107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1510 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1510  cytochrome c class I  100 
 
 		 174 aa  328  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0054  cytochrome c, class I  51.32 
 
 		 115 aa  73.9  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0034  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  50.65 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551832  normal  0.0979537 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3017  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  46.34 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4247  hypothetical protein  43.43 
 
 		 165 aa  68.9  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2727  putative cytochrome c protein  47.5 
 
 		 113 aa  62  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2440  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.92 
 
 		 288 aa  62  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.132686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1286  cytochrome c class I  63.41 
 
 		 701 aa  62  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4217  hypothetical protein  44.16 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1827  cytochrome c class I  43.59 
 
 		 280 aa  57  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2513  cytochrome c family protein  34.51 
 
 		 146 aa  53.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1810  cytochrome c class I  45.95 
 
 		 294 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.780394  normal  0.101949 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3983  cytochrome c class I  39.24 
 
 		 111 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0017  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  38.27 
 
 		 293 aa  48.9  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0693  Cbb3-type cytochrome c oxidase CcoP subunit  39.74 
 
 		 290 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1132  cytochrome c, class I  32.26 
 
 		 214 aa  48.9  0.00004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.300286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2348  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  39.74 
 
 		 290 aa  48.5  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.765339  normal  0.386471 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1140  cytochrome c, mono- and diheme variant  34.02 
 
 		 269 aa  48.5  0.00005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.000421025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5100  cytochrome c class I  32.1 
 
 		 284 aa  48.1  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.449412  normal  0.538396 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1021  ubiquinol-cytochrome c reductase cytochrome c subunit  32.26 
 
 		 307 aa  47.8  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.121328  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0317  cytochrome c, class I  39.74 
 
 		 285 aa  47.8  0.00009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00320646 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2561  cytochrome c, class I  35.37 
 
 		 131 aa  47.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0246  cytochrome c class I  40 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1153  cytochrome c family protein  35.48 
 
 		 218 aa  47  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2538  cytochrome c, class I  35.8 
 
 		 313 aa  47.4  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.663631  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1045  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 98 aa  47.4  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0915  cytochrome c6  34.12 
 
 		 124 aa  46.2  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.133204  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1358  cb-type cytochrome c oxidase subunit III  33.68 
 
 		 152 aa  46.6  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.112598  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  34.72 
 
 		 112 aa  46.6  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0632  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.93 
 
 		 311 aa  46.2  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1779  cytochrome c, class I  39.44 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282319 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2358  cytochrome c, class I  36.49 
 
 		 217 aa  46.6  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1450  cytochrome d1 heme region  40 
 
 		 525 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.593871 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3292  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 272 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.250177  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1845  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.5 
 
 		 349 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3354  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 272 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0582943  normal  0.0591201 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3303  cytochrome c, class I  30.3 
 
 		 272 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.227675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3341  cytochrome c class I  36.49 
 
 		 295 aa  45.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1747  cytochrome c, class I  36.59 
 
 		 372 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0188659 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1809  cytochrome c class I  43.75 
 
 		 153 aa  45.8  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44056  cytochrome c6, cytochrome c553  36.59 
 
 		 133 aa  45.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2013  cytochrome c class I  36.59 
 
 		 111 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2486  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 266 aa  45.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.148102 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2038  cytochrome c class I  36.59 
 
 		 111 aa  45.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00267664  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1425  cytochrome c, class I  37.5 
 
 		 97 aa  45.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5322  cytochrome c class I  35 
 
 		 346 aa  45.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0021785  normal  0.0885214 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1200  cytochrome c6  37.18 
 
 		 111 aa  45.1  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  34.12 
 
 		 518 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  34.12 
 
 		 518 aa  45.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0014  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35.87 
 
 		 293 aa  44.7  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  34.12 
 
 		 518 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  34.12 
 
 		 518 aa  44.7  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4390  hypothetical protein  34.72 
 
 		 110 aa  44.7  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.828991 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3041  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  34.18 
 
 		 286 aa  45.1  0.0006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3107  cytochrome c, class I  39.19 
 
 		 305 aa  44.7  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510771  normal  0.352992 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2794  cytochrome-c oxidase fixP chain  36.71 
 
 		 290 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.40028  normal  0.764362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5965  putative cytochrome c like protein  35.21 
 
 		 112 aa  44.7  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.672072 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4355  cytochrome c6  34.21 
 
 		 110 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3560  cytochrome c class I  38.75 
 
 		 271 aa  44.7  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0733  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  34.57 
 
 		 293 aa  44.3  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.647452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3190  cytochrome c class I  38.78 
 
 		 111 aa  44.3  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1088  cytochrome c, class I  33.65 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000582284  hitchhiker  0.0000137635 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4245  cytochrome c, class I  33.71 
 
 		 391 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06750  nitrite reductase precursor  34.67 
 
 		 568 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1913  hypothetical protein  32.43 
 
 		 154 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000530569  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0620  nitrite reductase precursor  34.67 
 
 		 568 aa  43.9  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2638  cytochrome c class I  36.25 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  35.06 
 
 		 354 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3862  cytochrome c class I  35.62 
 
 		 111 aa  44.3  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5018  nitrite reductase (NO-forming)  32.14 
 
 		 503 aa  43.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2575  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  31.71 
 
 		 307 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.991261  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0810  cytochrome c, class I  35.11 
 
 		 158 aa  43.1  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1826  cytochrome c, class I  31.97 
 
 		 251 aa  43.5  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.384457 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3273  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  37.23 
 
 		 293 aa  43.1  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.288519  normal  0.62826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1903  hypothetical protein  34.18 
 
 		 110 aa  43.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.172183  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2435  cytochrome c class I  34.72 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1236  putative bifunctional cbb3-type cytochrome c oxidase subunit II/cytochrome c  35.62 
 
 		 286 aa  43.1  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.385578  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3249  cytochrome c class I  31.43 
 
 		 255 aa  43.1  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00726195  hitchhiker  0.0000284914 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  35.06 
 
 		 303 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1897  blue (type 1) copper domain protein  46.15 
 
 		 243 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0462  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.5 
 
 		 294 aa  42.4  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.528353  normal  0.120204 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  32.05 
 
 		 707 aa  42.4  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2992  cytochrome c class I  34.15 
 
 		 187 aa  42.4  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.169382  normal  0.0463014 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09091  cytochrome cM  34.72 
 
 		 125 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.670452 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4137  cytochrome c class I  30 
 
 		 320 aa  42  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3662  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30 
 
 		 294 aa  42  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.839971 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0698  cytochrome c class I  29.12 
 
 		 189 aa  42  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0683  cytochrome c class I  30.1 
 
 		 381 aa  42  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3207  cytochrome c class I  34.48 
 
 		 115 aa  42.4  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.565348  decreased coverage  0.00513342 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  35.9 
 
 		 111 aa  42  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1152  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  35 
 
 		 307 aa  42  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.67748  normal  0.0615842 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1874  cytochrome c class I  30 
 
 		 220 aa  42  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0991365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2346  cytochrome c class I  32.98 
 
 		 187 aa  42  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5923  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  36.84 
 
 		 293 aa  41.6  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.123388  normal  0.389873 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0664  cytochrome c oxidase  36 
 
 		 287 aa  41.6  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1380  cytochrome c class I  31.58 
 
 		 133 aa  41.6  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.705063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3841  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 113 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1374  cytochrome c class I  30.77 
 
 		 270 aa  41.6  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.317055  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3891  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 113 aa  41.6  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0499798 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0644  cytochrome c, class I  55.88 
 
 		 474 aa  41.2  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.865539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>