207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2011 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2011  nuclease  100 
 
 		 608 aa  1217    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.810244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2232  nuclease  65.61 
 
 		 625 aa  733    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1816  parB-like partition protein  49.27 
 
 		 576 aa  494  9.999999999999999e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.357609  normal  0.915413 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  30.61 
 
 		 636 aa  93.6  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  33.45 
 
 		 690 aa  92  3e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  32.45 
 
 		 681 aa  90.9  6e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  29.54 
 
 		 667 aa  87  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  31.23 
 
 		 684 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  32.43 
 
 		 683 aa  85.5  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  28.21 
 
 		 708 aa  85.1  0.000000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  32.45 
 
 		 682 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  30.48 
 
 		 688 aa  84.3  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  30.48 
 
 		 688 aa  84.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  31.46 
 
 		 684 aa  83.6  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  30.48 
 
 		 683 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  26.91 
 
 		 714 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  30.48 
 
 		 679 aa  80.1  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  24.91 
 
 		 706 aa  78.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  27.92 
 
 		 660 aa  78.2  0.0000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  26.52 
 
 		 717 aa  77.8  0.0000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  26.2 
 
 		 706 aa  77.4  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  26.2 
 
 		 706 aa  77.4  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  30.2 
 
 		 687 aa  77.4  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  31.27 
 
 		 680 aa  77  0.0000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  26.47 
 
 		 714 aa  77  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  27.21 
 
 		 708 aa  76.3  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  30.93 
 
 		 687 aa  75.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  25.37 
 
 		 714 aa  75.5  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  26.91 
 
 		 687 aa  75.1  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  27.15 
 
 		 660 aa  74.7  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  27.27 
 
 		 687 aa  74.7  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  25.74 
 
 		 712 aa  73.2  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  31.6 
 
 		 679 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  32.13 
 
 		 692 aa  72.4  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  24.8 
 
 		 624 aa  72  0.00000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  27.9 
 
 		 717 aa  71.6  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6187  ParB domain protein nuclease  25.93 
 
 		 711 aa  71.6  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00276297 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2858  nuclease  26.1 
 
 		 709 aa  71.6  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0970138 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  25.63 
 
 		 734 aa  71.2  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  26.28 
 
 		 709 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  24.87 
 
 		 624 aa  70.5  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  26.28 
 
 		 687 aa  70.1  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  28.43 
 
 		 740 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  30.66 
 
 		 689 aa  68.9  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  31.3 
 
 		 654 aa  68.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0192  ParB family protein  25.27 
 
 		 703 aa  67  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  30.11 
 
 		 754 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  23.74 
 
 		 626 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  27.81 
 
 		 597 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  23.74 
 
 		 626 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7035  plasmid partitioning protein  28.25 
 
 		 571 aa  66.2  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  30.55 
 
 		 677 aa  65.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  28.63 
 
 		 615 aa  65.9  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2520  ParB-like nuclease  27.04 
 
 		 694 aa  65.5  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5564  ParB domain protein nuclease  26.04 
 
 		 759 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0978774 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  23.74 
 
 		 626 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3567  ParB-like nuclease  25.37 
 
 		 703 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1059  ParB domain protein nuclease  24.3 
 
 		 685 aa  65.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3920  ParB-like nuclease  25.64 
 
 		 703 aa  64.3  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  24.03 
 
 		 624 aa  64.3  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  25.87 
 
 		 694 aa  64.3  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  30.2 
 
 		 595 aa  63.9  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  27.17 
 
 		 785 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0380  ParB family protein  25.42 
 
 		 713 aa  63.5  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  28.93 
 
 		 765 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  24.11 
 
 		 624 aa  60.5  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  30.19 
 
 		 272 aa  60.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1162  ParB-like nuclease domain-containing protein  27.06 
 
 		 542 aa  59.3  0.0000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4094  parB-like partition protein  29.79 
 
 		 306 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0135978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3808  nuclease  28.46 
 
 		 694 aa  58.5  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3672  nuclease  27.84 
 
 		 715 aa  58.9  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  25.65 
 
 		 645 aa  58.5  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4594  putative plasmid stabilization protein  25.93 
 
 		 696 aa  57.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473967  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  29.61 
 
 		 299 aa  57.4  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9553  plasmid partitioning protein  26.02 
 
 		 596 aa  57  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2859  ParB-like nuclease  26.96 
 
 		 726 aa  56.2  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  25.18 
 
 		 623 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2659  hypothetical protein  23.05 
 
 		 713 aa  56.2  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.603455  normal  0.436395 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  30.86 
 
 		 288 aa  55.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  29.11 
 
 		 296 aa  55.5  0.000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  28.02 
 
 		 751 aa  55.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  23.55 
 
 		 709 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1936  parB-like partition protein  33.55 
 
 		 296 aa  54.3  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  30.36 
 
 		 301 aa  54.3  0.000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  30.05 
 
 		 727 aa  53.9  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  28.29 
 
 		 298 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2805  hypothetical protein  30.32 
 
 		 289 aa  53.5  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  25.89 
 
 		 658 aa  53.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4659  plasmid partitioning protein  25.88 
 
 		 557 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2347  ParB-like nuclease  29.71 
 
 		 156 aa  53.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.107377  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3819  hypothetical protein  26.47 
 
 		 723 aa  53.5  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2145  parB-like partition protein  29.63 
 
 		 283 aa  53.1  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00430  chromosome partitioning protein  27.37 
 
 		 293 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4303  parB-like partition proteins  29.34 
 
 		 290 aa  52.8  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.279457  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  28.29 
 
 		 300 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2520  ParB family protein  25.56 
 
 		 293 aa  52.8  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000102448  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  28.29 
 
 		 300 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002022  chromosome (plasmid) partitioning protein ParB/stage 0 sporulation protein J  26.82 
 
 		 293 aa  52  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000100798  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2175  ParB family partitioning protein  24.32 
 
 		 257 aa  51.6  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.291914  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3067  putative chromosome partitioning protein ParB  25.41 
 
 		 294 aa  51.6  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>