268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM02420 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ00080  ferro-O2-oxidoreductase, putative  59.27 
 
 
632 aa  763    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM02420  acidic laccase, putative  100 
 
 
640 aa  1330    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0182669  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05690  ferroxidase, putative  53.61 
 
 
639 aa  650    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0562194  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_89638  Multicopper oxidase  37.94 
 
 
626 aa  392  1e-107  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.951464  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79365  multicopper oxidase   35.89 
 
 
631 aa  381  1e-104  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09170  conserved hypothetical protein: exracellular laccase (Eurofung)  30.66 
 
 
570 aa  201  3e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05397  conserved hypothetical protein: extracellular laccase (Eurofung)  30.58 
 
 
664 aa  196  9e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.436415  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01240  laccase precursor, putative  29.01 
 
 
624 aa  182  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07389  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 
580 aa  129  1.0000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.270429  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2631  CopA family copper resistance protein  24.44 
 
 
556 aa  126  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.269848  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1324  copper-resistance protein CopA  25.13 
 
 
561 aa  126  1e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.210638  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08581  conserved hypothetical protein  26.55 
 
 
673 aa  123  9.999999999999999e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.111487  normal  0.0392522 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1830  multicopper oxidase, type 3  24.22 
 
 
511 aa  121  3.9999999999999996e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18340  copper-resistance protein, CopA family  24.01 
 
 
521 aa  120  9e-26  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.612163  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2221  CopA family copper resistance protein  24.49 
 
 
563 aa  120  9.999999999999999e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.195638  normal  0.807745 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3033  multicopper oxidase type 3  25.37 
 
 
477 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10863  oxidase  26.92 
 
 
504 aa  118  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00014266 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04900  predicted multicopper oxidase  24.25 
 
 
521 aa  117  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3672  multicopper oxidase, type 2  25.9 
 
 
521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122206  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4521  multicopper oxidase, type 2  25.1 
 
 
506 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.562505  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5577  multicopper oxidase type 3  24.56 
 
 
498 aa  107  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3078  multicopper oxidase, type 3  23.42 
 
 
871 aa  103  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00901  Laccase Precursor (EC 1.10.3.2) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q96VT5]  22.09 
 
 
601 aa  103  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2136  copper-resistance protein CopA  23.95 
 
 
584 aa  103  9e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.296385  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0626  multicopper oxidase, type 3  24.18 
 
 
508 aa  101  4e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0201  CopA family copper resistance protein  29.79 
 
 
637 aa  101  5e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.978891  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3914  copper resistance protein A  22.83 
 
 
589 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1571  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  22.83 
 
 
592 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.402228  normal  0.015663 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0710  CopA family copper resistance protein  23.34 
 
 
568 aa  97.1  9e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0956103 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0126  CopA family copper resistance protein  28.71 
 
 
569 aa  95.9  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00878  conserved hypothetical protein: extracellular laccase (Eurofung)  23.77 
 
 
596 aa  94.7  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3257  CopA family copper resistance protein  27.44 
 
 
581 aa  93.6  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.202502  normal  0.153342 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1105  multicopper oxidase type 3  21.95 
 
 
565 aa  93.6  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4388  multicopper oxidase, type 3  23.35 
 
 
460 aa  93.2  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5307  multicopper oxidase, type 2  27.57 
 
 
518 aa  93.6  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.117713  normal  0.384729 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11743  copper resistance protein A precursor  25.07 
 
 
809 aa  92.8  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.860806  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3546  copper-resistance protein CopA  26.36 
 
 
664 aa  91.7  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0666183  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5702  multicopper oxidase, type 2  27.24 
 
 
518 aa  91.3  4e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.672954 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0382  copper-resistance protein, CopA family  28.04 
 
 
638 aa  91.3  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0784  copper-resistance protein CopA  28.62 
 
 
590 aa  91.3  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2490  copper-resistance protein, CopA family  28.03 
 
 
601 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.997351 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3623  copper-resistance protein, CopA family  28.03 
 
 
601 aa  90.9  7e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4287  CopA family copper resistance protein  27.02 
 
 
642 aa  90.9  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.221422  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0249  CopA family copper resistance protein  27.02 
 
 
672 aa  90.9  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  30.58 
 
 
659 aa  90.5  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  27.14 
 
 
579 aa  89.4  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1375  copper-resistance protein, CopA family  27.14 
 
 
621 aa  89.4  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.431573  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1266  copper-resistance protein, CopA family  28.89 
 
 
594 aa  89.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0392055  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0800  copper resistance protein B  24.65 
 
 
803 aa  89  3e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2352  CopA family copper resistance protein  26.6 
 
 
611 aa  88.6  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4267  CopA family copper resistance protein  28.08 
 
