More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1286 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1286  cytochrome c class I  100 
 
 
701 aa  1387    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.277764 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2867  Pyrrolo-quinoline quinone  29.08 
 
 
614 aa  154  7e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0638606 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3007  Pyrrolo-quinoline quinone  29.92 
 
 
573 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5136  Pyrrolo-quinoline quinone  26.12 
 
 
709 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.388908  normal  0.506379 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0808  Pyrrolo-quinoline quinone  28.11 
 
 
585 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.260733 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5037  Pyrrolo-quinoline quinone  27.93 
 
 
613 aa  139  2e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4984  Pyrrolo-quinoline quinone  27.67 
 
 
612 aa  138  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.257884 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2415  putative quinoprotein alcohol dehydrogenase  29.1 
 
 
577 aa  137  5e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168343  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4524  Pyrrolo-quinoline quinone  28.07 
 
 
612 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223128 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0849  Pyrrolo-quinoline quinone  30.92 
 
 
528 aa  137  7.000000000000001e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1149  Pyrrolo-quinoline quinone  27.52 
 
 
678 aa  136  9.999999999999999e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.261687  normal  0.842615 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1461  Pyrrolo-quinoline quinone  25.17 
 
 
718 aa  135  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.153207  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5419  Pyrrolo-quinoline quinone  28.52 
 
 
576 aa  133  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1595  putative alcohol dehydrogenase  30.7 
 
 
561 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0851  Pyrrolo-quinoline quinone  30.39 
 
 
558 aa  130  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0969  Pyrrolo-quinoline quinone  28.31 
 
 
541 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.870363  normal  0.326123 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1201  Pyrrolo-quinoline quinone  27.77 
 
 
545 aa  129  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.817213  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3352  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.98 
 
 
707 aa  129  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.32899  normal  0.291074 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4160  Pyrrolo-quinoline quinone:cytochrome c, class I  27.17 
 
 
718 aa  125  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.110436  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4160  Pyrrolo-quinoline quinone  26.19 
 
 
690 aa  125  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0349949 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2326  putative quinoprotein  30.2 
 
 
525 aa  123  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.55919  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2451  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.79 
 
 
576 aa  122  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5302  Pyrrolo-quinoline quinone  23.55 
 
 
721 aa  120  6e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.178096  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6351  Pyrrolo-quinoline quinone  26.44 
 
 
604 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.346402  normal  0.871662 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5964  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  26.08 
 
 
554 aa  117  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.206262  normal  0.383589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0427  Pyrrolo-quinoline quinone  26.96 
 
 
706 aa  117  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.196079 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0673  PQQ-dependent enzyme-like protein  28.32 
 
 
569 aa  116  1.0000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5018  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.85 
 
 
697 aa  114  5e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.729726  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0721  Pyrrolo-quinoline quinone  25.72 
 
 
702 aa  114  7.000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760072 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0905  alcohol dehydrogenase  25.09 
 
 
711 aa  114  9e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.879569  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1306  Pyrrolo-quinoline quinone  26.71 
 
 
738 aa  113  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0575142 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5502  putative alcohol dehydrogenase  25.38 
 
 
712 aa  112  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.210225  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1741  Pyrrolo-quinoline quinone  26.98 
 
 
570 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2355  Pyrrolo-quinoline quinone  24.48 
 
 
730 aa  109  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0680369  normal  0.367457 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3601  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  27.81 
 
 
724 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0877  alcohol dehydrogenase large subunit  26.32 
 
 
720 aa  110  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2227  Pyrrolo-quinoline quinone  27.22 
 
 
705 aa  110  1e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.580603 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3110  Pyrrolo-quinoline quinone  28 
 
 
726 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5972  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.43 
 
 
575 aa  107  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0151209 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3733  Pyrrolo-quinoline quinone  26.19 
 
 
562 aa  107  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2797  Pyrrolo-quinoline quinone  26.1 
 
 
557 aa  106  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3242  Pyrrolo-quinoline quinone  26.11 
 
 
573 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00434002  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6162  Pyrrolo-quinoline quinone  25.85 
 
 
575 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.114811  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5126  Pyrrolo-quinoline quinone  26.11 
 
 
573 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.281211  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5895  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.64 
 
 
575 aa  105  3e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.136104  normal  0.867214 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2870  Pyrrolo-quinoline quinone  24.61 
 
 
705 aa  105  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.489222  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2878  Pyrrolo-quinoline quinone  31.53 
 
 
727 aa  105  4e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5155  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.89 
 
 
573 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.843195 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1570  Pyrrolo-quinoline quinone  26.11 
 
