214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1016 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1016  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  100 
 
 
245 aa  479  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1564  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  53.88 
 
 
237 aa  239  4e-62  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00909837  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2024  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  54.29 
 
 
237 aa  239  4e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0155981  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0674  ribosomal RNA large subunit methyltransferase, FtsJ family  52.02 
 
 
240 aa  227  1e-58  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1111  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  53.78 
 
 
233 aa  216  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0750065  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0691  hemolysin A  48.45 
 
 
253 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0616  hemolysin A  48.06 
 
 
253 aa  206  3e-52  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.516871  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1081  hemolysin A  47.08 
 
 
253 aa  204  9e-52  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1370  hemolysin A  43.03 
 
 
238 aa  178  9e-44  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.700808  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1343  hemolysin A  46.52 
 
 
236 aa  177  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.070329  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1902  hemolysin A  35.11 
 
 
281 aa  134  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.485461  hitchhiker  0.0000215916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2828  hemolysin A  33.85 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0248084  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0443  hemolysin A  40 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0606544  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1239  hemolysin A  38.55 
 
 
267 aa  129  3e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1216  hemolysin A  38.55 
 
 
267 aa  129  3e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000350473  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1138  hemolysin A  33.6 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.768192  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2034  hemolysin A  33.89 
 
 
266 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3843  RNA-binding S4 domain protein  35.16 
 
 
285 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16680  hemolysin A  38.34 
 
 
267 aa  127  2.0000000000000002e-28  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.252362 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11709  cytotoxin|haemolysin tlyA  34.23 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.198254  normal  0.144006 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1515  hemolysin A  32.54 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000301327 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1601  rRNA methylase  40.08 
 
 
278 aa  126  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6058  hemolysin A  34.66 
 
 
272 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164066  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4074  hemolysin A  33.33 
 
 
272 aa  125  6e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0198624  normal  0.017914 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1516  hemolysin A  33.33 
 
 
270 aa  125  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.559805  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0798  putative rRNA methylase  36.95 
 
 
257 aa  125  7e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2013  hemolysin A  32.54 
 
 
269 aa  125  7e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478155 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1124  hemolysin A  33.2 
 
 
310 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1911  hemolysin A  33.86 
 
 
281 aa  124  1e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.258384 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2357  hemolysin A  32.02 
 
 
276 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0347309  normal  0.0122275 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1657  hemolysin A  32.41 
 
 
286 aa  122  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0477677  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2951  hemolysin A  33.2 
 
 
269 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.781583  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2383  hemolysin A  32.41 
 
 
271 aa  122  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2995  hemolysin A  33.2 
 
 
269 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0689354  normal  0.521171 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2966  hemolysin A  33.2 
 
 
269 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.173623 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0901  hemolysin A  32.94 
 
 
269 aa  122  6e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000212028  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0956  hemolysin A  36.73 
 
 
277 aa  121  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2480  hemolysin A  32.94 
 
 
279 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.127708  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2510  hemolysin A  35.06 
 
 
266 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000179539  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1580  hemolysin A  35.63 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1247  hemolysin A  32.93 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.68471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3290  hemolysin A  32.81 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2654  hemolysin A  36.08 
 
 
257 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1180  hemolysin A  38.14 
 
 
273 aa  119  3e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000850767  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13650  predicted rRNA methylase  31.35 
 
 
281 aa  119  4.9999999999999996e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1289  hemolysin A  38.33 
 
 
269 aa  119  6e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.403831  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22150  hemolysin A  31.87 
 
 
318 aa  118  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.324984  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1419  hemolysin A  35.15 
 
 
240 aa  118  9e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0561  hemolysin A  34.82 
 
 
248 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.613541 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3149  hemolysin A  32.79 
 
 
270 aa  117  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.074979  normal  0.927501 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1455  hemolysin A  32.8 
 
 
265 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0732885  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0992  hemolysin A  33.86 
 
 
263 aa  116  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4468  hemolysin A  33.86 
 
 
252 aa  116  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.660096  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0893  hemolysin A  38.65 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00179005  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4439  hemolysin A  32 
 
 
272 aa  115  3.9999999999999997e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.114534  normal  0.104243 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6777  hemolysin A  36.08 
 
 
282 aa  116  3.9999999999999997e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1147  hemolysin A  34.89 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0318  hemolysin A  33.07 
 
 
264 aa  115  5e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.996063 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2669  hemolysin A  36.44 
 
 
251 aa  115  6e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.116474  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3509  hemolysin A  32.3 
 
 
268 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0906767 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1340  hemolysin A  33.46 
 
 
348 aa  115  7.999999999999999e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0688  hemolysin A  35.8 
 
 
263 aa  115  8.999999999999998e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00000097723  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3012  hemolysin A  31.52 
 
 
265 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4361  hemolysin A  35.57 
 
 
266 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1813  hemolysin A  34.17 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.841717 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06540  hemolysin A  38.84 
 
 
272 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000376214  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1899  hemolysin A  40.3 
 
 
270 aa  113  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000632481  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1045  hemolysin A  32.58 
 
 
252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.285224  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1079  hemolysin A  34.98 
 
 
268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000241342  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4423  hemolysin A  35.18 
 
 
266 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.145715 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0086  hemolysin A  35.32 
 
 
246 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.162277  normal  0.205136 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0827  hemolysin A  37.6 
 
 
270 aa  113  3e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2477  putative rRNA methylase  37.18 
 
 
245 aa  113  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382282  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0491  hemolysin A  33.99 
 
 
251 aa  113  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.191939  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4311  hemolysin A  32.54 
 
 
250 aa  113  3e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0672112  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4307  hemolysin A  35.62 
 
 
246 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0679  ribosomal RNA large subunit methyltransferase J  34.01 
 
 
267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0444  hemolysin A  38.57 
 
 
253 aa  112  5e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631909  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1058  rRNA methylase  32.95 
 
 
252 aa  112  6e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00176712  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3160  hemolysin A  32.12 
 
 
291 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0320918  normal  0.452346 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5441  hemolysin A  32.03 
 
 
268 aa  112  7.000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.368507  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0907  hemolysin A  34.66 
 
 
270 aa  112  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2704  hemolysin A  36.99 
 
 
249 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14230  hemolysin A  31.75 
 
 
280 aa  111  1.0000000000000001e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0377174  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0852  hemolysin A  39.09 
 
 
244 aa  110  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.349901  normal  0.605509 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0928  hypothetical protein  46.01 
 
 
268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0454  hemolysin A  35.11 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3487  hemolysin A  35.55 
 
 
269 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000887252  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3080  hemolysin A  33.74 
 
 
287 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0718  hemolysin A  35.29 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0184  hemolysin A  32.82 
 
 
273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0994  hemolysin A  35.25 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.199053  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1028  hemolysin A  35 
 
 
274 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3711  hemolysin A  34 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1926  hemolysin A  34.11 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.645328  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18631  rRNA methyltransferase  35.25 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.281535  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0490  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  28.85 
 
 
358 aa  110  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0118  ribosomal RNA methyltransferase RrmJ/FtsJ  32.45 
 
 
302 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0891926 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2037  hemolysin A  33.6 
 
 
250 aa  110  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00330226  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25470  hemolysin A  32.16 
 
 
276 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>