More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2232 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2011  nuclease  67.29 
 
 		 608 aa  748    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.810244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2232  nuclease  100 
 
 		 625 aa  1253    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.622811 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1816  parB-like partition protein  47.54 
 
 		 576 aa  478  1e-133  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.357609  normal  0.915413 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0315  nuclease  33.96 
 
 		 636 aa  102  3e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0254  helix-turn-helix, Fis-type  30.38 
 
 		 785 aa  84.7  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1870  ParB domain protein nuclease  29.87 
 
 		 684 aa  84.3  0.000000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31190  hypothetical protein  30.3 
 
 		 684 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000126349  unclonable  1.05034e-21 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2219  ParB-like nuclease  29.28 
 
 		 667 aa  82.8  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488609  normal  0.287852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0680  nuclease  32.07 
 
 		 681 aa  82.8  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2322  nuclease  32.3 
 
 		 682 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2733  nuclease  28.62 
 
 		 688 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.905416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3033  ParB family protein  28.62 
 
 		 688 aa  79  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0467  nuclease  30.42 
 
 		 687 aa  77.8  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2640  ParB family protein  29.55 
 
 		 690 aa  77.8  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.587748  normal  0.035821 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2943  nuclease  29.33 
 
 		 683 aa  77.4  0.0000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.24471  normal  0.819404 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6483  ParB domain protein nuclease  29.06 
 
 		 740 aa  77  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.656524  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1245  ParB family protein  30 
 
 		 683 aa  75.9  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.034848 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1478  ParB family protein  29.97 
 
 		 680 aa  74.7  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2612  ParB domain protein nuclease  29.33 
 
 		 679 aa  73.9  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8287  ParB domain protein nuclease  27.3 
 
 		 709 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0477  putative ParB-like nuclease  27.55 
 
 		 754 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.487335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4159  nuclease  31.76 
 
 		 679 aa  72.4  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.841229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3060  ParB domain protein nuclease  24.73 
 
 		 714 aa  71.6  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.658709  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5399  ParB domain protein nuclease  25.44 
 
 		 623 aa  70.5  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.883883  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4146  ParB-like nuclease  26.26 
 
 		 717 aa  70.5  0.00000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0488845  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0730  nuclease  25.09 
 
 		 734 aa  69.7  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.232794  normal  0.968585 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2465  ParB-like nuclease  28.72 
 
 		 658 aa  70.1  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3534  ParB domain protein nuclease  30.45 
 
 		 687 aa  70.1  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4477  ParB domain protein nuclease  23.85 
 
 		 624 aa  68.9  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000629481  normal  0.555503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3740  nuclease  30.31 
 
 		 692 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2078  ParB domain protein nuclease  32.43 
 
 		 677 aa  67.4  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1277  ParB domain protein nuclease  29.21 
 
 		 689 aa  67.4  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4525  ParB domain protein nuclease  23.82 
 
 		 624 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00810942  normal  0.619487 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4015  parB-like partition protein  27.55 
 
 		 660 aa  67.4  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7035  plasmid partitioning protein  28.5 
 
 		 571 aa  67  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4025  parB-like partition protein  24.91 
 
 		 687 aa  67  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.934499  normal  0.037787 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3733  parB-like partition protein  27.34 
 
 		 660 aa  65.9  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1541  parB-like partition proteins  24.44 
 
 		 708 aa  66.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.79146  normal  0.0178306 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3049  parB-like partition protein  31.67 
 
 		 272 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.622521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2572  ParB family protein  27.59 
 
 		 765 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.306816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5200  nuclease  28.51 
 
 		 595 aa  65.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4602  parB-like partition protein  28 
 
 		 654 aa  63.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.469215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0550  parB-like partition protein  25.9 
 
 		 615 aa  63.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4600  nuclease  24.71 
 
 		 626 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000283413  normal  0.96805 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4410  ParB domain protein nuclease  24.71 
 
 		 626 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.902867 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4417  nuclease  24.71 
 
 		 626 aa  63.2  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000853947  decreased coverage  0.00344778 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0014  chromosome partitioning protein ParB  32.35 
 
 		 303 aa  62.4  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.110445  n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9896  transcriptional regulator  25.83 
 
 		 645 aa  62.4  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3031  nuclease  23.32 
 