 
568 aa  103  8e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0635613  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7192  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.86 
 
 
575 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.426546  normal  0.582027 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0379  Pyrrolo-quinoline quinone  26.43 
 
 
727 aa  102  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3639  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  24.57 
 
 
566 aa  102  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.347084  normal  0.430241 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0099  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  24.66 
 
 
605 aa  101  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.850532  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1945  Pyrrolo-quinoline quinone  26.15 
 
 
600 aa  101  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.188003  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1236  Pyrrolo-quinoline quinone  26.15 
 
 
600 aa  100  7e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.278366 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2578  putative PQQ dehydrogenase protein  26.15 
 
 
600 aa  100  9e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0306  putative alcohol dehydrogenase  24.91 
 
 
575 aa  99.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.100044  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1001  Pyrrolo-quinoline quinone  26.1 
 
 
698 aa  98.2  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.132908 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0473  quinoprotein ethanol dehydrogenase, putative  25.35 
 
 
580 aa  98.2  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101481 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1591  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  25.88 
 
 
583 aa  98.2  4e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.890828  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2994  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.23 
 
 
613 aa  98.6  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0170734 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2696  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.18 
 
 
726 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1611  Glycerol dehydrogenase (acceptor)  29.91 
 
 
722 aa  97.1  1e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3387  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  25.44 
 
 
601 aa  96.3  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2344  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  25.4 
 
 
611 aa  96.3  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0903405  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2017  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase  25.83 
 
 
592 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.115973  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0700  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.86 
 
 
613 aa  96.3  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0341  putative quinoprotein ethanol dehydrogenase precursor  24.75 
 
 
562 aa  95.9  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.409253  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1932  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  27.32 
 
 
592 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0203998 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1451  Pyrrolo-quinoline quinone  26.28 
 
 
616 aa  94.7  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.924401  normal  0.0179554 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3943  Pyrrolo-quinoline quinone  25.05 
 
 
601 aa  94  9e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.237421  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1900  quinoprotein glucose dehydrogenase  31.79 
 
 
720 aa  94  9e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5968  methanol dehydrogenase large subunit  24.71 
 
 
601 aa  92.4  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.366255  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1587  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.01 
 
 
601 aa  92  4e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.174692 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0020  Pyrrolo-quinoline quinone  26.43 
 
 
600 aa  91.3  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1132  PQQ-dependent enzyme-like protein  30.15 
 
 
701 aa  91.3  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0946665  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2890  Pyrrolo-quinoline quinone  25 
 
 
583 aa  90.9  8e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612512  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2729  Pyrrolo-quinoline quinone  25.68 
 
 
602 aa  90.1  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0556411  normal  0.602163 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0693  Pyrrolo-quinoline quinone  25.69 
 
 
579 aa  89.7  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804984  normal  0.410128 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1441  Pyrrolo-quinoline quinone  27.78 
 
 
708 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0121309 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0262  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.88 
 
 
737 aa  89.7  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0206165  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0476  quinoprotein glucose dehydrogenase  26.25 
 
 
600 aa  88.2  4e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1323  Pyrrolo-quinoline quinone  26.52 
 
 
639 aa  87.4  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.207789 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3660  putative alcohol dehydrogenase  27.94 
 
 
555 aa  87  0.000000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1540  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.67 
 
 
587 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1339  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  26.67 
 
 
587 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.38566  normal  0.435914 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2494  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  25.25 
 
 
584 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295659  normal  0.19306 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6242  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  25.34 
 
 
597 aa  85.5  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4873  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  26.38 
 
 
587 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.518263  normal  0.0810929 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1784  Pyrrolo-quinoline quinone  25.45 
 
 
580 aa  85.1  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2255  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.82 
 
 
588 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.217629  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2100  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  25.05 
 
 
584 aa  84.7  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1811  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.76 
 
 
582 aa  84.7  0.000000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000177841 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4957  Pyrrolo-quinoline quinone  28.87 
 
 
698 aa  84.3  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.897916 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0034  sulfite dehydrogenase (cytochrome) subunit SorB  55.13 
 
 
109 aa  84  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.551832  normal  0.0979537 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6478  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  23.54 
 
 
606 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.975384  normal  0.155074 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2817  PQQ-dependent dehydrogenase, methanol/ethanol family  24.12 
 
 
602 aa  82.8  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0363  putative alcohol dehydrogenase precursor  27.3 
 
 
572 aa  82.4  0.00000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2082  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  26.08 
 
 
588 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.687191  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2409  methanol/ethanol family PQQ-dependent dehydrogenase  25.81 
 
 
589 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.13814  normal  0.848808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>