70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_0223 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_0223  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  690    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.016326  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0226  hypothetical protein  97.91 
 
 		 335 aa  644    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0465216  normal  0.0653246 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4029  hypothetical protein  96.72 
 
 		 335 aa  648    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000132431 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0226  hypothetical protein  71.57 
 
 		 334 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.276636  unclonable  0.0000000000664579 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0226  hypothetical protein  67.65 
 
 		 334 aa  434  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00330504  unclonable  0.0000000000368394 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4292  hypothetical protein  42.19 
 
 		 346 aa  294  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000159214 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0240  hypothetical protein  41.54 
 
 		 323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0655032  unclonable  0.00000986847 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0185  hypothetical protein  39.94 
 
 		 325 aa  276  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.001088  hitchhiker  0.00158714 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2622  hypothetical protein  40.34 
 
 		 330 aa  225  7e-58  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.161773  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1972  ABC-type sugar transport system, ATPase component  36 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1017  hypothetical protein  36.98 
 
 		 349 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2242  ABC-type sugar transport system, ATPase component  34.15 
 
 		 324 aa  209  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.883612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0180  hypothetical protein  26.13 
 
 		 335 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.570088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0911  sensory box histidine kinase  26.75 
 
 		 581 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1622  putative PAS/PAC sensor protein  26.75 
 
 		 775 aa  103  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0914545  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.67 
 
 		 1019 aa  103  5e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0052  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.85 
 
 		 1054 aa  102  9e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1509  diguanylate cyclase  30.61 
 
 		 835 aa  101  1e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0192657  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0273  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.72 
 
 		 917 aa  100  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.161492 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3113  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 962 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0730498  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  29.77 
 
 		 867 aa  97.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0350  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 		 1140 aa  92.8  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  24.18 
 
 		 882 aa  91.3  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3102  GGDEF domain-containing protein  27.39 
 
 		 580 aa  90.1  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1837  diguanylate cyclase  23.81 
 
 		 544 aa  90.5  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.980403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1041  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.16 
 
 		 1121 aa  90.1  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.700011  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  26.1 
 
 		 758 aa  89.4  8e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3357  sensory box histidine kinase  25.99 
 
 		 794 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3101  hypothetical protein  27.21 
 
 		 757 aa  86.7  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0926  sensory box protein  27.67 
 
 		 1063 aa  86.3  6e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.4 
 
 		 802 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.43493  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.51 
 
 		 793 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1140  ABC-type uncharacterized transport system periplasmic component-like protein  23.24 
 
 		 334 aa  84.3  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.15 
 
 		 1191 aa  83.6  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2358  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.16 
 
 		 916 aa  83.2  0.000000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1149  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 		 833 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.355741  normal  0.205094 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1273  PAS sensor protein  24.7 
 
 		 728 aa  80.9  0.00000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3233  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.08 
 
 		 1151 aa  80.5  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.885558  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.38 
 
 		 898 aa  80.5  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.88 
 
 		 1050 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.33 
 
 		 842 aa  77.4  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00528  hypothetical protein  26.23 
 
 		 1049 aa  76.6  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2075  signal transduction protein  24.78 
 
 		 988 aa  75.9  0.0000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2568  hypothetical protein  26.62 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1141  hypothetical protein  26.64 
 
 		 336 aa  74.7  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.08 
 
 		 1309 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001950  sensory box/GGDEF family protein  27.69 
 
 		 1041 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.65 
 
 		 1101 aa  71.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  25.3 
 
 		 1154 aa  70.1  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1088  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.25 
 
 		 822 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.436726 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.82 
 
 		 1039 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  24.01 
 
 		 1246 aa  68.2  0.0000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2005  ATP-binding region ATPase domain protein  21.96 
 
 		 617 aa  67  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.144674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1244  hypothetical protein  28.18 
 
 		 351 aa  67  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00881206 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2138  metal dependent phosphohydrolase  23.03 
 
 		 606 aa  66.2  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.258694  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0591  putative membrane associated signaling protein  25.08 
 
 		 596 aa  64.3  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0626  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  23.05 
 
 		 856 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  24.69 
 
 		 862 aa  63.9  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2313  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.08 
 
 		 981 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.762814  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1870  histidine kinase  25.4 
 
 		 779 aa  59.7  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1057  hypothetical protein  23.72 
 
 		 725 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0677  sensory box/GGDEF family protein  22.32 
 
 		 947 aa  54.7  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000825914  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.78 
 
 		 868 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.371238 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0859  metal dependent phosphohydrolase  26.56 
 
 		 685 aa  53.9  0.000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.55284  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1583  hypothetical protein  27.52 
 
 		 315 aa  53.1  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.295822  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2248  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 		 936 aa  52  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.945372 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2569  hypothetical protein  23.38 
 
 		 348 aa  51.2  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1179  ATP-binding region ATPase domain protein  24.04 
 
 		 740 aa  46.6  0.0006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2290  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  22.95 
 
 		 975 aa  45.4  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3419  sensor histidine kinase  21.43 
 
 		 774 aa  45.4  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>