21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_4217 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4217  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0188082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2727  putative cytochrome c protein  60.67 
 
 		 113 aa  107  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3017  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  57.69 
 
 		 107 aa  96.3  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.526573 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0054  cytochrome c, class I  52.08 
 
 		 115 aa  94  6e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0034  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  53.57 
 
 		 109 aa  89.7  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551832  normal  0.0979537 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1897  blue (type 1) copper domain protein  61.54 
 
 		 243 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1286  cytochrome c class I  50 
 
 		 701 aa  47  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0456  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  32.5 
 
 		 312 aa  45.1  0.0003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.844005  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2450  PQQ-dependent enzyme-like protein  31.96 
 
 		 718 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.264561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1360  cytochrome c oxidase, cbb3-type, subunit III  30.83 
 
 		 308 aa  43.9  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.240618 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4247  hypothetical protein  40.54 
 
 		 165 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.803221  normal  0.4086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  39.51 
 
 		 344 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1406  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  33.33 
 
 		 587 aa  42  0.003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.748943 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1779  cytochrome c, class I  27.27 
 
 		 214 aa  41.6  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0282319 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08521  salicylate hydroxylase, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G06050)  32 
 
 		 469 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.883838  normal  0.0891916 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3062  cytochrome c class I  31.33 
 
 		 303 aa  40.4  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0184477  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1900  quinoprotein glucose dehydrogenase  36.05 
 
 		 720 aa  40.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1907  cytochrome c, class I  32.95 
 
 		 126 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000266985  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1132  PQQ-dependent enzyme-like protein  29.58 
 
 		 701 aa  40.4  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0946665  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1630  cytochrome c6  36.36 
 
 		 111 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0702858 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0239  cytochrome C6 soluble cytochrome f  32.22 
 
 		 112 aa  40  0.01  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.783441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>