 
630 aa  88.2  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0548643 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1764  multicopper oxidase family protein  22.61 
 
 
551 aa  87.8  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1902  multicopper oxidase family protein  22.61 
 
 
551 aa  87.8  5e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.156202  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1741  multicopper oxidase family protein; copper resistance protein A  22.81 
 
 
551 aa  87.8  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1713  CopA family copper resistance protein  23.32 
 
 
580 aa  87.8  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.476004  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1969  copper-resistance protein, CopA family protein  26.4 
 
 
657 aa  87.4  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2296  L-ascorbate oxidase  26.86 
 
 
705 aa  87.4  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0000773884  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3810  copper-resistance protein CopA  26.57 
 
 
572 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.87992 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1765  multicopper oxidase type 3  22.64 
 
 
544 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.685844  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1707  copper-resistance protein, CopA family  25.26 
 
 
561 aa  87  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000264505  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0800  multicopper oxidase type 3  23.41 
 
 
466 aa  86.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.581336 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4490  multicopper oxidase  22.16 
 
 
551 aa  85.9  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.248277  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4279  multicopper oxidase type 3  24.74 
 
 
545 aa  84.7  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1937  multicopper oxidase family protein  22.81 
 
 
549 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5609500000000003e-44 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0272  copper-resistance protein, CopA family  27.63 
 
 
656 aa  85.1  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2422  copper-resistance protein CopA  27.14 
 
 
593 aa  85.1  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1908  multicopper oxidase family protein  23.73 
 
 
546 aa  84  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000964148  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00405  Multicopper oxidase  26.58 
 
 
604 aa  84  0.000000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3435  multicopper oxidase family protein  23.33 
 
 
546 aa  84  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.145369  hitchhiker  0.000000000909596 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0192  multicopper oxidase, type 3  28.33 
 
 
746 aa  84  0.000000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.398737  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0339  hypothetical protein  23.83 
 
 
515 aa  83.6  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0190  putative copper resistance protein A precursor  24.92 
 
 
680 aa  83.2  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1947  putative copper resistance transmembrane protein  26.3 
 
 
627 aa  82.8  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.809096 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3416  CopA family copper resistance protein  26.82 
 
 
605 aa  82  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1591  copper-resistance protein CopA  26.79 
 
 
568 aa  82  0.00000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.336299  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0697  copper-resistance protein CopA  26.42 
 
 
568 aa  81.6  0.00000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1696  multicopper oxidase type 3  24.43 
 
 
527 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3699  multicopper oxidase type 3  21.43 
 
 
437 aa  81.6  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2116  copper-resistance protein CopA  25.8 
 
 
666 aa  81.3  0.00000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3169  multicopper oxidase type 3  25.26 
 
 
513 aa  81.3  0.00000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3105  copper-resistance protein, CopA family  21.47 
 
 
600 aa  80.9  0.00000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.497996  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002070  multicopper oxidase  22.82 
 
 
460 aa  80.9  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1573  copper-resistance protein CopA  25.35 
 
 
664 aa  79.7  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1235  CopA family copper resistance protein  23.29 
 
 
630 aa  80.1  0.0000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00250  Copper-resistance protein A precursor CopA family  26.42 
 
 
621 aa  80.1  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0267708  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6112  multi-Cu(II) oxidase CopA  27.27 
 
 
614 aa  80.1  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0215079  normal  0.483267 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6647  multicopper oxidase type 3  27.11 
 
 
946 aa  80.1  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0481943  normal  0.204114 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1383  multicopper oxidase type 3  29.02 
 
 
478 aa  79  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.196753  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37790  copper resistance protein A precursor  25.72 
 
 
606 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00238596  normal  0.267032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2929  copper-resistance protein CopA  25.65 
 
 
594 aa  78.2  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.466077  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1493  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  26.57 
 
 
606 aa  77.8  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2489  twin-arginine translocation pathway signal:copper-resistance protein CopA  26.52 
 
 
598 aa  77.8  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.211197  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1075  multicopper oxidase, type 3  23.8 
 
 
459 aa  77.8  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709228  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1589  cu-oxidase multicopper oxidase protein  22.92 
 
 
470 aa  77.8  0.0000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0015  CopA family copper resistance protein  25.55 
 
 
652 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.275431  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1828  CopA family copper resistance protein  24.92 
 
 
566 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349275  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2338  CopA family copper resistance protein  24.62 
 
 
626 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0017  CopA family copper resistance protein  25.55 
 
 
652 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0816359  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2456  copper-resistance protein CopA  26.09 
 
 
564 aa  77  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.441362  normal  0.835222 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5180  CopA family copper resistance protein  25.55 
 
 
605 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.116065  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>