  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1140  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  29.79 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0180  hypothetical protein  29.11 
 
 		 335 aa  115  6.9999999999999995e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1141  hypothetical protein  28.03 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1244  hypothetical protein  30.34 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881206 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3021  hypothetical protein  28.74 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0911  sensory box histidine kinase  27.42 
 
 		 581 aa  78.6  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1972  ABC-type sugar transport system, ATPase component  32.75 
 
 		 327 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001950  sensory box/GGDEF family protein  34.07 
 
 		 1041 aa  68.9  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1837  diguanylate cyclase  25.17 
 
 		 544 aa  64.7  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.980403  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0273  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.26 
 
 		 917 aa  63.9  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00528  hypothetical protein  32.56 
 
 		 1049 aa  62  0.00000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1509  diguanylate cyclase  25.25 
 
 		 835 aa  61.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0192657  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  24.15 
 
 		 775 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  28 
 
 		 1140 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2242  ABC-type sugar transport system, ATPase component  30.3 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.883612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1017  hypothetical protein  30.17 
 
 		 349 aa  58.5  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.58 
 
 		 1101 aa  58.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0926  sensory box protein  26.57 
 
 		 1063 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.85 
 
 		 916 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.33 
 
 		 1039 aa  57  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  23.55 
 
 		 758 aa  56.6  0.0000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0226  hypothetical protein  33.6 
 
 		 334 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00330504  unclonable  0.0000000000368394 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  25.63 
 
 		 779 aa  55.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0240  hypothetical protein  31.07 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0655032  unclonable  0.00000986847 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1050 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 793 aa  54.7  0.000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2075  signal transduction protein  32.04 
 
 		 988 aa  54.3  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  31.25 
 
 		 740 aa  54.3  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  27.45 
 
 		 617 aa  53.9  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4292  hypothetical protein  22.89 
 
 		 346 aa  53.5  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000159214 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  22.42 
 
 		 728 aa  52.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0226  hypothetical protein  29.63 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0465216  normal  0.0653246 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3116  protein of unknown function DUF534  38.81 
 
 		 309 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4029  hypothetical protein  29.63 
 
 		 335 aa  50.8  0.00003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0223  hypothetical protein  30.17 
 
 		 335 aa  50.4  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.016326  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0226  hypothetical protein  26.09 
 
 		 334 aa  50.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276636  unclonable  0.0000000000664579 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.51 
 
 		 1151 aa  50.1  0.00005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3914  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25 
 
 		 918 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.161625  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 		 833 aa  49.7  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.62 
 
 		 954 aa  49.7  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.993227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1146  protein of unknown function DUF534  38.81 
 
 		 292 aa  49.3  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2622  hypothetical protein  25.81 
 
 		 330 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.161773  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3101  hypothetical protein  22.95 
 
 		 757 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 802 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43493  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1746  hypothetical protein  28.23 
 
 		 324 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.227035 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.91 
 
 		 1309 aa  47.8  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.53 
 
 		 1019 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  29.41 
 
 		 1121 aa  47.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  24.23 
 
 		 862 aa  47  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 962 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  24.79 
 
 		 867 aa  45.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  24.83 
 
 		 774 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0626  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.47 
 
 		 856 aa  44.7  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0185  hypothetical protein  24.77 
 
 		 325 aa  45.1  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001088  hitchhiker  0.00158714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2290  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.57 
 
 		 975 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3102  GGDEF domain-containing protein  24.46 
 
 		 580 aa  43.9  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2388  protein of unknown function DUF534  33.33 
 
 		 326 aa  42.7  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  30.95 
 
 		 882 aa  42.7  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>