227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2024 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2024  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  100 
 
 
237 aa  473  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0155981  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1564  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  66.11 
 
 
237 aa  312  3.9999999999999997e-84  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00909837  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1016  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  54.29 
 
 
245 aa  239  4e-62  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  52.94 
 
 
233 aa  224  1e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0750065  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0674  ribosomal RNA large subunit methyltransferase, FtsJ family  48.15 
 
 
240 aa  209  3e-53  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1081  hemolysin A  48.24 
 
 
253 aa  208  6e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0691  hemolysin A  47.45 
 
 
253 aa  207  1e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1370  hemolysin A  49.17 
 
 
238 aa  206  2e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0616  hemolysin A  48.24 
 
 
253 aa  205  5e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.516871  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1343  hemolysin A  46.64 
 
 
236 aa  180  1e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.070329  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1124  hemolysin A  39.06 
 
 
310 aa  158  9e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2951  hemolysin A  38.79 
 
 
269 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2995  hemolysin A  38.79 
 
 
269 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0689354  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2966  hemolysin A  38.79 
 
 
269 aa  158  9e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.173623 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  44.98 
 
 
267 aa  157  2e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  44.98 
 
 
267 aa  157  2e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  39.22 
 
 
268 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  40 
 
 
268 aa  153  2e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  39.66 
 
 
252 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  38.16 
 
 
266 aa  149  5e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  37 
 
 
264 aa  148  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0443  hemolysin A  42.6 
 
 
246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0606544  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0688  hemolysin A  40.35 
 
 
263 aa  146  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000097723  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  37.55 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  40.95 
 
 
282 aa  146  3e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  38.91 
 
 
277 aa  146  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3290  hemolysin A  38.7 
 
 
269 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  39.04 
 
 
250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1138  hemolysin A  36.91 
 
 
249 aa  142  4e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.768192  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3012  hemolysin A  36.91 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1541  hemolysin A  40.81 
 
 
266 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  38.05 
 
 
250 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1510  hemolysin A  42.29 
 
 
271 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  39 
 
 
257 aa  139  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0782  hemolysin A  38.7 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.705494  normal  0.486416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4680  hemolysin A  37.99 
 
 
250 aa  138  7e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.640566  normal  0.901974 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  37.35 
 
 
252 aa  138  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  39.47 
 
 
255 aa  138  7.999999999999999e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  38.17 
 
 
257 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4074  hemolysin A  36.52 
 
 
272 aa  136  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198624  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14230  hemolysin A  37.77 
 
 
280 aa  136  3.0000000000000003e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  38.56 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3027  hemolysin A  36.44 
 
 
266 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1155  hemolysin A  38.22 
 
 
367 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  36.48 
 
 
269 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0042  hemolysin A  34.2 
 
 
246 aa  135  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0545179  normal  0.765072 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  36.64 
 
 
267 aa  134  8e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.68471 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  40 
 
 
268 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  38.43 
 
 
249 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  37.08 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4828  hemolysin A  37.61 
 
 
249 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596006 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0702  hemolysin A  38.6 
 
 
243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0548  hemolysin A  35.37 
 
 
253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  37.39 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0583  hypothetical protein  36.44 
 
 
270 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0653  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  35.29 
 
 
273 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1020  hemolysin A  37.05 
 
 
246 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1420  hemolysin A  38.89 
 
 
227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581192  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0183  hemolysin A  38.77 
 
 
248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  37 
 
 
240 aa  130  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_12600  predicted protein  38.33 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.78844 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  42.11 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4439  hemolysin A  38.14 
 
 
272 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.104243 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2371  hemolysin A  38.1 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.114514 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  35.34 
 
 
285 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  40.62 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0852  hemolysin A  37.96 
 
 
244 aa  129  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349901  normal  0.605509 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  40.23 
 
 
270 aa  129  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4163  hemolysin A  40.76 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  35.75 
 
 
246 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  36.64 
 
 
253 aa  128  6e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  36.09 
 
 
274 aa  128  7.000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2828  hemolysin A  35.15 
 
 
275 aa  128  7.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  35.56 
 
 
252 aa  128  7.000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6058  hemolysin A  36.55 
 
 
272 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0736  hemolysin A  37.5 
 
 
252 aa  128  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  35.87 
 
 
251 aa  128  9.000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5441  hemolysin A  36.09 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3916  regulatory protein, DeoR  37.87 
 
 
262 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00126237  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0907  hemolysin A  38.08 
 
 
270 aa  127  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3862  hemolysin A  35.27 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.199718 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2480  hemolysin A  36.18 
 
 
279 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127708  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1397  hemolysin A  38.43 
 
 
276 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4682  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  36.11 
 
 
263 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.558879  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3836  hemolysin A  36.48 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.63638 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  40.22 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  34.96 
 
 
248 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  38.84 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0935  hemolysin A  39.19 
 
 
264 aa  126  3e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  38.84 
 
 
266 aa  126  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13650  predicted rRNA methylase  34.32 
 
 
281 aa  126  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3486  hemolysin A  39.51 
 
 
252 aa  125  4.0000000000000003e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.72701  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0556  hemolysin A  38.1 
 
 
272 aa  125  5e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1825  hemolysin A  37.44 
 
 
242 aa  125  7e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0615885  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  35.96 
 
 
245 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2383  hemolysin A  33.91 
 
 
271 aa  125  8.000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2302  hemolysin A  35.9 
 
 
316 aa  124  9e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  36.13 
 
 
270 aa  124  9e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2620  hemolysin A  36.16 
 
 
264 aa  124  1e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2357  hemolysin A  34.91 
 
 
276 aa  124  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347309  normal  0.0122275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>