More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_0493 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008787  CJJ81176_0493  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  100 
 
 
218 aa  439  9.999999999999999e-123  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000976702  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0518  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  98.62 
 
 
218 aa  436  1e-121  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.776955  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1471  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  98.62 
 
 
218 aa  436  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0691  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (permease protein)  63.01 
 
 
219 aa  289  2e-77  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.446042  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0288  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  57.08 
 
 
222 aa  248  7e-65  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0662  SugE protein  57.94 
 
 
222 aa  218  3.9999999999999997e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0092  amino acid ABC transporter permease  48.85 
 
 
224 aa  209  3e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4584  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.03 
 
 
225 aa  204  9e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000898191  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1541  ABC-type amino acid transport system, permease component  47.22 
 
 
225 aa  191  9e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00154011  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1541  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  49.75 
 
 
218 aa  190  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00385329  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0446  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  45.16 
 
 
225 aa  186  2e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.95928  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0226  amino acid ABC transporter permease  41.9 
 
 
209 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.466164  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2671  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  51.21 
 
 
225 aa  174  6e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000364543  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0463  amino acid ABC transporter, permease  44.76 
 
 
217 aa  170  1e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5220  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  39.9 
 
 
219 aa  170  1e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0611  amino acid ABC transporter, permease protein  44.29 
 
 
217 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000123395  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3084  glutamine/glutamate ABC transporter, permease protein  41.21 
 
 
219 aa  168  5e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14393  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2943  amino acid ABC transporter permease  41.21 
 
 
219 aa  167  8e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627929  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0120  ABC-type amino acid transport system, permease component  41.9 
 
 
226 aa  153  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.97 
 
 
222 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0447  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.49 
 
 
216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.01 
 
 
216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2808  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  37.25 
 
 
216 aa  118  4.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.36 
 
 
234 aa  118  6e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.164337 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.54 
 
 
216 aa  118  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2430  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  31.02 
 
 
216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.891065  normal  0.0353371 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.8 
 
 
218 aa  114  7.999999999999999e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0553  glutamine ABC transporter permease  34.45 
 
 
214 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5461  amino acid ABC transporter permease  32.87 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1031  amino acid ABC transporter permease  31.47 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000917559  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0710  amino acid ABC transporter, permease protein  34.3 
 
 
214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  36.45 
 
 
216 aa  112  4.0000000000000004e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.96 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221978  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0678  amino acid ABC transporter, permease protein  34.45 
 
 
214 aa  112  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0609  amino acid ABC transporter permease  33.96 
 
 
214 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00355475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0554  glutamine ABC transporter permease  33.96 
 
 
214 aa  112  6e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282364  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  35.32 
 
 
216 aa  111  6e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.56 
 
 
216 aa  112  6e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0642  amino acid ABC transporter permease  33.96 
 
 
214 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00728334  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1120  ABC-type amino acid transport system, permease component  31.34 
 
 
216 aa  112  6e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.282302  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0699  amino acid ABC transporter, permease protein  34.29 
 
 
214 aa  112  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4660  amino acid ABC transporter, permease protein  33.49 
 
 
214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  hitchhiker  1.97521e-21 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3090  amino acid ABC transporter permease  28.92 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  31.16 
 
 
216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3977  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.5 
 
 
213 aa  109  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.734464  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1688  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  31.82 
 
 
218 aa  108  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.022194  normal  0.493441 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0555  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 
214 aa  108  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2505  amino acid ABC transporter permease  29.41 
 
 
220 aa  108  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0032626  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2777  amino acid ABC transporter, permease protein  28.92 
 
 
220 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4962  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.82 
 
 
218 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0311986  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4548  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.88 
 
 
219 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1707  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.6 
 
 
219 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2786  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.02 
 
 
596 aa  107  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4925  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.96 
 
 
214 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2073  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.48 
 
 
216 aa  106  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1918  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.7 
 
 
215 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.179252 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0543  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.97 
 
 
214 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6998  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.56 
 
 
216 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0176333 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1496  amino acid ABC transporter permease  32.56 
 
 
216 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6333  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.56 
 
 
216 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.200705  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2219  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.46 
 
 
596 aa  107  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.118848  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2075  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.14 
 
 
219 aa  106  3e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.280824 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0715  amino acid ABC transporter, permease protein  32.11 
 
 
216 aa  106  3e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.303684  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3974  amino acid ABC transporter permease  29.19 
 
 
219 aa  106  3e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0732034  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3672  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.84 
 
 
216 aa  105  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3311  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.11 
 
 
218 aa  105  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4063  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.11 
 
 
216 aa  105  4e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0771  amino acid ABC transporter, permease protein  34.91 
 
 
214 aa  105  4e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0879  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.76 
 
 
218 aa  105  5e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0962107  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3991  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
215 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.841796  normal  0.133123 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5538  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.68 
 
 
219 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.172396 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6713  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  30.09 
 
 
218 aa  104  9e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1657  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 
223 aa  103  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000259788  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3467  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.91 
 
 
217 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5260  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.68 
 
 
219 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.571687  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0919  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.32 
 
 
230 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.737973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0909  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.48 
 
 
218 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436863  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3669  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.99 
 
 
217 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0934  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.3 
 
 
218 aa  103  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.080844  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0163  amino acid ABC transporter permease  35.95 
 
 
214 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.784261  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5543  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.38 
 
 
219 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.468657 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3188  amino acid ABC transporter, permease protein  35.76 
 
 
217 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3953  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  28.84 
 
 
243 aa  102  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.801361  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.29 
 
 
216 aa  102  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1923  amino acid ABC transporter permease/periplasmic protein  28.37 
 
 
714 aa  102  4e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.132292  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3327  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.76 
 
 
217 aa  102  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1510  ABC transporter membrane spanning protein  32.87 
 
 
219 aa  102  5e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5247  amino acid ABC transporter, permease protein  30.23 
 
 
215 aa  102  5e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0014  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.71 
 
 
217 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.792397  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0019  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.71 
 
 
217 aa  102  5e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3474  amino acid ABC transporter permease  33.33 
 
 
216 aa  102  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6679  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.71 
 
 
215 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3249  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.87 
 
 
218 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.862152  normal  0.352927 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3447  amino acid ABC transporter permease  35.58 
 
 
217 aa  100  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1431  amino acid ABC transporter permease  34.62 
 
 
230 aa  100  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.39353  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0123  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.25 
 
 
321 aa  101  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.37 
 
 
492 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0342  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.52 
 
 
219 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5771  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.72 
 
 
273 aa  100  1e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000135375 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3154  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.5 
 
 
229 aa  100  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0975784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>