 		 712 aa  62  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.578661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4994  ParB domain protein nuclease  25 
 
 		 380 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00893638  normal  0.0336784 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0571  parB-like partition protein  23.79 
 
 		 687 aa  61.2  0.00000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.462321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4923  parB-like partition protein  23.45 
 
 		 706 aa  61.2  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.953106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009998  Sbal195_4579  nuclease  23.15 
 
 		 624 aa  61.6  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0158793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1222  nuclease  23.05 
 
 		 706 aa  60.5  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3513  nuclease  23.05 
 
 		 706 aa  60.5  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.557046 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2403  parB-like partition protein  30.12 
 
 		 286 aa  60.8  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1218  ParB family protein  27.39 
 
 		 283 aa  59.7  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0031  ParB family partitioning protein  22.65 
 
 		 624 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.264156  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6194  nuclease  24.32 
 
 		 751 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0926146  normal  0.731953 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3458  chromosome partitioning protein parB  32.48 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6935  nuclease  25.91 
 
 		 709 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0146149  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3325  putative chromosome partitioning protein PARB  29.94 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00569301  normal  0.133715 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1277  parB-like partition protein  30.67 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23510  parB-like partition protein  26.28 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.107848  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4579  parB-like partition protein  23.79 
 
 		 687 aa  57.4  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.914169  normal  0.147919 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0538  ParB family protein  21.72 
 
 		 714 aa  57  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1362  parB-like partition protein  30.43 
 
 		 286 aa  56.6  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2058  chromosome partitioning protein ParB  31.33 
 
 		 293 aa  56.6  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3927  parB-like partition protein  33.1 
 
 		 293 aa  56.6  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.47088 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6053  nuclease  22.7 
 
 		 694 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1781  putative plasmid stabilization protein  24.73 
 
 		 727 aa  57  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.901173 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2940  parB-like partition protein  27.06 
 
 		 282 aa  57  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3209  chromosome segregation DNA-binding protein  29.63 
 
 		 288 aa  56.6  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1978  chromosome partitioning protein ParB  31.33 
 
 		 293 aa  56.6  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3195  parB-like partition protein  28.07 
 
 		 303 aa  55.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0094  ParB-like partition protein  29.71 
 
 		 293 aa  56.6  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2123  hypothetical protein  24.75 
 
 		 717 aa  55.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0562  parB-like partition protein  26.62 
 
 		 312 aa  55.8  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000115281  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3628  chromosome segregation DNA-binding protein  29.3 
 
 		 326 aa  56.2  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0424656  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0862  parB-like partition protein  34.11 
 
 		 293 aa  56.2  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2362  ParB family protein  33.33 
 
 		 278 aa  55.8  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0638722  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2868  chromosome segregation DNA-binding protein  30.88 
 
 		 299 aa  56.2  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.108879  normal  0.100087 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1530  hypothetical protein  29.49 
 
 		 296 aa  56.2  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.197455 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2781  ParB domain protein nuclease  21.93 
 
 		 714 aa  56.2  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2128  ParB-like partition protein  28.93 
 
 		 288 aa  55.5  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2617  hypothetical protein  30.65 
 
 		 597 aa  55.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0195  chromosome partitioning protein  28.93 
 
 		 290 aa  55.5  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0771  nuclease  22.68 
 
 		 708 aa  55.5  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2951  hypothetical protein  30.86 
 
 		 301 aa  55.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2887  parB-like partition proteins  32.41 
 
 		 296 aa  55.1  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1653  parB-like partition protein  31.85 
 
 		 300 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.623968  normal  0.854391 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1865  parB-like partition protein  31.85 
 
 		 298 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0917667 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2198  ParB family protein  35.76 
 
 		 662 aa  55.5  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0776578  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1586  parB-like partition protein  31.85 
 
 		 300 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.746131  normal  0.0130059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3520  parB-like partition protein  28.07 
 
 		 303 aa  55.5  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1407  parB-like partition protein  32.17 
 
 		 297 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.238658 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2333  parB-like protein partition proteins  37.98 
 
 		 281 aa  55.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.99663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2857  parB-like partition proteins  33.09 
 
 		 319 aa  55.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2567  transcriptional regulator  32.5 
 
 		 280 aa  55.5  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.183752  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1591  ParB family protein  27.03 
 
 		 587 aa  55.1  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0914719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>