More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0662 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0662  SugE protein  100 
 
 
222 aa  441  1e-123  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0288  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  87.84 
 
 
222 aa  393  1e-109  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4584  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.3 
 
 
225 aa  253  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000898191  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0691  conserved hypothetical protein, ABC transporter, His/Glu/Gln/Arg/opine family (permease protein)  54.67 
 
 
219 aa  250  1e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.446042  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1541  ABC-type amino acid transport system, permease component  55.25 
 
 
225 aa  243  1.9999999999999999e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00154011  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0518  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  58.33 
 
 
218 aa  235  3e-61  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.776955  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1471  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  57.87 
 
 
218 aa  235  4e-61  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000381865  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0493  His/Glu/Gln/Arg/opine ABC transporter permease  57.94 
 
 
218 aa  234  7e-61  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000976702  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2671  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.42 
 
 
225 aa  220  9.999999999999999e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000364543  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0092  amino acid ABC transporter permease  48.2 
 
 
224 aa  217  1e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0446  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  47.95 
 
 
225 aa  207  7e-53  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.95928  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1541  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  54.41 
 
 
218 aa  193  1e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00385329  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0226  amino acid ABC transporter permease  41.23 
 
 
209 aa  175  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.466164  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3084  glutamine/glutamate ABC transporter, permease protein  41.83 
 
 
219 aa  174  8e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.14393  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0120  ABC-type amino acid transport system, permease component  49.54 
 
 
226 aa  174  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5220  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  40.2 
 
 
219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0463  amino acid ABC transporter, permease  44.29 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2943  amino acid ABC transporter permease  42.31 
 
 
219 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.627929  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0611  amino acid ABC transporter, permease protein  42.92 
 
 
217 aa  168  5e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000123395  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2440  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.68 
 
 
219 aa  112  5e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.221978  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4703  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.66 
 
 
492 aa  111  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0710  amino acid ABC transporter, permease protein  33.65 
 
 
214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0553  glutamine ABC transporter permease  33.65 
 
 
214 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000165212  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0343  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.26 
 
 
216 aa  109  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0325  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.26 
 
 
216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1031  amino acid ABC transporter permease  33.68 
 
 
214 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00000917559  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1052  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.3 
 
 
218 aa  108  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.233768  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0609  amino acid ABC transporter permease  33.65 
 
 
214 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00355475  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0554  glutamine ABC transporter permease  33.65 
 
 
214 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.282364  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0642  amino acid ABC transporter permease  33.65 
 
 
214 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00728334  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0699  amino acid ABC transporter, permease protein  33.65 
 
 
214 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3977  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.86 
 
 
213 aa  106  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.734464  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3128  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.88 
 
 
222 aa  106  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0272486 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0555  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.33 
 
 
214 aa  106  3e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4660  amino acid ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 
214 aa  106  4e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.084926  hitchhiker  1.97521e-21 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2155  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.01 
 
 
234 aa  105  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.164337 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0678  amino acid ABC transporter, permease protein  33.17 
 
 
214 aa  105  5e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5543  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.63 
 
 
219 aa  104  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.468657 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0123  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.2 
 
 
321 aa  104  9e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2030  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.43 
 
 
598 aa  104  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0310843  hitchhiker  0.00101821 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1027  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.29 
 
 
223 aa  104  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0543  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.39 
 
 
214 aa  103  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2808  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.68 
 
 
216 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0886  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.83 
 
 
210 aa  103  3e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000283425  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0447  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.28 
 
 
216 aa  102  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1466  glutamine ABC transporter, glutamine-binding protein/permease protein  29.49 
 
 
727 aa  102  5e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1707  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.17 
 
 
219 aa  101  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3974  amino acid ABC transporter permease  31.91 
 
 
219 aa  102  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0732034  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5267  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.11 
 
 
219 aa  101  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.316086  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2430  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  29.67 
 
 
216 aa  101  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.891065  normal  0.0353371 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1515  ABC polar amino acid transporter inner membrane protein  31.88 
 
 
216 aa  100  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00992032  normal  0.124762 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2765  amino acid ABC transporter permease  31.55 
 
 
596 aa  100  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0342  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.46 
 
 
219 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1045  polar amino acid ABC transporter inner membrane subunit  30.81 
 
 
216 aa  100  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6679  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.02 
 
 
215 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1657  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  33.02 
 
 
223 aa  99  5e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000259788  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4925  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.7 
 
 
214 aa  99  5e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0469  ectoine/hydroxyectoine ABC transporter, permease protein EhuC  30.95 
 
 
216 aa  99  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3108  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.09 
 
 
214 aa  98.2  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0531  ABC-type amino acid transport system, permease component  30.95 
 
 
216 aa  98.2  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0001634 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2777  amino acid ABC transporter, permease protein  30.24 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.449808  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0905  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  34.63 
 
 
218 aa  97.8  1e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5461  amino acid ABC transporter permease  30.84 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5260  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.24 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.571687  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3209  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.33 
 
 
216 aa  97.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0716  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.92 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.267737  normal  0.0337978 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1570  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.05 
 
 
219 aa  97.4  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.324967 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4135  ABC transporter permease  27.83 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3474  amino acid ABC transporter permease  34.42 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4063  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.48 
 
 
216 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1461  ABC-type amino acid transport system, periplasmic and permease components  30.7 
 
 
736 aa  97.1  2e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1092  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.19 
 
 
227 aa  96.3  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.972278  normal  0.0193849 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3164  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.22 
 
 
493 aa  96.7  3e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.296252  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5538  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.78 
 
 
219 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.172396 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1833  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  30.1 
 
 
224 aa  96.3  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.355125  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0771  amino acid ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 
214 aa  95.9  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.199916  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0598  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  32.87 
 
 
510 aa  95.5  5e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1631  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.39 
 
 
227 aa  95.9  5e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0751  ABC-type amino acid transport system, permease and periplasmic component  28.17 
 
 
545 aa  95.5  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0389728  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1057  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  31.9 
 
 
216 aa  95.9  5e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000168875  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4548  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.78 
 
 
219 aa  95.5  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000215  amino acid ABC transporter permease protein  30.58 
 
 
265 aa  95.5  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0927  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  26.67 
 
 
250 aa  95.1  7e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0060542  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0998  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  26.67 
 
 
250 aa  95.1  7e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0474623  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47950  ABC transporter permease  27.83 
 
 
214 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.274179  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3090  amino acid ABC transporter permease  28.29 
 
 
220 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5771  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.17 
 
 
273 aa  95.1  8e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000135375 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3669  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  35.71 
 
 
217 aa  94.4  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101493  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0019  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.08 
 
 
217 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2505  amino acid ABC transporter permease  29.76 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0032626  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6713  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  28.91 
 
 
218 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0014  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.08 
 
 
217 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.792397  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2219  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  29.91 
 
 
596 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.118848  normal  0.796256 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1503  amino acid ABC transporter permease  35 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1933  ABC-type amino acid transport system, permease component  29.36 
 
 
219 aa  93.6  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0997  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  28.84 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.43087  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0926  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  28.84 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0138002  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0895  amino acid ABC transporter, permease protein PEB1  28.84 
 
 
219 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.121462  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1887  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  27.31 
 
 
273 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1460  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  28.99 
 
 
268 aa  92.8  4e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>